应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

Znn3bq.jpeg
小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 生物科学 » 综合其他 » 【求助/交流】细菌16SDNA的通用引物
131/1返回列表
查看: 3226  |  回复: 12
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

piaoyuaaa

金虫 (小有名气)

[交流] 【求助/交流】细菌16SDNA的通用引物

做PCR-DGGE分析微生物多样性，请问扩增16SDNA的通用引物都有哪些？一般是扩增V3区和V6~V8区吗？哪些通用引物比较常用？还有就是每种引物扩增时是不是选择的程序也不同呢？可不可以用几种引物配体系，然后用相同的程序扩增呢？急！！谢谢！！
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:

» 抢金币啦！回帖就可以得到:

查看全部散金贴
1楼 2011-03-21 16:08:18
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

gayalynau

铁杆木虫 (著名写手)
piaoyuaaa(金币+1): 2011-04-25 17:52:33
27F/1492R 扩的是几乎全长
关于DGGE可以参考Yu ZT 2004-2005年有一篇文章，具体分析了那对引物比较好，不过一般分析的都是V3
Yu and Morrison, 2004
Yu, Z. T. and M. Morrison. 2004. Comparisons of different hypervariable regions of rrs genes for use in fingerprinting of microbial communities by PCR-denaturing gradient gel electrophoresis. Appl. Environ. Microbiol. 70: 4800-4806.
这是一篇DGGE方面的经典文章，值得一看
此外，本人的一片综述，尽管是瘤胃微生物方面的。但是系统讲了分析方法，建议看看

Deng WD, Xi DM, Mao HM, Wanapat M. 2008. The use of molecular techniques based on ribosomal RNA and DNA for rumen microbial ecosystem studies: a review. Molecular Biology Reports. 35(2):265-274.
赞一下(2人) 回复此楼
8楼2011-03-22 13:48:04
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通回帖

匿名

用户注销 (小有名气)
★
piaoyuaaa(金币+1): 2011-03-21 17:18:07
rainwander(金币+1): 鼓励积极参与交流~~~ 2011-03-21 18:48:18
本帖仅楼主可见
2楼2011-03-21 17:02:20
已阅   申请BioEPI   回复此楼   编辑   查看我的主页

xiadongliang

金虫 (正式写手)
★ ★
rainwander(金币+2): 鼓励积极参与交流~~~ 2011-03-21 18:48:07
piaoyuaaa(金币+1): 2011-03-21 21:22:42
piaoyuaaa(金币+1): 2011-04-25 17:52:16
引用回帖:
Originally posted by piaoyuaaa at 2011-03-21 16:08:18:
做PCR-DGGE分析微生物多样性，请问扩增16SDNA的通用引物都有哪些？一般是扩增V3区和V6~V8区吗？哪些通用引物比较常用？还有就是每种引物扩增时是不是选择的程序也不同呢？可不可以用几种引物配体系，然后用相同的 ...

V3区：338F 518R
V6、7、8区：968F 1378R
赞一下(1人) 回复此楼
3楼2011-03-21 17:26:46
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

piaoyuaaa

金虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by wickhamhan at 2011-03-21 17:02:20:
27F/1492R

请问扩增的是哪个区的呢
赞一下 回复此楼
4楼2011-03-21 21:24:46
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

匿名

用户注销 (小有名气)
本帖仅楼主可见
赞一下
5楼2011-03-21 21:37:50
已阅   申请BioEPI   回复此楼   编辑   查看我的主页

xiadongliang

金虫 (正式写手)
★
lstt09nk(金币+1): 感谢参与 2011-03-22 13:32:24
piaoyuaaa(金币+1): 2011-04-25 17:52:54
引用回帖:
Originally posted by wickhamhan at 2011-03-21 21:37:50:
这个我也不太清楚~~反正前几天做的时候用的这对 扩出来的片段大约1.5Kb~

约全长，基本上是16S rDNA序列都包括了。
赞一下(1人) 回复此楼
6楼2011-03-22 08:51:28
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

匿名

用户注销 (小有名气)
本帖仅楼主可见
赞一下
7楼2011-03-22 10:29:30
已阅   申请BioEPI   回复此楼   编辑   查看我的主页

maxlrh

铁杆木虫 (著名写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
怎么没有人分析V4区呀？哪V4区的引物是多少？
赞一下 回复此楼
9楼2012-10-20 09:07:58
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

月下老人

木虫 (著名写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
957279楼: Originally posted by gayalynau at 2011-03-22 13:48:04
27F/1492R 扩的是几乎全长
关于DGGE可以参考Yu ZT 2004-2005年有一篇文章，具体分析了那对引物比较好，不过一般分析的都是V3
Yu and Morrison, 2004
Yu, Z. T. and M. Morrison. 2004. Comparisons of different ...

