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cqjl2008

新虫 (初入文坛)

[求助] 空质粒双酶切后大小不对,纠结!

我要做酵母双杂交,把试剂盒里的质粒转化如DH5a后提质粒,然后双酶切,EcoR1,和BamH1过夜后跑电泳,酶切后质粒偏大,从marker开始向右依次是质粒1 酶切,原质粒1,质粒2酶切,原质粒2.   质粒1应该是8kb质粒2应该是7.3kb,结果都偏大,请教各位是什么原因呢?

2012-10-24_165738.png
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david0308

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
wizardfan: 金币+2, 谢谢分享经验 2012-10-29 08:36:31
wizardfan: 金币+2, 代给金币 2013-01-25 04:03:53
大小的话是对不上的,这个不知道是什么原因,但是酶切之后质粒由超螺旋结构变成线性结构会由于阻力增大导致在胶中位置上移,但是按照楼主的说法质粒1双酶切后应在8kb左右而原质粒应该在更靠下的位置,个人认为可能是marker不准,有时候会有这种现象的,而且这个图告诉了你你双酶切应该确实切开了,而且切的很彻底,胶回收之后做进一步工作应该一点问题都没有,如果你实在不敢继续实验的话就把胶回收产物送去进行全序列测序,这样不推荐的~
哈哈
7楼2012-10-29 02:39:45
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普通回帖

cqjl2008

新虫 (初入文坛)

忘了附上marker大小,从上到下依次是10kb,8000bp,6000bp,5000bp……
2楼2012-10-26 13:02:16
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3楼2012-10-26 13:04:54
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看天

木虫 (知名作家)

显然你点样顺序记错了!
戒嗔怒以养肝气,省言语以养神气,多读书以养质气,顺时令以养元气,不拘节以养大气,观天变以养灵气,莫强求规于运气。
4楼2012-10-26 13:45:22
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cqjl2008

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
4楼: Originally posted by 看天 at 2012-10-26 13:45:22
显然你点样顺序记错了!

不会啊,质粒切开后由双螺旋变成线性,阻力会增大 ,就该跑的慢一些啊
5楼2012-10-26 13:50:20
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看天

木虫 (知名作家)

引用回帖:
5楼: Originally posted by cqjl2008 at 2012-10-26 13:50:20
不会啊,质粒切开后由双螺旋变成线性,阻力会增大 ,就该跑的慢一些啊...

那就不清楚了啊 不太懂
戒嗔怒以养肝气,省言语以养神气,多读书以养质气,顺时令以养元气,不拘节以养大气,观天变以养灵气,莫强求规于运气。
6楼2012-10-26 21:07:08
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cqjl2008

新虫 (初入文坛)

8楼2012-12-23 18:25:21
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mguo15

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖


wizardfan: 金币+1, 谢谢参与 2013-01-25 04:04:09
david0308的回答很好。个人意见是你下次跑胶应该注意胶浓度,本图胶浓度过高。大分子量的样品也可以少上点,效果更好!
9楼2012-12-25 11:21:58
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11ychen

铜虫 (小有名气)

个人觉得胶浓度可能不太合适,不过酶切很彻底。
10楼2013-01-24 10:12:47
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