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hua_geduo

木虫 (正式写手)


[交流] 转化感受态后提取质粒,测浓度总是很低

年前做表达,目的片段连接到T载体上,然后转化,挑菌,摇菌,提取质粒,测质粒浓度总是很低;现在我的表达载体量不够了,想转化后提取,使量大一点,但是发现提取后测浓度又遇到同样的状况,请问这是怎么回事啊?用的感受态是DH5α,提质粒的试剂盒是爱思进的,实验卡在这里了,急求帮助!
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玉米头

新虫 (初入文坛)


★ ★ ★
hua_geduo(金币+1): 谢谢参与
gyesang: 金币+2, 鼓励来分子生物版块发贴交流! 2013-03-19 12:22:49
我也遇到过这种情况,质粒得率低,做了好多次都是这样,你可以换成JM109的,我试过,效果很好。这可能是DH5a不大适合T载体的扩增。
3楼2013-03-19 10:31:14
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hua_geduo

木虫 (正式写手)


引用回帖:
3楼: Originally posted by 玉米头 at 2013-03-19 10:31:14
我也遇到过这种情况,质粒得率低,做了好多次都是这样,你可以换成JM109的,我试过,效果很好。这可能是DH5a不大适合T载体的扩增。

T载体克隆提质粒已经做完了,现在在做表达载体质粒的提取
6楼2013-03-19 11:50:41
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cicelyzh

铁杆木虫 (职业作家)



hua_geduo(金币+1): 谢谢参与
引用回帖:
6楼: Originally posted by hua_geduo at 2013-03-19 11:50:41
T载体克隆提质粒已经做完了,现在在做表达载体质粒的提取...

表达载体一般不如克隆载体的拷贝数高,提质粒一般浓度会小一些。你可以多摇些菌。裂解时的溶液按菌量增加,上column吸附的时候可以用同一个柱子,按常规方法elute就可以了。
9楼2013-03-19 13:16:45
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潇潇溪

新虫 (初入文坛)



小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
我之前也有过这样的情况,也是T载体,后来我就把提出的质粒(虽然浓度低,但是还是有的情况下)化转一下,再挑取单菌落提质粒,就变浓了。你可以试一下,但是个中原因我还在找。希望能帮助到你。
16楼2015-05-06 11:21:08
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普通回帖

xuchenxi121

新虫 (初入文坛)



hua_geduo(金币+1): 谢谢参与
通常不会是感受态的问题,而是提取质粒的问题,用试剂盒提取时很大可能会有质粒在柱子上洗脱不彻底的情况,因此建议可以将Elution加热后再洗脱,可显著提高得率。
2楼2013-03-19 10:23:41
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sxxuan

金虫 (著名写手)


★ ★ ★
hua_geduo(金币+1): 谢谢参与
gyesang: 金币+2, 很好的建议,鼓励交流哈! 2013-03-19 12:26:44
是先划板活化后再挑菌放大摇菌是吗?
我以前用DH5a做宿主培养提取质粒也没问题的。
会不会是你的质粒拷贝数比较低?试着用低拷贝的质粒抽提试剂盒看看会不会好一些?
4楼2013-03-19 10:52:35
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hua_geduo

木虫 (正式写手)


引用回帖:
2楼: Originally posted by xuchenxi121 at 2013-03-19 10:23:41
通常不会是感受态的问题,而是提取质粒的问题,用试剂盒提取时很大可能会有质粒在柱子上洗脱不彻底的情况,因此建议可以将Elution加热后再洗脱,可显著提高得率。

好的,我试试,谢谢
5楼2013-03-19 11:49:41
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hua_geduo

木虫 (正式写手)


引用回帖:
4楼: Originally posted by sxxuan at 2013-03-19 10:52:35
是先划板活化后再挑菌放大摇菌是吗?
我以前用DH5a做宿主培养提取质粒也没问题的。
会不会是你的质粒拷贝数比较低?试着用低拷贝的质粒抽提试剂盒看看会不会好一些?

