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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » Gromacs/Amber/NAMD » 【求助】amber10安装，有关MKL和blas库的疑问
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petersen

金虫 (小有名气)

[交流] 【求助】amber10安装，有关MKL和blas库的疑问

amber安装，老生常谈的问题，网上的安装教程更是铺天盖地，但是从没遇到一个教程照此安装会一帆风顺的。
网上主流的安装方法是安装好ifort，mk，mpichl，设置好路径路径后安装amber，但是每次到调用mkl的时候就会出现库里缺少libmkl_ia32.a和libmkl_lapack.a，（看到过一个帖子是说要修改makefile里面的内容将其指定到blas中来解决这个问题，不想尝试了），还要修改config.h和config_amber.h里面的内容，不仅麻烦而且错误不断，编译amber根本就通不过。当我改用amber里面默认数据库blas库时，什么东西不需改，安装起来通畅无阻，安装完amber，测试也只有少量的possible failure.
我的疑问是，既然采用blas库安装如此简单，而网上普遍都采用MKL库，那肯定是MKL较blas有优势吧？是不是调用MKL效率更高呢？菜鸟提问，希望前辈们能都回答！
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1楼 2010-09-03 10:13:22
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zhuhongaaa

金虫 (正式写手)
★ ★
ghcacj(金币+2):谢谢 2010-09-03 12:03:12
引用回帖:
Originally posted by petersen at 2010-09-03 10:13:22:
amber安装，老生常谈的问题，网上的安装教程更是铺天盖地，但是从没遇到一个教程照此安装会一帆风顺的。
网上主流的安装方法是安装好ifort，mk，mpichl，设置好路径路径后安装amber，但是每次到调用mkl的时候就会 ...

我参照网上教程和自身实践的结果。欢迎去看，祝你好运。
http://varmilion.tk/?p=112
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分子模拟的主页http://varmilion.tk/
2楼2010-09-03 11:33:02
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petersen

金虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by zhuhongaaa at 2010-09-03 11:33:02:

我参照网上教程和自身实践的结果。欢迎去看，祝你好运。
http://varmilion.tk/?p=112

你压根就没回答我的问题！。。。。。。。。。
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3楼2010-09-03 14:14:39
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zhuhongaaa

金虫 (正式写手)
★
ghcacj(金币+1):谢谢 2010-09-04 09:04:17
引用回帖:
Originally posted by petersen at 2010-09-03 14:14:39:

你压根就没回答我的问题！。。。。。。。。。

那我回答你吧，intel提供的库的效率从来都是最高的。
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分子模拟的主页http://varmilion.tk/
4楼2010-09-03 17:24:00
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