24小时热门版块排行榜    

查看: 3168  |  回复: 12

shiyiwenren

至尊木虫 (著名写手)

[交流] 【求助成功】MS模拟MCM-41过程中forcite filed计算的问题 已有7人参与

我在利用MS模拟MCM-41的过程中碰到一个问题,那就是在对其进行力场优化时,我设置的优化步数的2百万步,但是通常在算到几百步的时候便停止了,而返回的优化时能量的变化曲线和status中优化后的总能量又不相符(注:由于是第一次用MS做结构模拟,所以在优化中我用的是软件中自带的Dreiding力场,对其中的力场参数也基本没做修改)。为了更直观的说明,给出我做的过程的一些截图:

这张图是我构建好的MCM-41的孔道结构
之后我给MCM-41的三种元素(SI、O、H)赋上文献里的电荷值,最后统计这个超晶胞的总电荷为-0.0028e。在电荷赋好之后我并对其进行力场优化。优化时的一些过程和参数设置为:

在Task边上的more选项里的设置为:

点击energy选项,其设置为:

在forcefiled边上More选项里的设置为:

Van der Waals边上more的选项的设置为:



而后,我设置后运算的服务器,上传到服务器上进行计算,但是在计算了两百步左右后就显示完成了,得到的结果为:


而status文件中给出的数据为:

希望有高手帮我看看,在哪些地方我弄错了,谢谢

[ Last edited by shiyiwenren on 2010-9-13 at 10:49 ]
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

高分子学习--qlh

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

longweig

金虫 (小有名气)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
送红花一朵
请问楼主问题是怎么解决的呢?
12楼2013-10-04 15:53:42
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通回帖

qasd

木虫 (著名写手)

shiyiwenren(金币+1): 2010-04-15 14:21
用经典分子动力学优化晶体?目的是啥?这个优化绝对用不了二百万步
2楼2010-04-14 21:51:50
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

shiyiwenren

至尊木虫 (著名写手)

引用回帖:
Originally posted by qasd at 2010-04-14 21:51:50:
用经典分子动力学优化晶体?目的是啥?这个优化绝对用不了二百万步

我做的MCM-41是利用软件里的无定形SO2构建的超晶胞在上面挖孔做出来的,这种做肯定会是与实际不符合的,所以要用力场优化。而至于优化步数,就算不要那么多步,在结果返回的结果也不对啊
3楼2010-04-15 14:20:24
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

franch

版主 (著名写手)

不理解,,,,顶一下。。
遇弱则弱
4楼2010-04-21 14:53:55
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

suan3585

铜虫 (初入文坛)

想问问你 MCM-41 的模型是怎么建的啊? 在MS里面有直接的模型吗?
5楼2010-04-29 17:01:05
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

shiyiwenren

至尊木虫 (著名写手)

引用回帖:
Originally posted by suan3585 at 2010-04-29 17:01:05:
想问问你 MCM-41 的模型是怎么建的啊? 在MS里面有直接的模型吗?

没有的,要自己在无定形SIO2里挖孔获得的
6楼2010-04-30 10:08:38
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

sunhao123

禁虫 (小有名气)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
本帖内容被屏蔽

7楼2012-04-02 22:24:06
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

shiyiwenren

至尊木虫 (著名写手)

引用回帖:
19929834楼: Originally posted by sunhao123 at 2012-04-02 22:24:06:
lz,弱弱的问一句,用哪个工具可以实现在分子筛上挖孔,新手,这个比较急,希望不吝赐教

你是要挖什么样的孔,是圆柱形的吗?如果是的话用MS就可以的
8楼2012-04-03 19:52:46
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

sunhao123

禁虫 (小有名气)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
本帖内容被屏蔽

9楼2012-04-03 20:02:05
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

shiyiwenren

至尊木虫 (著名写手)

引用回帖:
19929858楼: Originally posted by sunhao123 at 2012-04-03 20:02:05:
我打算挖个圆柱形的,刚学习,不知道怎么弄,很尴尬,你方便给我截个图看看嘛,万分感谢

你可以看下这个帖子,是讲MCM-41建模的,是我们组一个师兄写的,可能能帮到你
http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=2400976

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

10楼2012-04-04 19:44:56
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 shiyiwenren 的主题更新
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 一志愿985,本科211,0817化学工程与技术319求调剂 +3 Liwangman 2026-03-15 3/150 2026-03-15 18:16 by JourneyLucky
[考研] 中科大材料与化工319求调剂 +3 孟鑫材料 2026-03-14 3/150 2026-03-14 20:10 by ms629
[考研] 材料与化工 323 英一+数二+物化,一志愿:哈工大 本人本科双一流 +4 自由的_飞翔 2026-03-13 5/250 2026-03-14 19:39 by hmn_wj
[考研] 2026考研调剂+本科延边大学+山东大学+生物化学与分子生物学+有项目经验 +3 ccdsscjy 2026-03-09 6/300 2026-03-14 02:14 by JourneyLucky
[考研] 调剂 +3 13853210211 2026-03-10 3/150 2026-03-14 00:47 by JourneyLucky
[考研] 材料工程,326分,求调剂 +6 KRSLSR 2026-03-10 6/300 2026-03-13 23:47 by JourneyLucky
[考研] 材料371求调剂 +9 鳄鱼? 2026-03-11 11/550 2026-03-13 22:53 by JourneyLucky
[考研] 求调剂(材料与化工327) +4 爱吃香菜啦 2026-03-11 4/200 2026-03-13 22:11 by JourneyLucky
[考研] 085600调剂 +5 漾漾123sun 2026-03-12 5/250 2026-03-13 22:06 by 星空星月
[考研] 材料工程调剂 +9 咪咪空空 2026-03-12 9/450 2026-03-13 22:05 by 星空星月
[考研] 求材料调剂 085600英一数二总分302 前三科235 精通机器学习 一志愿哈工大 +4 林yaxin 2026-03-12 4/200 2026-03-13 22:04 by 星空星月
[考研] 四川大学085601材料工程专硕 初试294求调剂 +4 祝我们好在冬天 2026-03-11 4/200 2026-03-13 21:39 by peike
[考研] 26调剂/材料科学与工程/总分295/求收留 +9 2026调剂侠 2026-03-12 9/450 2026-03-13 20:46 by 18595523086
[考研] 求调剂 +7 18880831720 2026-03-11 7/350 2026-03-13 16:10 by JourneyLucky
[考研] 26考研求调剂 +5 丶宏Sir 2026-03-13 5/250 2026-03-13 13:05 by JourneyLucky
[考研] 材料专硕274一志愿陕西师范大学求调剂 +4 薛云鹏 2026-03-13 4/200 2026-03-13 10:40 by 学员8dgXkO
[考研] 290求调剂 +3 ADT 2026-03-13 3/150 2026-03-13 10:19 by peike
[考研] 一志愿河海大学085900土木水利专硕279求调剂不挑专业 +4 SunWwWwWw 2026-03-10 8/400 2026-03-13 02:23 by SunWwWwWw
[考研] 420求调剂 +4 莫向外求11 2026-03-10 6/300 2026-03-12 14:41 by ruiyingmiao
[考研] 327分求调剂086 +4 西红柿?小帅 2026-03-09 7/350 2026-03-10 14:47 by ruiyingmiao
信息提示
请填处理意见