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赵晓楠zxn

金虫 (初入文坛)

[求助] 目的片段和载体连接一直不上 已有7人参与

1、目的片段738bp(两端带酶切位点),载体选择pCAMBIA3301,酶切位点选择Nco I和BstE II。载体确定已经双酶切开来,目的片段应该也双酶切成功(电泳图片看不出来)。用的Promega的T4连接酶,载体和目的片段摩尔比1:5,反应体系20ul,22℃连接3.5小时,转化至DH5α,未出现菌落。
2、也有说将目的片段和T载体先连接,然后再和表达载体连接,这样更容易连上。原理是什么,不懂。
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lingsheshidu

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
赵晓楠zxn(gyesang代发): 金币+3, 鼓励回帖交流! 2014-04-13 18:28:20
赵晓楠zxn: 金币+4, ★★★很有帮助 2014-04-14 21:27:35
赵晓楠zxn: 金币+1, 有帮助 2014-04-14 21:31:09
载体构建连接不上,许多时候是载体片段和目的基因片段有问题,既然你给出了mol比例,说明你对于载体片段和目的基因片段的量是经过测算的,因此问题可能出在酶切/连接环节。你的基因片段是否酶切开了呢?这个问题是与你的第二个问题相关的,之所以有人建议你先连接T载体,是因为PCR产物连接T载体效率相对较高(须用可在PCR产物末端可加A的PCR聚合酶),提取质粒以后再用Nco I和BstE II酶切质粒(此处为关键:酶切质粒的效率一般要远大于酶切PCR产物),回收带粘末端的基因片段再与载体相连。不知你PCR引物设计时,酶切位点外侧是否加了保护碱基呢?如果引物末端只加了酶切位点,而外侧没有加保护碱基,PCR产物是酶切不开的!也就不可能连接上,只能先连接T载体了。
积累知识,抓紧奋斗!
7楼2014-04-13 02:27:30
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for5

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
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gyesang: 金币+2, 鼓励回帖交流! 2014-04-13 18:27:56
赵晓楠zxn: 金币+2, ★★★很有帮助 2014-04-14 21:26:18
没长菌算是坏事中的好事,至少没有假阳性,那就调整比例多连几次吧。继续转。
T载体那是因为连接效率高,需要用taq酶进行PCR,是目的基因两端加A,但是同时质量不好的T载体容易形成自连,也就导致假阳性
操蛋的XX
2楼2014-04-12 20:57:42
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double可

金虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
确定是否酶失效,T4连接酶在取放的时候都一定要放在冰上。
早已不承认还有什么神
9楼2014-04-14 14:31:12
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夏末忆雪

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★
西门吹雪170: 金币+2, 应助指数+1, 鼓励回帖交流 2014-04-15 11:06:50
1、凝胶回收后损失过多,导致浓度太低,可以增加质粒和pcr的量,体系中少添加水。2、酶切时间短,pcr产物酶切不完全,加长时间,现在的酶特异性挺好的,一般不会乱切,我一般都是切4h。3、连接时间太短,我之前也是室温连了2h,没长,后来16度过夜,就长出来了。
19楼2014-04-15 09:21:57
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普通回帖

Neo2000

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

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引用回帖:
2楼: Originally posted by for5 at 2014-04-12 20:57:42
没长菌算是坏事中的好事,至少没有假阳性,那就调整比例多连几次吧。继续转。
T载体那是因为连接效率高,需要用taq酶进行PCR,是目的基因两端加A,但是同时质量不好的T载体容易形成自连,也就导致假阳性

应该是连接转化出了问题

[ 发自小木虫客户端 ]
3楼2014-04-12 22:46:37
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淘淘279

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
转化无菌落,有无做阳性对照,不一定是基因与载体没连接的问题

[ 发自小木虫客户端 ]
你能做的永远不止这些!
4楼2014-04-12 23:06:33
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淘淘279

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
gyesang: 金币+2, 鼓励回帖交流! 2014-04-13 18:28:10
连T载体是因为用Taq酶做的Pcr末端带A的特性。且其为克隆载体。

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你能做的永远不止这些!
5楼2014-04-12 23:09:51
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随风飘摇11

木虫 (著名写手)

被构建载体伤着了,可是还有9个载体要构

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天道酬勤
6楼2014-04-12 23:46:09
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872940890

铁虫 (小有名气)

我现在也是在做表达  
不知道 双酶切 电泳后 你又切胶回收了吗?
有时候  双酶切后电泳会发现  条带弥散  表明DNA已经被降解了
我知道我得继续努力!加油!
8楼2014-04-14 14:04:01
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zhangtao110

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

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如果酶切位点刚好甲基化可能也切不开!

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10楼2014-04-14 15:20:11
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