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上书房行走

铁虫 (小有名气)

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[交流] 【求助】amber计算纳米碳管体系

请问大家还知道 amber软件来计算包含纳米碳管的软件的时候
是如何处理纳米碳管的top文件的啊

tleap一处理纳米管的pdb文件就自动加H了哇哇

我该怎么办啊～～～

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1楼 2010-09-13 12:06:10

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dreamtrace

金虫 (初入文坛)

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★ ★
zh1987hs(金币+2):谢谢 2010-09-30 11:02:55

说实话，我还没有遇到用Amber做纳米器件研究的。
参数如何而来，准确度如何保证问题很棘手啊。

如果要做材料的分子模拟，我认为你可以试试Scigress软件（曾用名 Material Explorer）

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2楼2010-09-30 10:59:58

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zh1987hs

金虫 (著名写手)

分子模拟新手

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专业: 环境生物物理

★ ★
ghcacj(金币+2):谢谢 2010-09-30 14:25:07

引用回帖:

Originally posted by dreamtrace at 2010-09-30 10:59:58:
说实话，我还没有遇到用Amber做纳米器件研究的。
参数如何而来，准确度如何保证问题很棘手啊。

如果要做材料的分子模拟，我认为你可以试试Scigress软件（曾用名 Material Explorer）

呵呵~可惜这个软件还是商业软件啊~有没有免费的软件比较适合做材料模拟的？

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3楼2010-09-30 11:15:51

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