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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » Gromacs/Amber/NAMD » 【转帖】gromacs 4.5 for MS windows
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linxi1454

银虫 (正式写手)

[交流] 【转帖】gromacs 4.5 for MS windows已有1人参与

将fftw-3.2.2.pl1-dll32目录和gromacs-4.5-win的bin目录放入环境变量PATH即可（用户或系统环境变量均可）。
例如：PATH=D:\Research\Gromacs\wincmake\gromacs-4.5-win\bin;D:\Research\Gromacs\wincmake\fftw-3.2.2.pl1-dll32;

编译
vc2008
gromacs-4.5 final
cmake
fftw-3.2.2
libxml2
iconv

关于速度，随便找了个程序测了一下
linux双核并行            ~2.14h/ns
windows双线程并行      ~2.50h/ns
windows下也没有慢太多，慢可能是1）VC慢， 2）MPI可能会快；有兴趣的可以试下

ps: windows下这个速度分析数据没问题

download link：http://www.brsbox.com/filebox/do ... d9698cb3a3f20724592

批处理脚本
1）setv.bat
@echo off
set path=%path%;%cd%\gromacs-4.5-win\bin;%cd%\fftw-3.2.2.pl1-dll32;

2) run-gmx.bat
@echo off
cmd /k %cd%\setv.bat

update: 9.2  gmx4.5.1只修正了cmake的问题，我在编译之前已将cmake的bug修正  

from: http://www.mdbbs.org/thread-28518-1-1.html
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1楼2010-09-03 00:59:57
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wulie0411

木虫 (小有名气)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
这个是分子模拟论坛里面的吧
赞一下(1人) 回复此楼
2楼2010-09-07 19:54:13
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