24小时热门版块排行榜    

查看: 703  |  回复: 1

linxi1454

银虫 (正式写手)

[交流] 【转帖】gromacs 4.5 for MS windows 已有1人参与

将fftw-3.2.2.pl1-dll32目录和gromacs-4.5-win的bin目录放入环境变量PATH即可(用户或系统环境变量均可)。
例如:PATH=D:\Research\Gromacs\wincmake\gromacs-4.5-win\bin;D:\Research\Gromacs\wincmake\fftw-3.2.2.pl1-dll32;

编译
vc2008
gromacs-4.5 final
cmake
fftw-3.2.2
libxml2
iconv

关于速度,随便找了个程序测了一下
linux双核并行            ~2.14h/ns
windows双线程并行      ~2.50h/ns
windows下也没有慢太多,慢可能是1)VC慢, 2)MPI可能会快;有兴趣的可以试下

ps: windows下这个速度分析数据没问题

download link:http://www.brsbox.com/filebox/do ... d9698cb3a3f20724592

批处理脚本
1)setv.bat
@echo off
set path=%path%;%cd%\gromacs-4.5-win\bin;%cd%\fftw-3.2.2.pl1-dll32;

2) run-gmx.bat
@echo off
cmd /k %cd%\setv.bat

update: 9.2  gmx4.5.1只修正了cmake的问题,我在编译之前已将cmake的bug修正  

from: http://www.mdbbs.org/thread-28518-1-1.html
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wulie0411

木虫 (小有名气)

★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
这个是分子模拟论坛里面的吧
2楼2010-09-07 19:54:13
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 linxi1454 的主题更新
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
信息提示
请填处理意见