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【求助/交流】细菌16SDNA的通用引物
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| 做PCR-DGGE分析微生物多样性，请问扩增16SDNA的通用引物都有哪些？一般是扩增V3区和V6~V8区吗？哪些通用引物比较常用？还有就是每种引物扩增时是不是选择的程序也不同呢？可不可以用几种引物配体系，然后用相同的程序扩增呢？急！！谢谢！！ |
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piaoyuaaa(金币+1): 2011-04-25 17:52:33
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27F/1492R 扩的是几乎全长 关于DGGE可以参考Yu ZT 2004-2005年有一篇文章，具体分析了那对引物比较好，不过一般分析的都是V3 Yu and Morrison, 2004 Yu, Z. T. and M. Morrison. 2004. Comparisons of different hypervariable regions of rrs genes for use in fingerprinting of microbial communities by PCR-denaturing gradient gel electrophoresis. Appl. Environ. Microbiol. 70: 4800-4806. 这是一篇DGGE方面的经典文章，值得一看 此外，本人的一片综述，尽管是瘤胃微生物方面的。但是系统讲了分析方法，建议看看 Deng WD, Xi DM, Mao HM, Wanapat M. 2008. The use of molecular techniques based on ribosomal RNA and DNA for rumen microbial ecosystem studies: a review. Molecular Biology Reports. 35(2):265-274. |
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