会不会是摇床的转速问题呢,我们的摇床坏过一次,修好后虽然现实转速是那么大,但总感觉没有那么快
7楼2013-03-19 11:51:48
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hua_geduo(金币+1): 谢谢参与
表达载体比如pET系列, pGEX系列,提取质粒,浓度不高很正常啊,因为他们不是克隆载体,他们的启动子是严谨型启动子,要想获得大量质粒,你可以做中抽或大抽质粒,而且你转化表达菌株也不需要那么大的质粒浓度,只要转化表达菌株长出克隆出来就可以了
8楼2013-03-19 12:25:36
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hua_geduo

木虫 (正式写手)


引用回帖:
9楼: Originally posted by cicelyzh at 2013-03-19 13:16:45
表达载体一般不如克隆载体的拷贝数高,提质粒一般浓度会小一些。你可以多摇些菌。裂解时的溶液按菌量增加,上column吸附的时候可以用同一个柱子,按常规方法elute就可以了。...

原来摇了4ml的菌液提的质粒,效果还是不理想,我再试试吧,谢谢
10楼2013-03-19 14:05:46
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hua_geduo

木虫 (正式写手)


引用回帖:
8楼: Originally posted by gyesang at 2013-03-19 12:25:36
表达载体比如pET系列, pGEX系列,提取质粒,浓度不高很正常啊,因为他们不是克隆载体,他们的启动子是严谨型启动子,要想获得大量质粒,你可以做中抽或大抽质粒,而且你转化表达菌株也不需要那么大的质粒浓度,只要 ...

嗯,知道了,谢谢
11楼2013-03-19 14:06:13
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huoyongting

金虫 (正式写手)



小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
同意楼上的,表达载体的拷贝数一般都是比较低的,你可以看下质粒图谱看看是什么ori ,但是T载体是高拷贝的,提的浓度低的话就不太正常了
12楼2013-03-19 16:39:04
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cicelyzh

铁杆木虫 (职业作家)



小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
10楼: Originally posted by hua_geduo at 2013-03-19 14:05:46
原来摇了4ml的菌液提的质粒,效果还是不理想,我再试试吧,谢谢...

4ml菌液小提质粒不算很多,可以用10-20ml。
13楼2013-03-20 03:07:50
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sxxuan

金虫 (著名写手)



小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
10楼: Originally posted by hua_geduo at 2013-03-19 14:05:46
原来摇了4ml的菌液提的质粒,效果还是不理想,我再试试吧,谢谢...

4ml估计不够啊,9楼的见解和方法很好,有时候我会把菌液加到8ml,分成两管去裂解,然后都吸附到同一个柱子上。分部洗脱效率会高一些。
表达载体的质粒本来就不是很好提的。多尝试几次吧。如果是摇床有问题的话,你可以拿个温度计看看温度准不准,转速慢顶多就多摇几个小时摇到菌浓度够。
如果菌发青的话要考虑是不是死菌增多了
14楼2013-03-20 12:06:59
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hua_geduo

木虫 (正式写手)


引用回帖:
14楼: Originally posted by sxxuan at 2013-03-20 12:06:59
4ml估计不够啊,9楼的见解和方法很好,有时候我会把菌液加到8ml,分成两管去裂解,然后都吸附到同一个柱子上。分部洗脱效率会高一些。
表达载体的质粒本来就不是很好提的。多尝试几次吧。如果是摇床有问题的话,你 ...

嗯,好的,谢谢你的建议,我再试试
15楼2013-03-21 09:26:19
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hua_geduo

木虫 (正式写手)


引用回帖:
16楼: Originally posted by 潇潇溪 at 2015-05-06 11:21:08
我之前也有过这样的情况,也是T载体,后来我就把提出的质粒(虽然浓度低,但是还是有的情况下)化转一下,再挑取单菌落提质粒,就变浓了。你可以试一下,但是个中原因我还在找。希望能帮助到你。

谢谢你的建议,但是。。。。我这帖子是2013年的……你懂的
17楼2015-05-06 14:32:41
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lcp_201418楼
2015-08-20 10:31   回复  
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