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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » Gromacs/Amber/NAMD » 【求助】amber计算纳米碳管体系
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上书房行走

铁虫 (小有名气)

[交流] 【求助】amber计算纳米碳管体系

请问大家还知道 amber软件 来计算包含纳米碳管的软件的时候
是如何处理纳米碳管的top文件的啊

tleap一处理纳米管的pdb文件 就自动加H了 哇哇

我该怎么办啊 ～～～
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1楼 2010-09-13 12:06:10
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dreamtrace

金虫 (初入文坛)
★ ★
zh1987hs(金币+2):谢谢 2010-09-30 11:02:55
说实话，我还没有遇到用Amber做纳米器件研究的。
参数如何而来，准确度如何保证问题很棘手啊。

如果要做材料的分子模拟，我认为你可以试试Scigress软件 （曾用名 Material Explorer）
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2楼2010-09-30 10:59:58
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zh1987hs

金虫 (著名写手)

分子模拟新手
★ ★
ghcacj(金币+2):谢谢 2010-09-30 14:25:07
引用回帖:
Originally posted by dreamtrace at 2010-09-30 10:59:58:
说实话，我还没有遇到用Amber做纳米器件研究的。
参数如何而来，准确度如何保证问题很棘手啊。

如果要做材料的分子模拟，我认为你可以试试Scigress软件 （曾用名 Material Explorer）

呵呵~可惜这个软件还是商业软件啊~有没有免费的软件比较适合做材料模拟的？
赞一下(1人) 回复此楼
3楼2010-09-30 11:15:51
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