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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » MS » 用MS中的Forcite计算冰，结果发现温度波动异常的大，感觉像做周期性的震荡衰减
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wenyu4

新虫 (初入文坛)

[求助] 用MS中的Forcite计算冰，结果发现温度波动异常的大，感觉像做周期性的震荡衰减

用MS中Forcite模块做水的第一原理分子动力学模拟，力场为COMPASS27，系综为NPT,温度设为250K,模拟的步长为0.5fs，时间为30fs，结果发现在温度基本在200-320k之间震荡，请教各位高人，这会是什么原因？对了，还有体系的大小为92个水分子。还有请教一下怎么统计水分子中O-H的距离，和O-O的距离，非常谢谢。
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湘潭大学学子
1楼 2012-02-05 17:43:45
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xujc1983

木虫 (著名写手)

苦逼青椒一枚

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
御剑江湖(金币+2): 谢谢 2012-02-06 20:42:28
30fs的模拟时长？这个模拟时间太短了
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2楼2012-02-06 14:31:20
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wenyu4

新虫 (初入文坛)
不好意思，这个时间应该是30Ps，写错了，
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湘潭大学学子
3楼2012-02-06 14:40:10
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wenyu4

新虫 (初入文坛)
★ ★ ★
御剑江湖(金币+3): 谢谢 2012-02-06 20:42:16
后面我把时间加长到100ps，步长还是0.5fs，发现温度倒是在250K左右震荡，但是能量感觉一直波动很多，我不知道是我的体系选择太小了，还是怎么回事，求高人指点
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湘潭大学学子
4楼2012-02-06 14:57:32
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huweny87

木虫 (小有名气)
个人觉得可能是分子数目太少，统计性不够，温度是一个统计量，因此波动比较大
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少年心事当拏雲，谁念幽寒坐呜呃？
5楼2012-03-01 20:54:57
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fangjx05

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

92个水分子，温度概念都不成立嘛
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good good study ,dayday up
6楼2013-06-01 00:00:25
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abinitio

版主 (著名写手)

【答案】应助回帖

forcite也可以应用周期性边界条件吧，所以分子数应该差别不大，我怀疑是不是力场的问题？lz可以试个别的力场或再延长时间
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7楼2013-06-01 06:25:17
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