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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » Gromacs/Amber/NAMD » 【求助】prodrug生成的小分子的itp参数文件中为什么没有非健参数
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donglh

银虫 (小有名气)

[交流] 【求助】prodrug生成的小分子的itp参数文件中为什么没有非健参数

我用prodrug生成了小分子的itp参数文件，但是里面只有小分子的健参数，没有非健参数，那么小分子蛋白之间的非健作用力是怎么计算的？
    另外，谁能给我解释一下小分子的itp文件中各部分的含义？
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1楼 2010-08-19 10:09:50
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sijifengsd

银虫 (小有名气)

呵呵

★
donglh(金币+5):谢谢参与
这个问题比较难，需要仔细阅读Gromacs的说明书才行，上面有详细的讲解怎么设置参数
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似水年华
2楼2010-08-20 16:25:20
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donglh

银虫 (小有名气)

问题已经解决

上面的问题已经解决，小分子的非健参数都在GROMACS的安装文件ffgmx.itp中
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3楼2010-08-20 16:27:58
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