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574384607

银虫 (小有名气)

[交流] 【求助】add solvent box问题 已有2人参与

extensions下有个add solvent box,我想给我的体系加个周期性水盒子
我是这样做的,先将体系的psf、pdb文件导入,有add solvent box进行solvent设置,我只是在box padding设置的min、max,别的默认,生成了一个solvent。和psf、pdb文件,但是我单独打开solvent文件时,发现只是一个水盒子,原来的分子体系并没有包含在其中
我想请教,这样做哪里出了错?
是不是应该把原来的分子和水盒子进行合并?
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夏天的鱼

木虫 (小有名气)


ghcacj(金币+1):谢谢 2010-08-02 08:55:06
574384607(金币+1): 2010-08-02 11:01:27
我觉得你应该在vmd里打开看一下
科研就是讨论出来的
2楼2010-08-02 08:46:27
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574384607

银虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by 夏天的鱼 at 2010-08-02 08:46:27:
我觉得你应该在vmd里打开看一下

我已经在vmd中打开看了,我今天看了好像是o位出了问题,还没改改看
3楼2010-08-02 11:02:57
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