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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » Gromacs/Amber/NAMD » 【求助】出错了！！！！
北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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memgr

铜虫 (正式写手)

[交流] 【求助】出错了！！！！ 已有2人参与

我在用gromacs跑动力学时 出下下面的错误：
Warning: Only triclinic boxes with the first vector parallel to the x-axis and the second vector in the xy-plane are supported.
         Box (3x3):
            Box[    0]={         nan,          nan,          nan}
            Box[    1]={         nan,          nan,          nan}
            Box[    2]={         nan,          nan,          nan}
         Can not fix pbc.
Fatal error:
Number of grid cells is zero. Probably the system and box collapsed.
我想问一下各位高手这什么意思？怎么回事啊？应该怎么干啊？谢谢各位
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1楼 2010-08-01 15:34:45
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qasd

木虫 (著名写手)
★
lei0736(金币+1):谢谢 2010-08-01 16:00:42
初态或力场参数不合理
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2楼2010-08-01 15:40:33
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memgr

铜虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by qasd at 2010-08-01 15:40:33:
初态或力场参数不合理

可是 我这参数跑过别的体系，只是把里面的溶质的一部分换掉就不行了，这是问什么呢
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3楼2010-08-01 16:19:32
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