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红茶小麦

新虫 (初入文坛)

[求助] 酶切后跑出的条带这个样子,是酶的问题吗 已有3人参与

一直在做克隆,好几个月了还没做出来,累觉不爱了!我先前用的内切酶是TAKARA的sfi-1 ,快速酶,说50度5分钟就能酶切完全,做了好多次,刚开始也不太明白,跑了胶一条带,以为是酶切完全了,接着做,一直是失败失败失败。。。。。。现在索性酶切过夜,出现了两条带,可是与sal 1 酶切的条带有很大区别,位置差的好远。近几天又切了一次,条带也很奇怪,望各位大神指点迷津,给我点头绪啊
第一张图片是酶切验证,左边的是sal1 切的,右边的是sfi-1切的;第二张图片是sfi-1切的

酶切后跑出的条带这个样子,是酶的问题吗
2014 4 25 pcr yz_副本.jpg


酶切后跑出的条带这个样子,是酶的问题吗-1
2014 5 2 meiqiehuishou_副本.jpg
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luwei13566

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
gyesang: 金币+5, 鼓励回帖交流! 2014-05-12 15:20:27
LZ是切的什么?基因,载体,重组质粒?用单酶切的话除非你的模板上有额外的切割位点,一般都是切出来一条带的,LZ切出来两条带本来就已经出问题了。~首先你需要筛查下你的模板上有没有额外切割位点,其次你用快切酶过夜也不对,很容易切花。
TAKARA的快切酶你可以试试37度切割,先切60min,可以拿一个带有sfi-1的质粒做对照,质粒能切开就没问题,模板添加1——2ug。
另外,LZ为什么要用单酶切克隆呢,还是buffer不兼容分步酶切?
大家相互帮助哈
2楼2014-05-12 14:42:49
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红茶小麦

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by luwei13566 at 2014-05-12 14:42:49
LZ是切的什么?基因,载体,重组质粒?用单酶切的话除非你的模板上有额外的切割位点,一般都是切出来一条带的,LZ切出来两条带本来就已经出问题了。~首先你需要筛查下你的模板上有没有额外切割位点,其次你用快切酶 ...

切得是载体,sfi-1酶切的位点是成对存在的。而且酶切的话应该不会那么完全,有两条带应该也是很正常的吧
3楼2014-05-13 10:56:29
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luwei13566

木虫 (正式写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by 红茶小麦 at 2014-05-13 10:56:29
切得是载体,sfi-1酶切的位点是成对存在的。而且酶切的话应该不会那么完全,有两条带应该也是很正常的吧...

既然你载体上有两个sfi-1位点,那就应该切出来两个啊,你看看载体的图谱如果切出的大小和图谱上一致就没问题,sal1位点也是两个吧,你sal1的两条带比sfi1的小得多啊,那很明显就是你用sfi-1没切完全,一条是线性带,一条是载体的超螺旋。一条如果切完全了两条带的大小应该正好等于你载体的大小。
大家相互帮助哈
4楼2014-05-13 13:06:58
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906394648

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
酶切温度一般不都是37度么
5楼2014-05-13 20:00:09
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kingoff999

铁虫 (初入文坛)

用快速酶的话别用takara的 takara的快速感觉是挂羊头卖狗肉 你没发现他们的快酶居然比普通酶更便宜 你可以想一下这不合理啊 用快酶用飞鱼的吧
6楼2014-05-26 09:25:07
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小9rr

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

引用回帖:
2楼: Originally posted by luwei13566 at 2014-05-12 14:42:49
LZ是切的什么?基因,载体,重组质粒?用单酶切的话除非你的模板上有额外的切割位点,一般都是切出来一条带的,LZ切出来两条带本来就已经出问题了。~首先你需要筛查下你的模板上有没有额外切割位点,其次你用快切酶 ...

应该是有2个酶切位点一般这个质粒上都是有2个酶切位点的,
7楼2018-06-23 11:33:27
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