版块导航
正在加载中...
客户端APP下载
论文辅导
调剂小程序
登录
注册
帖子
帖子
用户
本版
24小时热门版块排行榜
>
虫友互识
(293)
>
导师招生
(166)
>
文献求助
(124)
>
硕博家园
(94)
>
考研
(71)
>
考博
(67)
>
博后之家
(52)
>
休闲灌水
(49)
>
招聘信息布告栏
(37)
>
教师之家
(31)
>
公派出国
(29)
>
论文投稿
(28)
>
论文道贺祈福
(27)
>
基金申请
(27)
>
找工作
(21)
>
SciFinder/Reaxys
(16)
申请当版主
|
存档区
|
应助排行
|
模拟EPI排行
小木虫论坛-学术科研互动平台
»
计算模拟区
»
分子模拟
»
Gromacs/Amber/NAMD
订阅
管理团队
(金币库
69399.5
充值
)
主管区长:
月只蓝
小红豆
主管版主:
abinitio
沙漠猎人
杰出贡献者
专家顾问:
pigrass
oxox6085
lsloneil
brucefan
jerkwin
荣誉版主:
wuli8
lei0736
nono2009
fegg7502
ghcacj
zzy870720z
uuv2010
御剑江湖
yjcmwgk
jiaoyixiong
cenwanglai
ben_ladeng
ljw4010
荣誉成员:
余泽成
2848
28/29
首页
上一页
24
25
26
27
28
29
下一页
全部
专家会诊
MS
LAMMPS/DL_POLY
Gromacs/Amber/NAMD
DS/Sybyl/Autodock
Monte Carlo
ME/Gulp
Hyperchem
CPMD/CP2K
资源
其他
版务
回帖排序
发表排序
刷新页面
|
交流
|
求助
|
资源
精华区
作者
最后发表
[
热点
]
为什么中国大学工科教授们水了那么多所谓的顶会顶刊,但还是做不出宇树机器人?
欢乐颂叶蓁
2026-02-25
刚刚
[
Gromacs
]
【求助】如何看dna结构
(评阅+1)
(0/1197)
astringent
2010-10-20
2010-10-20 02:05:07
by
astringent
[
Gromacs
]
【求助】请教vmd语言tcl的问题
(1/706)
luokei
2010-10-19
2010-10-19 20:23:25
by
bay__gulf
[
Gromacs
]
【求助】xleap 中去除model 中某个残基上的原子
(评阅+1)
(1/331)
zhulijuan001
2010-10-18
2010-10-19 15:51:43
by
zhulijuan001
[
Gromacs
]
【求助】用gromacs固定蛋白质主链能量最小化
(0/281)
jackwangee
2010-10-11
2010-10-11 15:00:31
by
jackwangee
[
Gromacs
]
【讨论】(急!!)如何用AMBER模拟RNA/DNA,关键是怎么处理输入文件!!
(评阅+1)
(3/1686)
vip_zzc
2010-10-06
2010-10-10 15:33:42
by
夏天的鱼
[
Gromacs
]
【求助】最小化方法的选择
(评阅+1)
(4/573)
zhulijuan001
2010-10-07
2010-10-08 08:42:20
by
zhulijuan001
[
Gromacs
]
【求助】请问谁有GROMOS96的学习材料
(3/666)
dolphin618
2010-09-01
2010-10-07 08:00:09
by
dolphin618
[
Gromacs
]
【求助】md出错了,怎么办?
