应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 生物科学 » 综合其他 » 【求助/交流】细菌16SDNA的通用引物
131/1返回列表
查看: 3456  |  回复: 12
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

piaoyuaaa

金虫 (小有名气)

[交流] 【求助/交流】细菌16SDNA的通用引物

做PCR-DGGE分析微生物多样性，请问扩增16SDNA的通用引物都有哪些？一般是扩增V3区和V6~V8区吗？哪些通用引物比较常用？还有就是每种引物扩增时是不是选择的程序也不同呢？可不可以用几种引物配体系，然后用相同的程序扩增呢？急！！谢谢！！
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:

» 抢金币啦！回帖就可以得到:

查看全部散金贴
1楼 2011-03-21 16:08:18
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

gayalynau

铁杆木虫 (著名写手)
piaoyuaaa(金币+1): 2011-04-25 17:52:33
27F/1492R 扩的是几乎全长
关于DGGE可以参考Yu ZT 2004-2005年有一篇文章，具体分析了那对引物比较好，不过一般分析的都是V3
Yu and Morrison, 2004
Yu, Z. T. and M. Morrison. 2004. Comparisons of different hypervariable regions of rrs genes for use in fingerprinting of microbial communities by PCR-denaturing gradient gel electrophoresis. Appl. Environ. Microbiol. 70: 4800-4806.
这是一篇DGGE方面的经典文章，值得一看
此外，本人的一片综述，尽管是瘤胃微生物方面的。但是系统讲了分析方法，建议看看

Deng WD, Xi DM, Mao HM, Wanapat M. 2008. The use of molecular techniques based on ribosomal RNA and DNA for rumen microbial ecosystem studies: a review. Molecular Biology Reports. 35(2):265-274.
赞一下(2人) 回复此楼
8楼2011-03-22 13:48:04
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通回帖

匿名

用户注销 (小有名气)
★
piaoyuaaa(金币+1): 2011-03-21 17:18:07
rainwander(金币+1): 鼓励积极参与交流~~~ 2011-03-21 18:48:18
本帖仅楼主可见
2楼2011-03-21 17:02:20
已阅   申请BioEPI   回复此楼   编辑   查看我的主页

xiadongliang

金虫 (正式写手)
★ ★
rainwander(金币+2): 鼓励积极参与交流~~~ 2011-03-21 18:48:07
piaoyuaaa(金币+1): 2011-03-21 21:22:42
piaoyuaaa(金币+1): 2011-04-25 17:52:16
引用回帖:
Originally posted by piaoyuaaa at 2011-03-21 16:08:18:
做PCR-DGGE分析微生物多样性，请问扩增16SDNA的通用引物都有哪些？一般是扩增V3区和V6~V8区吗？哪些通用引物比较常用？还有就是每种引物扩增时是不是选择的程序也不同呢？可不可以用几种引物配体系，然后用相同的 ...

V3区：338F 518R
V6、7、8区：968F 1378R
赞一下(1人) 回复此楼
3楼2011-03-21 17:26:46
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

piaoyuaaa

金虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by wickhamhan at 2011-03-21 17:02:20:
27F/1492R

请问扩增的是哪个区的呢
赞一下 回复此楼
4楼2011-03-21 21:24:46
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

匿名

用户注销 (小有名气)
本帖仅楼主可见
赞一下
5楼2011-03-21 21:37:50
已阅   申请BioEPI   回复此楼   编辑   查看我的主页

xiadongliang

金虫 (正式写手)
★
lstt09nk(金币+1): 感谢参与 2011-03-22 13:32:24
piaoyuaaa(金币+1): 2011-04-25 17:52:54
引用回帖:
Originally posted by wickhamhan at 2011-03-21 21:37:50:
这个我也不太清楚~~反正前几天做的时候用的这对 扩出来的片段大约1.5Kb~

约全长，基本上是16S rDNA序列都包括了。
赞一下(1人) 回复此楼
6楼2011-03-22 08:51:28
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

匿名

用户注销 (小有名气)
本帖仅楼主可见
赞一下
7楼2011-03-22 10:29:30
已阅   申请BioEPI   回复此楼   编辑   查看我的主页

maxlrh

铁杆木虫 (著名写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
怎么没有人分析V4区呀？哪V4区的引物是多少？
赞一下 回复此楼
9楼2012-10-20 09:07:58
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

月下老人

木虫 (著名写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
957279楼: Originally posted by gayalynau at 2011-03-22 13:48:04
27F/1492R 扩的是几乎全长
关于DGGE可以参考Yu ZT 2004-2005年有一篇文章，具体分析了那对引物比较好，不过一般分析的都是V3
Yu and Morrison, 2004
Yu, Z. T. and M. Morrison. 2004. Comparisons of different ...

