24小时热门版块排行榜    

查看: 719  |  回复: 3

z6242948

木虫 (小有名气)

[交流] 【求助】ptraj进行氢键分析时出现error 已有1人参与

最近想分析一下模拟的复合物中的氢键情况,准备好输入文件,运行,没过多长时间就出现如下错误:ERROR in safe_malloc: Error in alloc of 1391936616 bytes 开始我认为是轨迹文件过大或要分析的氢键配受体过多,于是只输入一部分轨迹文件分析,又出现:segment fault  各位做氢键分析时有碰到此种情况吗?如何处理呢?和cpu占用有无关系?我在分析时还运行其他程序,cpu占用为100%左右,谢谢

[ Last edited by lei0736 on 2009-11-24 at 19:36 ]
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

nkyx

铁杆木虫 (正式写手)

★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
yjcmwgk(金币+1,VIP+0):感谢提供思考方向 9-21 22:15
你不会是分析体系内所有的氢键吧?
选择你感兴趣的几组去分析。
2楼2009-09-21 17:58:48
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

z6242948

木虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by nkyx at 2009-9-21 17:58:
你不会是分析体系内所有的氢键吧?
选择你感兴趣的几组去分析。

呵呵,还真是打算全分析,实在不行的话只能局部分析了
3楼2009-09-23 10:02:59
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhuzhilin

新虫 (初入文坛)

可能是in文件写得有问题
4楼2010-07-02 18:15:23
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 z6242948 的主题更新
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 环境工程调剂 +3 大可digkids 2026-03-16 3/150 2026-03-16 09:09 by DDDddddmm
[考研] 0703化学调剂,求各位老师收留 +7 秋有木北 2026-03-14 7/350 2026-03-15 17:30 by 小物理化学
[考研] 22408总分284求调剂 +3 InAspic 2026-03-13 3/150 2026-03-15 11:10 by zhq0425
[考研] 289求调剂 +5 步川酷紫123 2026-03-11 5/250 2026-03-15 00:45 by kruisytel
[考研] 267一志愿南京工业大学0817化工求调剂 +5 SUICHILD 2026-03-12 5/250 2026-03-14 14:53 by jean5056
[考研] 085600求调剂 +3 a邵星池 2026-03-09 3/150 2026-03-14 01:32 by JourneyLucky
[考研] 一志愿郑大070303,338分,求调剂 +4 dadawaf 2026-03-10 5/250 2026-03-14 01:20 by lsw010101
[考研] 0703求调剂 +7 jtyq001 2026-03-10 7/350 2026-03-14 01:06 by JourneyLucky
[考研] b区环境工程求调剂 +4 Maps1 2026-03-10 6/300 2026-03-14 00:23 by JourneyLucky
[考研] 0856材料与化工301求调剂 +5 奕束光 2026-03-13 5/250 2026-03-13 22:00 by 星空星月
[考研] 332求调剂 +3 Zz版 2026-03-13 3/150 2026-03-13 20:36 by 18595523086
[考研] 【考研调剂求收留】 +3 Ceciilia 2026-03-11 3/150 2026-03-13 20:18 by JourneyLucky
[考研] 材料工程调剂 +4 咪咪空空 2026-03-11 4/200 2026-03-13 19:57 by JourneyLucky
[考研] 求调剂 +3 程雨杭 2026-03-12 3/150 2026-03-13 15:06 by JourneyLucky
[考研] 304求调剂(085602一志愿985) +12 化工人999 2026-03-09 12/600 2026-03-13 12:02 by JourneyLucky
[考研] 0856化工原理 +6 z2839474511 2026-03-10 6/300 2026-03-13 10:41 by houyaoxu
[考研] 341求调剂 +4 捣蛋猪猪 2026-03-11 4/200 2026-03-12 14:47 by ruiyingmiao
[考研] 085600 材料与化工 295 求调剂 +10 dream…… 2026-03-10 12/600 2026-03-12 13:46 by dream……
[考博] 读博申请 +5 感dd 2026-03-10 7/350 2026-03-11 17:02 by QGZDSYS
[考博] 26申博求助 +3 跳跃饼干 2026-03-10 4/200 2026-03-10 21:15 by Tntcnn
信息提示
请填处理意见