(评阅+1)
(1/507)
astringent
2010-09-28
2010-10-06 12:01:33
by
liqingwen
[
Gromacs
]
【求助】用Amber处理小分子的问题
(评阅+2)
(1/270)
zhj10.26
2010-10-03
2010-10-04 17:10:36
by
zhj10.26
[
Gromacs
]
【原创】【求助】desmong做p450的动力学出现了问题
(评阅+1)
(0/243)
jhonsmith001
2010-09-30
2010-09-30 19:05:30
by
jhonsmith001
[
Gromacs
]
【求助】Gromacs 教程上speptide 运行不了
(7/869)
ptf1242
2010-09-30
2010-09-30 13:43:41
by
ptf1242
[
Gromacs
]
【求助】amber计算纳米碳管体系
(2/612)
上书房行走
2010-09-13
2010-09-30 11:15:51
by
zh1987hs
[
Gromacs
]
【求助】求金属离子的参数
(4/1533)
donglh
2010-08-20
2010-09-28 04:58:45
by
gzgzgz
[
Gromacs
]
【求助】namd出错 DIDN'T FIND vdW PARAMETER
(1/1569)
574384607
2010-08-07
2010-09-27 21:48:49
by
liqingwen
[
Gromacs
]
【求助】求助Gromacs膜蛋白模拟的操作过程
(评阅+1)
(1/333)
Jfreda
2010-09-25
2010-09-27 15:44:58
by
zhlrui
[
Gromacs
]
【求助】文献提到smd,力加在Cβ in Cys12原子上是什么意思
(0/531)
luokei
2010-09-27
2010-09-27 09:25:47
by
luokei
[
Gromacs
]
【求助】用gromacs怎么将两个轨迹文件整合为一个文件来做rmsd分析?
(评阅+1)
(0/1448)
pickle116
2010-09-26
2010-09-26 09:42:56
by
pickle116
[
Gromacs
]
【求助】如何提高GPU在NAMD中的使用占有率
(评阅+1)
(0/476)
pickle116
2010-09-25
2010-09-25 12:42:26
by
pickle116
[
Gromacs
]
【求助】怎么算呢?
(2/317)
memgr
2010-09-16
2010-09-25 09:32:32
by
memgr
[
Gromacs
]
【讨论】请问大家模拟以后有实验佐证吗
(8/1100)
ptf1242
2010-09-23
2010-09-24 20:09:38
by
tjegg
[
Gromacs
]
【求助】amber功能探讨
(评阅+1)
(9/1584)
夏天的鱼
2010-09-10
2010-09-21 16:06:53
by
夏天的鱼
[
Gromacs
]
【求助】amber最小化输入请教
(评阅+1)
(0/285)
夏天的鱼
2010-09-21
2010-09-21 15:10:53
by
夏天的鱼
[
Gromacs
]
【求助】amber 求助
(金币≥10)
(1/58)
jiayuxiang
2010-09-20
2010-09-20 10:21:39
by
jerryking
[
Gromacs
]
【求助】OXT问题
(评阅+1)
(0/614)
tingjun
2010-09-16
2010-09-16 22:42:12
by
tingjun
[
Gromacs
]
【求助】是否有影响呢?
(评阅+1)
(0/198)
memgr
2010-09-16
2010-09-16 11:08:21
by
memgr
[
Gromacs
]
【求助】histo-clust是什么意思
(评阅+1)
(4/734)
memgr
2010-09-12
2010-09-13 15:12:01
by
memgr
[
Gromacs
]
【求助】AMBER ATP
(评阅+1)
(1/559)
tingjun
2010-09-08
2010-09-11 08:36:58
by
tingjun
[
Gromacs
]
【原创】一些简单的MD的代码学习
(评阅+10)
(0/340)
zyj8119
2010-09-10
2010-09-10 17:02:10
by
zyj8119
[
Gromacs
]
【求助】诡异的轨迹输出
(评阅+1)
(0/378)
memgr
2010-09-09
2010-09-09 19:17:20
by
memgr
[
Gromacs
]
【求助成功】自己建了一个GRO FILE,运行的时候出现这个问题
(3/535)
zyj8119
2010-04-08
2010-09-09 08:27:26
by
zyj8119
[
Gromacs
]
【求助】请问磷脂双层结构要怎么构建?
