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jackiey2

铜虫 (正式写手)

[交流] 感受态细胞提取的质粒酶解后为什么带型不一样?已有7人参与

有个问题始终想不明白
重组质粒带有氨苄抗性基因。重组质粒导入感受态细胞后铺带氨苄的平板,长出来的菌落应该都是成功摄入重组质粒的吧?挑出来若干个单菌落扩大培养后提取质粒,用限制酶进行酶切,为什么切出来的带有的还不一样呢?
新手做分子,望高手解惑,谢谢。

[ Last edited by jackiey2 on 2012-7-30 at 09:16 ]
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遗传
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dshlove

木虫 (正式写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
不知道你说的条带不一样是什么意思,不知道你用的什么酶,质粒中某种酶的酶切位点不止一个,所以有可能切出不同大小的片段
2楼2012-07-30 09:30:07
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jackiey2

铜虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by dshlove at 2012-07-30 09:30:07
不知道你说的条带不一样是什么意思,不知道你用的什么酶,质粒中某种酶的酶切位点不止一个,所以有可能切出不同大小的片段

用一种酶(KnoI),查重组质粒图谱,有两个切点。挑十个单菌落,扩大培养提质粒,用KnoI酶切,电泳条带不一样。
遗传
3楼2012-07-30 15:52:42
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dshlove

木虫 (正式写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
3楼: Originally posted by jackiey2 at 2012-07-30 15:52:42
用一种酶(KnoI),查重组质粒图谱,有两个切点。挑十个单菌落,扩大培养提质粒,用KnoI酶切,电泳条带不一样。...

你是说,你提取的十个质粒,用酶切完之后,跑胶的条带不一致?
这样情况,我建议你先把你的质粒跑胶看看,因为有时候质粒也有可能不纯,导致你后续酶切,条带不一致。
4楼2012-07-30 16:12:45
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jackiey2

铜虫 (正式写手)

引用回帖:
4楼: Originally posted by dshlove at 2012-07-30 16:12:45
你是说,你提取的十个质粒,用酶切完之后,跑胶的条带不一致?
这样情况,我建议你先把你的质粒跑胶看看,因为有时候质粒也有可能不纯,导致你后续酶切,条带不一致。...

我的质粒是经过KOD扩增出来的啊。
遗传
5楼2012-07-30 18:05:59
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chenguestc

木虫 (职业作家)

★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
小丹木木: 金币+1, 鼓励交流 2012-07-31 13:35:53
通常情况需要做的是蓝白斑筛选,但是楼主只用氨苄的情况,挑取菌落后仍需要用你自己的引物和通用引物进行菌落PCR筛选,筛选正确的克隆才用来培养。不是挑取的所有菌落都是你需要的。
6楼2012-07-30 20:36:53
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我是小纯洁

金虫 (正式写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
先进行蓝白斑筛选。
后进行菌落pcr:连接产物不会那么纯,虽然板上有斑,但是重组质粒会有大有小
7楼2012-08-01 09:42:53
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yuliansheng

金虫 (小有名气)

★ ★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
小丹木木: 金币+3, 鼓励积极应助,解答问题 2012-08-01 14:06:22
分析
问题点一:你的重组的质粒在导入感受态细胞之前,你能确定你所用的质粒和目的片段都很好的连接了吗?
问题点二:你的重组质粒在连接时,应该会有两种可能的。一是目的片段很好的连接到你所用的质粒上,得到你所要的重组质粒:二是你所用的质粒在你切完后,再用连接酶连接,质粒又发生自连。这两种质粒同时被导入感受态细胞后,你再进行验证时,会显示这两种质粒的片段大小。(而且,你的目的片段我不太了解。有时也可能发生目的片段被切后,再用连接酶进行连接时,也会发生自连。这样的话,最后的结果就有可能出现三种片段大小。)
学习....
8楼2012-08-01 11:55:54
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jackiey2

铜虫 (正式写手)

引用回帖:
8楼: Originally posted by yuliansheng at 2012-08-01 11:55:54
分析
问题点一:你的重组的质粒在导入感受态细胞之前,你能确定你所用的质粒和目的片段都很好的连接了吗?
问题点二:你的重组质粒在连接时,应该会有两种可能的。一是目的片段很好的连接到你所用的质粒上,得到你 ...

我导入感受态的质粒不是酶切后再连接的,是直接用KOD扩增,加点突变的,亲!!
遗传
9楼2012-08-01 19:15:22
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jackiey2

铜虫 (正式写手)

引用回帖:
6楼: Originally posted by chenguestc at 2012-07-30 20:36:53
通常情况需要做的是蓝白斑筛选,但是楼主只用氨苄的情况,挑取菌落后仍需要用你自己的引物和通用引物进行菌落PCR筛选,筛选正确的克隆才用来培养。不是挑取的所有菌落都是你需要的。

我只是想知道,为什么不是所有的菌落都是我需要的。按理,能在含有抗生素培养基上生长的都是成功摄入质粒的啊。而且我的质粒不是经过连接酶连接的,而是通过高保真酶扩增的。
遗传
10楼2012-08-01 19:19:25
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