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笨笨和傻猪

银虫 (小有名气)

[求助] 为什么电转后筛菌,然后用通用引物PCR,但是空GS115都PCR不出条带?跪求!回复!! 已有5人参与

我是电转整合型载体PpiczaA到毕赤酵母GS115中的,但是电转化完成后,进行筛菌。然后想通过菌落PCR先筛选一部分,以下是我的PCR方法及条件:
        1)我采用的用未做电转的空菌GS115做对照,挑取平板上的菌用宝生物的lysis buffer(code :9760)裂解的,然后取1ul进行的PCR,用的是宝生物的Taq酶,50ul体系
        2)体系为:taq(5u/ml):   0.25ul                        PCR条件:94℃            10min
                       10×PCR buffer:   5ul                                          94℃             30s
                       dNTPs(各2.5mM):4ul                                      54℃            30s
                        模板为:               1ul                                        72℃             3min40s
                       3AOX(10uM):   1ul                                         72℃              7min
                       5AOX(10UM):     1ul                                        30个循环
                       灭菌水:              47.5ul
           跪求各位原因啊,哎,什么条带也不出,我尝试了好几次裂解方式,仍旧如此
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zhaodahe

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
myprayer: 金币+1, 赠人玫瑰手有余香,分子生物期待你更多精彩。 2014-11-14 14:07:51
你水加多了,明显不止50微升。如果是笔误,那你换套系统试试吧。

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
2楼2014-11-13 19:25:01
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笨笨和傻猪

银虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by zhaodahe at 2014-11-13 19:25:01
你水加多了,明显不止50微升。如果是笔误,那你换套系统试试吧。

写错了,34.25u l水
3楼2014-11-14 08:46:20
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jjwhl

银虫 (正式写手)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
kx444555: 金币+1, 鼓励交流 2014-11-18 12:01:07
做菌落PCR,直接挑取单菌落至20ul无菌水,煮沸10min,即为模板。再一个模板太少了,50ul体系最少来个4ul模板
4楼2014-11-16 16:38:23
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zergbloody

铁虫 (正式写手)

【答案】应助回帖


kx444555: 金币+1, 鼓励交流 2014-11-18 12:01:11
亲 这样不稳定的 酵母最好是提dna来做

[ 发自小木虫客户端 ]
5楼2014-11-16 19:18:50
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MLN10000

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

你目的片段是多大
6楼2014-11-17 11:19:23
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笨笨和傻猪

银虫 (小有名气)

引用回帖:
6楼: Originally posted by MLN10000 at 2014-11-17 11:19:23
你目的片段是多大

3000多bp
7楼2014-11-17 19:33:45
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guoliwang

至尊木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖


kx444555: 金币+1, 鼓励交流 2014-11-18 12:01:14
PCR条件:1.94℃            10min
                      2. 94℃             30s
                      3.54℃            30s
                      4.72℃             3min40s
                      5. 72℃              7min
                       你的 30个循环只是第2步到第5步吧?你跑PCR时program没设错吧?
    菌落PCR一般扩个300-400bp就行了。你的延长时间3分40秒,难道扩3000多bp么?
    没有电转的空酵母不应该是阴性对照么?没扩出片段才正常。
慎思明辨博学笃行
8楼2014-11-17 20:26:36
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笨笨和傻猪

银虫 (小有名气)

引用回帖:
8楼: Originally posted by guoliwang at 2014-11-17 20:26:36
PCR条件:1.94℃            10min
                      2. 94℃             30s
                      3.54℃            30s
                      4.72℃             3min40s
                      5 ...

不是啊,我用的是通用引物3AOX 和5AOX,毕赤酵母基因组上用这段引物,空菌可以PCR出2000bp条带的
9楼2014-11-17 21:15:26
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guoliwang

至尊木虫 (职业作家)

引用回帖:
9楼: Originally posted by 笨笨和傻猪 at 2014-11-17 21:15:26
不是啊,我用的是通用引物3AOX 和5AOX,毕赤酵母基因组上用这段引物,空菌可以PCR出2000bp条带的...

明白了,那加大模板量试试。
慎思明辨博学笃行
10楼2014-11-17 21:27:28
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