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shiyiwenren

至尊木虫 (著名写手)

[交流] 【求助成功】MS模拟MCM-41过程中forcite filed计算的问题 已有7人参与

我在利用MS模拟MCM-41的过程中碰到一个问题,那就是在对其进行力场优化时,我设置的优化步数的2百万步,但是通常在算到几百步的时候便停止了,而返回的优化时能量的变化曲线和status中优化后的总能量又不相符(注:由于是第一次用MS做结构模拟,所以在优化中我用的是软件中自带的Dreiding力场,对其中的力场参数也基本没做修改)。为了更直观的说明,给出我做的过程的一些截图:

这张图是我构建好的MCM-41的孔道结构
之后我给MCM-41的三种元素(SI、O、H)赋上文献里的电荷值,最后统计这个超晶胞的总电荷为-0.0028e。在电荷赋好之后我并对其进行力场优化。优化时的一些过程和参数设置为:

在Task边上的more选项里的设置为:

点击energy选项,其设置为:

在forcefiled边上More选项里的设置为:

Van der Waals边上more的选项的设置为:



而后,我设置后运算的服务器,上传到服务器上进行计算,但是在计算了两百步左右后就显示完成了,得到的结果为:


而status文件中给出的数据为:

希望有高手帮我看看,在哪些地方我弄错了,谢谢

[ Last edited by shiyiwenren on 2010-9-13 at 10:49 ]
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shiyiwenren

至尊木虫 (著名写手)

引用回帖:
19929834楼: Originally posted by sunhao123 at 2012-04-02 22:24:06:
lz,弱弱的问一句,用哪个工具可以实现在分子筛上挖孔,新手,这个比较急,希望不吝赐教

你是要挖什么样的孔,是圆柱形的吗?如果是的话用MS就可以的
8楼2012-04-03 19:52:46
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qasd

木虫 (著名写手)

shiyiwenren(金币+1): 2010-04-15 14:21
用经典分子动力学优化晶体?目的是啥?这个优化绝对用不了二百万步
2楼2010-04-14 21:51:50
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shiyiwenren

至尊木虫 (著名写手)

引用回帖:
Originally posted by qasd at 2010-04-14 21:51:50:
用经典分子动力学优化晶体?目的是啥?这个优化绝对用不了二百万步

我做的MCM-41是利用软件里的无定形SO2构建的超晶胞在上面挖孔做出来的,这种做肯定会是与实际不符合的,所以要用力场优化。而至于优化步数,就算不要那么多步,在结果返回的结果也不对啊
3楼2010-04-15 14:20:24
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franch

版主 (著名写手)

不理解,,,,顶一下。。
遇弱则弱
4楼2010-04-21 14:53:55
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