(3/683)
夏天的鱼
2010-09-07
2010-09-08 16:44:12
by
夏天的鱼
[
Gromacs
]
【求助】蛋白分子加脂层
(5/518)
夏天的鱼
2010-09-06
2010-09-08 14:40:24
by
夏天的鱼
[
Gromacs
]
【求助】pdb里面缺一个残基,请求帮助
(评阅+1)
(1/363)
z5476t4508
2010-08-29
2010-09-08 12:57:17
by
pickle116
[
Gromacs
]
【转帖】gromacs 4.5 for MS windows
(1/616)
linxi1454
2010-09-03
2010-09-07 19:54:13
by
wulie0411
[
Gromacs
]
【求助】NAMD进行恒温压缩的过程中,原子速度过大,怎么解决?
(2/565)
yylww
2010-09-05
2010-09-05 19:11:12
by
manutdhk
[
Gromacs
]
【求助】弱弱地问一句:CASP模拟出来的pdb文件与www.pdb.org中的pdb文件是否一样
(0/472)
nufang19a
2010-09-05
2010-09-05 09:47:07
by
nufang19a
[
Gromacs
]
【求助】namd文献中提到做体系模拟前,先要relax the system,这里的relax指的是min还
(1/378)
luokei
2010-09-04
2010-09-04 18:04:57
by
yahoohoo
[
Gromacs
]
【求助】有关namd
(0/256)
astringent
2010-09-04
2010-09-04 15:12:18
by
astringent
[
Gromacs
]
【求助】amber10安装,有关MKL和blas库的疑问
(3/1010)
petersen
2010-09-03
2010-09-03 17:24:00
by
zhuhongaaa
[
Gromacs
]
【求助】动力学能量优化的问题!
(1/576)
gytjyb
2010-08-31
2010-09-03 16:27:45
by
夏天的鱼
[
Gromacs
]
【求助】could not find angle parameter
(0/847)
zhulijuan001
2010-08-31
2010-08-31 17:11:41
by
zhulijuan001
[
Gromacs
]
【求助】怎么把VMD的MD结果做成动画形式
(1/1641)
dpwei
2010-08-28
2010-08-28 12:36:10
by
bay__gulf
[
Gromacs
]
【求助】怎样限定两个原子之间的距离
(1/1013)
patent
2010-08-18
2010-08-20 21:36:28
by
红枫叶688
[
Gromacs
]
【求助】prodrug生成的小分子的itp参数文件中为什么没有非健参数
(2/383)
donglh
2010-08-19
2010-08-20 16:27:58
by
donglh
[
Gromacs
]
【求助】ubuntu10.04 装不上xleap
(0/1018)
z5476t4508
2010-08-17
2010-08-17 15:40:16
by
z5476t4508
[
Gromacs
]
【求助】大家帮忙看看是否达到了平衡了
(0/496)
gytjyb
2010-08-16
2010-08-16 11:12:13
by
gytjyb
[
Gromacs
]
【求助】水的扩散系数计算
(0/3231)
maad
2010-08-10
2010-08-10 14:24:25
by
maad
[
Gromacs
]
【求助】NAMD安装问题
(0/377)
我为量化狂
2010-08-09
2010-08-09 19:59:54
by
我为量化狂
[
Gromacs
]
【求助】有没有dna库啊?
(
1
2
)
(12/1388)
574384607
2010-07-13
2010-08-07 10:21:08
by
zhuhongaaa
[
Gromacs
]
【求助】请教pgn文件的问题
(0/342)
astringent
2010-08-07
2010-08-07 03:39:43
by
astringent
[
Gromacs
]
【求助】生成一定碱基数dna,用那个软件
(1/573)
574384607
2010-08-04
2010-08-04 17:06:25
by
52841503
[
Gromacs
]
【求助】出错了!!!!
(1/244)
memgr
2010-08-03
2010-08-03 20:55:33
by
52841503
[
Gromacs
]
【求助】add solvent box问题
(2/353)
574384607
2010-08-01
2010-08-02 11:02:57
by
574384607
[
Gromacs
]
【求助】出错了!!!!