在国外期刊发表综述，牛人啊。
赞一下 回复此楼
11楼2012-11-23 08:03:44
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhoujlhn

铜虫 (初入文坛)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
5楼: Originally posted by wickhamhan at 2011-03-21 21:37:50
这个我也不太清楚~~反正前几天做的时候用的这对 扩出来的片段大约1.5Kb~

1.5kb有点不对吧！V6大概是400kb左右
赞一下 回复此楼
12楼2013-04-16 23:47:08
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

南拳奶爸

金虫 (初入文坛)
引用回帖:
12楼: Originally posted by zhoujlhn at 2013-04-16 23:47:08
1.5kb有点不对吧！V6大概是400kb左右...

人家几乎是全长
回复此楼
13楼2013-11-12 21:16:56
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
简单回复
月下老人10楼
2012-11-23 08:01   回复  
相关版块跳转 我要订阅楼主 piaoyuaaa 的主题更新
131/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 还有化工二轮调剂的学校吗 5+13 化工人999 2026-04-09 47/2350 2026-04-11 00:20 by 骑牛渡寒江
[考研] 中药学调剂 初试324 +3 洋甘菊、 2026-04-10 5/250 2026-04-10 23:59 by 洋甘菊、
[考研] 人工智能320调剂08工类还有机会吗 +11 振—TZ 2026-04-10 11/550 2026-04-10 21:51 by blankyung
[考研] 295分求调剂 +6 ?要上岸? 2026-04-10 6/300 2026-04-10 21:13 by chemisry
[考研] 303求调剂 +7 SereinQ 2026-04-10 8/400 2026-04-10 21:08 by gong120082
[考研] 085402通信工程调剂，有4项学科竞赛国奖（电赛国二），硕士研究生调剂自荐信。 +4 m永o不v言o弃m 2026-04-09 4/200 2026-04-10 11:30 by asy1wn
[考研] 机械专硕270求调剂，接受跨专业 +10 老师看看我吧aba 2026-04-09 11/550 2026-04-10 10:41 by cal0306
[考研] 296求调剂 +6 汪！？！ 2026-04-09 6/300 2026-04-09 20:49 by lbsjt
[考研] 312求调剂 +3 李鸿飞飞 2026-04-06 3/150 2026-04-09 17:32 by wp06
[考研] 求调剂 +3 猪肉墩粉条cc 2026-04-08 4/200 2026-04-09 10:05 by 猪肉墩粉条cc
[考研] 一志愿211，0703化学305分求调剂 +20 严西西戏 2026-04-06 26/1300 2026-04-08 22:12 by 凯凯要变帅
[考研] 考研求调剂 +4 雯??? 2026-04-08 4/200 2026-04-08 21:44 by 土木硕士招生
[考研] 281求调剂 +10 椰子蘑菇 2026-04-06 10/500 2026-04-08 11:43 by zzucheup
[考研] 277、学硕，求调剂 数一104， +11 瓶子PZ 2026-04-07 12/600 2026-04-07 23:30 by 一只好果子?
[考研] 一志愿西电085401求调剂 +4 sunw1306 2026-04-07 4/200 2026-04-07 16:40 by 啵啵啵0119
[考研] 信工所11408 340分 本科西安交大自动化 +3 moontrek 2026-04-06 3/150 2026-04-07 09:56 by chongya
[考研] 材料调剂 +5 小刘同学吖吖 2026-04-06 5/250 2026-04-06 18:34 by sherry_1901
[考研] 一志愿211生物学280分 求调剂 +5 李rien 2026-04-05 5/250 2026-04-06 10:30 by zhyzzh
[考研] 315求调剂 +5 ＆123456789 2026-04-05 5/250 2026-04-05 19:55 by nepu_uu
[考研] 085500机械专硕初试288求调剂 +3 GZJguo666- 2026-04-05 3/150 2026-04-05 18:06 by jkddd
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