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donglh

银虫 (小有名气)

[交流] 【求助】prodrug生成的小分子的itp参数文件中为什么没有非健参数

我用prodrug生成了小分子的itp参数文件,但是里面只有小分子的健参数,没有非健参数,那么小分子蛋白之间的非健作用力是怎么计算的?
    另外,谁能给我解释一下小分子的itp文件中各部分的含义?
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donglh

银虫 (小有名气)

问题已经解决

上面的问题已经解决,小分子的非健参数都在GROMACS的安装文件ffgmx.itp中
3楼2010-08-20 16:27:58
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sijifengsd

银虫 (小有名气)

呵呵


donglh(金币+5):谢谢参与
这个问题比较难,需要仔细阅读Gromacs的说明书才行,上面有详细的讲解怎么设置参数
似水年华
2楼2010-08-20 16:25:20
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