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kjxyzxh001

铜虫 (小有名气)

[求助] 提取的质粒跑出四条或者五条带,但酶切后只有一条带,是不是我的质粒污染了 已有1人参与

各位大虫,小弟最近扩增质粒,出现了怪现象,我的质粒转化的DH5a,挑取单克隆,再摇菌,提取质粒,跑胶发现质粒有很多条带,四条或者五条,就算是有超螺旋的和线性的,算起来也只有三条,不可能有四五条啊。我用BamH1 酶切(只有一个酶切位点),发现只有一条带。用EcoR1 酶切(只有一个酶切位点),也是一条带,用Sal 1 酶切(该质粒中无此酶酶切位点),发现切不开,条带和跑质粒一样。如果污染了其他质粒的话,用三种酶至少应该有个酶能切开污染的质粒吧,但都没发现杂带。如果没有污染其他质粒的话,质粒跑出来最多也是三条带啊,我这怎么出现了四五条。纠结啊…………,请各位给指点一二!
图片中 P:质粒,大约5000bp。
       Bam:BamH1酶切质粒
       Sal:    Sal1 酶切质粒
       Eco:EcoR1酶切的质粒
两个方框是单独挑取的两个菌落分别提的质粒。最左边和中间的是Marker5000。

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酶切专家

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
从你的描述来看,不应该是污染,就是你制备质粒时不小心(没有严格按照试剂盒的建议,该轻柔的就该轻柔),导致质粒中包含多种形式,其实,这种情况比较常见,但也意味着你的质量不太好。
6楼2012-04-10 20:28:06
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kjxyzxh001

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
5楼: Originally posted by 小婧子zj at 2012-04-10 17:08:29:
单酶切的话,不应该大小一样吗?为啥你的酶切条带大小不一样呢?

方框里面是同一个质粒酶切的,BamH1 和EcoR1 条带大小是一直的
7楼2012-04-11 19:51:37
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普通回帖

kjxyzxh001

铜虫 (小有名气)

图中质粒的泳道,能明显看出五条带啊(箭头指示)
2楼2012-04-10 11:30:43
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atlanticwi

金虫 (正式写手)

琴美喜欢发呆 不喜欢发脾气


西瓜: 金币+1, 鼓励交流 2012-04-10 18:37:35
嗯...............
我也有跑出来五条带过,怀疑是提质粒时,gDNA污染,不过也觉得没有关系,转化时gDNA又不会转进去,况且后面还要再鉴定,你拿三个内切酶去做了鉴定,我这么干的话要是偶老板知道了....下场就惨了,所以个人看法,没有其他质粒污染的。
祝实验顺利 若有说错希望高手指点
Let God do with it as He wills
3楼2012-04-10 11:41:00
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kjxyzxh001

铜虫 (小有名气)

呵呵,谢啦,实验室别的不多,内切酶还够用。请问如果是gDNA 污染的话,那么我拿这个质粒再次转化,再次提起质粒的话,会不会就会消除这些多余的带呢?
4楼2012-04-10 14:54:39
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小婧子zj

金虫 (小有名气)

单酶切的话,不应该大小一样吗?为啥你的酶切条带大小不一样呢?
5楼2012-04-10 17:08:29
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天使托

专家顾问 (职业作家)

T.Shen

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
最好的验证方法就是做一个单酶切或者双酶切。。。
Whenever,Wherever,Anyway!MustRemember:Fight!KeepFighting!NeverGiveUp!
8楼2012-04-11 20:12:36
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mlanqiang

木虫之王 (文学泰斗)

蓝博士

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
做一个单酶切或者双酶切试试看吧。
蓝精灵
9楼2012-04-11 20:43:33
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小婧子zj

金虫 (小有名气)

引用回帖:
6楼: Originally posted by 酶切专家 at 2012-04-10 20:28:06:
从你的描述来看,不应该是污染,就是你制备质粒时不小心(没有严格按照试剂盒的建议,该轻柔的就该轻柔),导致质粒中包含多种形式,其实,这种情况比较常见,但也意味着你的质量不太好。

但是两个都和质量大小不一致呀
10楼2012-04-12 10:23:08
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