(2/1027)
memgr
2010-08-01
2010-08-01 16:19:32
by
memgr
[
Gromacs
]
【讨论】想做有机溶剂分子模型!
(3/793)
gxsulong
2010-07-29
2010-07-31 13:06:05
by
qasd
[
Gromacs
]
【求助】tinker
(3/874)
lan626
2010-06-22
2010-07-30 23:54:26
by
truewz
[
Gromacs
]
【求助】金属离子-力常数的计算
(金币≥5)
(2/62)
ope123456789
2010-07-24
2010-07-30 16:52:40
by
superdirac
[
Gromacs
]
【求助】amber中计算结合自由能时可以并行运算吗
(7/1037)
gjj09
2010-06-17
2010-07-29 20:17:58
by
lan626
[
Gromacs
]
【求助】请问怎么可以分析残基与残基之间的相互作用
(2/973)
vallen
2010-07-06
2010-07-29 16:17:22
by
Eroica3139
[
Gromacs
]
【求助】ptraj能计算两个苯平面间的角度吗
(2/745)
Eroica3139
2010-07-26
2010-07-29 16:14:00
by
Eroica3139
[
Gromacs
]
【求助】计算结构大小
(1/509)
memgr
2010-07-21
2010-07-28 17:07:52
by
itismineok
[
Gromacs
]
【求助】Amber中蛋白质最小化
(2/578)
夏天的鱼
2010-07-21
2010-07-27 22:01:49
by
夏天的鱼
[
Gromacs
]
【求助】vmd生成psf文件问题
(1/794)
zjm022243
2010-07-26
2010-07-27 09:39:01
by
zjm022243
[
Gromacs
]
【求助】amber出错
(3/452)
夏天的鱼
2010-07-22
2010-07-27 08:20:58
by
夏天的鱼
[
Gromacs
]
【求助】急需
(0/198)
memgr
2010-07-26
2010-07-26 15:11:33
by
memgr
[
Gromacs
]
【求助】mm_pbsa计算
(3/1106)
z6242948
2009-09-26
2010-07-26 14:12:37
by
Eroica3139
[
Gromacs
]
【求助】MMPBSA/GBSA
(4/1856)
tingjun
2010-06-22
2010-07-26 14:05:47
by
Eroica3139
[
Gromacs
]
【求助】请问Amber是不是不能做含金属的体系
(2/408)
ter20
2010-07-22
2010-07-25 21:01:16
by
ter20
[
Gromacs
]
【求助】使用AFM时,在x方向可以拉动,但在z方向却不行!
(1/398)
zzhwise
2010-05-12
2010-07-22 13:03:35
by
fangxingbaixue
[
Gromacs
]
【求助】NAMD中压强所产生力的方向?
(1/553)
jianchaoyv
2010-07-14
2010-07-14 21:06:51
by
wally8962
[
Gromacs
]
【求助】PDB文件的处理
(
1
2
)
(13/3080)
licaiqin
2010-04-26
2010-07-08 11:12:50
by
ope123456789
[
Gromacs
]
【求助】amber跑MD时如何限定两个原子之间距离
(2/1193)
futing1229
2010-07-06
2010-07-07 16:37:50
by
sinokang
[
Gromacs
]
【求助】请问这个模型用NAMD怎么画
(6/955)
zjm022243
2010-07-05
2010-07-06 21:40:54
by
zyj8119
[
Gromacs
]
【求助】vmd spc 水
(1/576)
574384607
2010-07-01
2010-07-06 16:28:53
by
574384607
[
Gromacs
]
【求助】结果分析
(5/872)
licaiqin
2010-04-06
2010-07-05 15:00:32
by
licaiqin
[
Gromacs
]
[关贴]
【求助】amber11分享
(7/720)
linxi1454
2010-05-28
2010-07-05 09:27:17
by
linxi1454
[
Gromacs
]
【求助】有关gromacs得两个问题
