| 查看: 974 | 回复: 3 | |||
lan626银虫 (正式写手)
|
[交流]
【求助】tinker 已有3人参与
|
| 求助高手，我最近在学习模拟软件tinker，请问tinker有什么基本的功能？怎么计算自由能？我看到大多数人都在用gromacs，gromacs和tinker那个更好用，对于初学者来说。谢谢 |
回复此楼» 猜你喜欢
关于filecode，很负责任的告诉大家
已经有7人回复
-
【2027博士申请】纳米药物递送方向
已经有5人回复
-
关于豆爷回答的JTJC与%2F数量
已经有7人回复
-
2026国自然放榜时间
已经有3人回复
-
国基金的申报应该改成非等额制，评价高的钱多评价低的钱少，但是增加资助率
已经有7人回复
-
好奇怪的filecode
已经有4人回复
-
售SCI文章，我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急
已经有4人回复
-
售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急
已经有4人回复
-
售SCI文章，我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急
已经有4人回复
-
售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急
已经有5人回复
lan626
银虫 (正式写手)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 1484.9
- 散金: 73
- 红花: 1
- 帖子: 311
- 在线: 105小时
- 虫号: 950418
- 注册: 2010-01-29
- 专业: 理论与计算
2楼2010-07-30 08:26:23
cnlics
木虫 (小有名气)
- 应助: 2 (幼儿园)
- 金币: 3014.2
- 红花: 4
- 帖子: 270
- 在线: 422.4小时
- 虫号: 795158
- 注册: 2009-06-16
- 性别: GG
- 专业: 当代宗教
3楼2010-07-30 08:46:14
truewz
至尊木虫 (文坛精英)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 9664.8
- 散金: 820
- 红花: 3
- 沙发: 1
- 帖子: 12261
- 在线: 943小时
- 虫号: 89626
- 注册: 2005-08-29
- 专业: 凝聚态物性I:结构、力学和
★
lan626(金币+1):谢谢参与
lan626(金币+1):谢谢参与
| TINKER包含多种算法：较通常方法快的新型距离-结构度量化方法，Elber的反应路径方法，用于全局优化的几种势能曲面平滑和寻找(PSS)方法，高效的势能曲面扫描程序，基于原子多极的静电偶极极化率，用几种不同的广义Born (GB/SA)模型进行连续的溶剂处理，高效简化的Newton (TNCG)定位优化程序，表面面积和体积，简单的自由能微扰工具，简正模式分析，直角坐标最小值，扭转或刚体空间，速率Verlet随机动力学，改善的球面能量截断方法，用于部分电荷的粒子网格Ewald总和，用于极化多极矩的常规Ewald总和，最新的长程静电反应场处理方法，模拟退火，构像寻找，MD的Andersen随机碰撞恒温，等等。 |
4楼2010-07-30 23:54:26
