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ter20

铁杆木虫 (正式写手)

[交流] 【求助】请问Amber是不是不能做含金属的体系 已有2人参与

想模拟金表面的肽链的行为,不知道Amber能不能处理金原子?谢谢!
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ope123456789

铜虫 (小有名气)

★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
雪狼乖乖(金币+3):谢谢 2010-07-24 23:44:25
能,不过非常难做,你要计算金与有机原子连接时的力常数,还有金原子的范德华半径,还有附近分子的resp电荷,之后你才能生成拓扑文件用于下一步计算
生命在于运动
2楼2010-07-24 22:25:45
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ter20

铁杆木虫 (正式写手)

引用回帖:
Originally posted by ope123456789 at 2010-07-24 22:25:45:
能,不过非常难做,你要计算金与有机原子连接时的力常数,还有金原子的范德华半径,还有附近分子的resp电荷,之后你才能生成拓扑文件用于下一步计算

非常感谢,最后还是打算用MS的cvff力场做了
3楼2010-07-25 21:01:16
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