(
1
2
)
(10/1653)
zh1987hs
2010-06-19
2010-07-04 13:28:36
by
zh1987hs
[
Gromacs
]
【求助】ptraj进行氢键分析时出现error
(3/718)
z6242948
2009-09-21
2010-07-02 18:15:23
by
zhuzhilin
[
Gromacs
]
【求助】打扰各位前辈了
(1/367)
ff860102
2010-07-01
2010-07-01 15:49:06
by
sinokang
[
Gromacs
]
【求助】轨迹文件格式转化问题
(3/1643)
baoer3808
2010-06-24
2010-07-01 13:50:08
by
clark_zhy
[
Gromacs
]
【求助】在AMBER中,如何得到药物和酶之间相互作用的势能的数据
(2/585)
vallen
2010-06-28
2010-07-01 13:15:11
by
clark_zhy
[
Gromacs
]
【求助】只是优化后文件,没有restart文件,能继续跑吗
(
1
2
3
)
(22/2423)
574384607
2010-06-21
2010-07-01 08:50:51
by
574384607
[
Gromacs
]
【求助】如何在Suse linux 下装Amber 10
(0/307)
sunnybomb
2010-06-30
2010-06-30 11:20:38
by
sunnybomb
[
Gromacs
]
【分享】分子模拟中的力场选择
(12/607)
leejie666
2009-07-04
2010-06-30 09:37:58
by
navycheer
[
Gromacs
]
【讨论】关于不同z值处的水能形成氢键数的脚本讨论
(评阅+2)
(4/1681)
jianchaoyv
2010-06-29
2010-06-29 15:05:34
by
bay__gulf
[
Gromacs
]
【求助】.dcd和.coor文件到底哪个是坐标文件
(1/1133)
574384607
2010-06-28
2010-06-28 12:34:15
by
coolrainbow
[
Gromacs
]
【求助】周期边界条件设定
(
1
2
)
(10/1932)
574384607
2010-06-27
2010-06-28 12:29:00
by
coolrainbow
[
Gromacs
]
【求助】电子云密度模拟
(0/370)
bfh
2010-06-27
2010-06-27 20:51:40
by
bfh
[
Gromacs
]
【求助】关于NAMD的.conf问题
(2/397)
jianchaoyv
2010-06-25
2010-06-26 08:46:19
by
jianchaoyv
[
Gromacs
]
【求助】怎么看力场文件?
(2/2289)
jianchaoyv
2010-06-23
2010-06-24 09:22:34
by
bay__gulf
[
Gromacs
]
【讨论】请教一下amber里面如何处理非标准核酸
(0/261)
jissrain
2010-06-23
2010-06-23 10:52:54
by
jissrain
[
Gromacs
]
【求助】有人模拟过电泳吗
(9/1513)
574384607
2010-06-01
2010-06-23 09:53:24
by
gzgzgz
[
Gromacs
]
【求助】求教NAMD的DCD轨迹合并问题
(2/811)
zh1987hs
2010-05-04
2010-06-23 09:50:42
by
gzgzgz
[
Gromacs
]
【求助】用gromacs计算自由能
(1/1192)
sunxiuchan
2010-06-21
2010-06-21 14:51:32
by
zhuhongaaa
[
Gromacs
]
【求助】SHAKE算法那篇文献果然是经典文献
(8/1472)
coolrainbow
2010-05-26
2010-06-18 16:34:36
by
老虎大王
[
Gromacs
]
【求助】请问gromacs并行命令
(4/1338)
patent
2010-06-14
2010-06-16 17:08:13
by
xiaowu759
[
Gromacs
]
【求助】产生psf文件的问题
(2/506)
baoer3808
2010-06-13
2010-06-13 15:20:47
by
baoer3808
2848
28/29
首页
上一页
24
25
26
27
28
29
下一页
相关版块跳转
第一性原理
量子化学
计算模拟
分子模拟
仿真模拟
程序语言
查看
最后发表
发贴时间
按降序排列
按升序排列