在国外期刊发表综述，牛人啊。
赞一下 回复此楼
11楼2012-11-23 08:03:44
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhoujlhn

铜虫 (初入文坛)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
5楼: Originally posted by wickhamhan at 2011-03-21 21:37:50
这个我也不太清楚~~反正前几天做的时候用的这对 扩出来的片段大约1.5Kb~

1.5kb有点不对吧！V6大概是400kb左右
赞一下 回复此楼
12楼2013-04-16 23:47:08
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

南拳奶爸

金虫 (初入文坛)
引用回帖:
12楼: Originally posted by zhoujlhn at 2013-04-16 23:47:08
1.5kb有点不对吧！V6大概是400kb左右...

人家几乎是全长
回复此楼
13楼2013-11-12 21:16:56
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
简单回复
月下老人10楼
2012-11-23 08:01   回复  
相关版块跳转 我要订阅楼主 piaoyuaaa 的主题更新
131/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 时间戳变了，能看出什么问题？ +14 基诺咪客 2026-08-17 18/900 2026-08-20 12:13 by saint2016
[基金申请] 重要消息，中午系统在维护 +11 yuleib84 2026-08-18 12/600 2026-08-20 11:09 by xskun
[基金申请] 哪位老哥知道今年的国自然具体哪一天放榜？ +16 Ldrop2023 2026-08-13 20/1000 2026-08-20 11:07 by xskun
[基金申请] 言之凿凿，8月21号(明天)放榜 +12 医学老男孩 2026-08-20 14/700 2026-08-20 10:53 by ran2233
[基金申请] 只有每年这种时候来逛逛小木虫 +21 yaoyewhu2008 2026-08-20 21/1050 2026-08-20 10:37 by Vivilian
[基金申请] 欢迎发来filecode的Mz6后的代码验证其规律 +55 医学老男孩 2026-08-13 125/6250 2026-08-20 09:02 by 医学老男孩
[基金申请] 今天基金会出结果吗？20260819 +14 kkkl_v 2026-08-19 15/750 2026-08-20 08:21 by sunzitan
[基金申请] filecode，4个jtjc了 +11 ziyangfang 2026-08-19 13/650 2026-08-19 21:28 by aasahr
[教师之家] 为什么余额宝的年化利率越来越低？主要原因有哪些？ +5 瞬息宇宙 2026-08-15 5/250 2026-08-19 20:23 by super2002521
[基金申请] 今天放榜没戏了吧 +4 yuleib84 2026-08-19 5/250 2026-08-19 19:52 by hhs666
[基金申请] filecode=后面第一个是大写字母 +10 wangze12014 2026-08-14 12/600 2026-08-19 16:56 by 苦难博士
[基金申请] 2027广东省杰青 +4 奶牛小黑 2026-08-15 10/500 2026-08-19 11:02 by wanfengnew
[基金申请] 朋友圈看到的 +6 wangzilk 2026-08-18 8/400 2026-08-19 10:55 by Haru815
[基金申请] 快农历七夕节了，轻松一下，男人悄悄话，女施主请不要进来。 +6 Tide man 2026-08-14 7/350 2026-08-19 09:56 by ZJTJZ
[基金申请] 什么时候开奖？ +6 CrisMessi 2026-08-18 6/300 2026-08-19 08:06 by Equinoxhua
[基金申请] 明天放榜？ +5 Shxjjxjkx 2026-08-18 5/250 2026-08-18 18:14 by -大大大大大-
[基金申请] 时间戳又变了8-15 +14 archvillain 2026-08-15 26/1300 2026-08-18 13:37 by phantomgost
[基金申请] 今天维护系统维护 祝所有人 高中 +8 gjjjzhong 2026-08-18 9/450 2026-08-18 13:01 by 家与远方
[基金申请] 今天系统多次维护，明天很可能放榜！ +8 zju2000 2026-08-16 9/450 2026-08-17 12:20 by lmz0216
[基金申请] 各位道友，我要去昆明玩几天，回来见。 +7 Tide man 2026-08-14 8/400 2026-08-15 01:11 by arzu_hma
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