24小时热门版块排行榜    

CyRhmU.jpeg
查看: 3053  |  回复: 17

蓝绿精灵

铜虫 (初入文坛)


[交流] 载体连接pcr片段一直连不上

我用nde1和xba1双酶切后的载体片段pLSB2(约4.5kb)分别与两个pcr片段做连接,然后做转化,整个实验全部都重新做了一遍,可一直连不上。请那位达人指点一下 ,衷心地表示谢谢!
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

分子生物学实验问题

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

» 抢金币啦!回帖就可以得到:

查看全部散金贴

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

清风寨

银虫 (小有名气)


★ ★
lstt09nk(金币+2): 鼓励交流 2011-09-25 12:41:10
是你转化后涂布的板子没有长呢 还是挑出来的单菌落没有目的基因呢  你用的什么方法鉴定阳性克隆的  PCR 还是直接抽质粒鉴定 可能原因很多 具体情况说出来可以帮你想想
2楼2011-09-25 11:13:42
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

蓝绿精灵

铜虫 (初入文坛)


谢谢了  我说说最近的两次实验情况吧,之前是转化(无论是热转还是电转)后平板上都未有菌落生长。经重新酶切质粒然后回收,重新找引物合成公司合成引物重新pcr扩增后酶切回收,前一次对照组(pLSB2)和实验组平板上都有菌落生长,实验组经划线培养,然后液体培养提质粒未发现有质粒,确定为假阳性。这一次一个实验组(连的2.6kb pcr片段)平板上有菌落生长,只是不多(几个的样子),经划线培养,然后液体培养提质粒单酶切鉴定,发现多切除一条带来,不知道是否有阳性转化子存在。
3楼2011-09-25 21:05:35
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

清风寨

银虫 (小有名气)


★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖
adslye(金币+2): 鼓励交流~祝顺利! 2011-09-26 09:16:46
蓝绿精灵(金币+5): 非常感谢你即使的建议,我再试试 2011-09-27 09:29:21
首先连接时目的片段和酶切后质粒的摩尔量最好是1:1左右(可通过回收后跑胶 观看亮度大致判断一下 ) 转化时将连接产物加入感受态后30min不要动它 热激90s后放置冰上2min使其冷却 这些都是必须的步骤且不能有错 涂布板子时像你这种基本不长的 可以不进行涂布 直接将恢复1h后的菌液到于平板上晃匀 然后在超净台中开盖吹干 再进行培养 还有就是你可以选用转化效率高的超级感受态 你在鉴定时也不推荐你先抽质粒鉴定 可以做菌落PCR鉴定挑出阳性克隆再挑
4楼2011-09-26 09:07:34
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

tianhuijuan

金虫 (小有名气)



小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
3楼: Originally posted by 蓝绿精灵 at 2011-09-25 21:05:35:
谢谢了  我说说最近的两次实验情况吧,之前是转化(无论是热转还是电转)后平板上都未有菌落生长。经重新酶切质粒然后回收,重新找引物合成公司合成引物重新pcr扩增后酶切回收,前一次对照组(pLSB2)和实验组平板 ...

楼上的意思是引物出问题的可能性也很大?偶最近也是做这部分好长时间了,长不出菌落。。
5楼2011-09-26 16:15:54
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lsp1018

木虫 (正式写手)


★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖
lstt09nk(金币+3): 鼓励交流,欢迎常来 2011-09-27 16:41:59
提供楼主两种方法:
1.可以换一株相近的宿主菌试试,如果新换的宿主菌中有阳性克隆,只能再换个质粒做载体转入到你的目的菌中。
2.PCR产物直接酶切,有时候可靠性不高。上次实验中也出现与楼主相似情况,长出来的全是假阳性。将PCR产物通过ta克隆连接到T载后,挑阳性克隆,胶回收酶切片段后,再与目的质粒连接就解决问题了。

祝好运!
6楼2011-09-26 16:35:27
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

muyanshuang

木虫 (正式写手)



小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖
应该是菌株有污染,尽快更换感受态!
7楼2011-09-26 16:38:29
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

fearlessman

新虫 (初入文坛)



小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖
从头检查一遍实验,包括酶切位点什么的,片段比较大的就是比较难连,建议转化时加点质粒对照,我的经验是转化不行就适当增大载体量,连接不行就增加片段量
8楼2011-09-26 20:31:04
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

蓝绿精灵

铜虫 (初入文坛)


引用回帖:
6楼: Originally posted by lsp1018 at 2011-09-26 16:35:27:
提供楼主两种方法:
1.可以换一株相近的宿主菌试试,如果新换的宿主菌中有阳性克隆,只能再换个质粒做载体转入到你的目的菌中。
2.PCR产物直接酶切,有时候可靠性不高。上次实验中也出现与楼主相似情况,长出来 ...

谢谢  我要连接的两个PCR片段一个是2.7kb,一个是7.8kb。之前我将7.8kb pcr片段连T载体,可一直都连不上,考虑到该片段是不是太大了,所以就放弃做ta克隆了
9楼2011-09-27 09:15:37
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

蓝绿精灵

铜虫 (初入文坛)


引用回帖:
4楼: Originally posted by 清风寨 at 2011-09-26 09:07:34:
首先连接时目的片段和酶切后质粒的摩尔量最好是1:1左右(可通过回收后跑胶 观看亮度大致判断一下 ) 转化时将连接产物加入感受态后30min不要动它 热激90s后放置冰上2min使其冷却 这些都是必须的步骤且不能有错 涂 ...

我要连接的一个pcr片段有7.8kb,是不是做电转化效率要高一些
10楼2011-09-27 09:27:48
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lsp1018

木虫 (正式写手)


★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖
adslye(金币+2): 感谢交流~~ 2011-09-28 11:28:19
引用回帖:
9楼: Originally posted by 蓝绿精灵 at 2011-09-27 09:15:37:
谢谢  我要连接的两个PCR片段一个是2.7kb,一个是7.8kb。之前我将7.8kb pcr片段连T载体,可一直都连不上,考虑到该片段是不是太大了,所以就放弃做ta克隆了

TA克隆的效率非常高,如果说TA克隆连不上,通过酶切连接成功的可能性更低。
顺便请教一下7.8kb的片断是通过哪种DNA聚合酶克隆的?
11楼2011-09-27 13:42:41
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

tian1203

银虫 (著名写手)



小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖
个人观点:2.0kb以上的片段不要用自己做的感受态,DH5也不好用。买JM109试试
12楼2011-09-27 18:18:23
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

蓝绿精灵

铜虫 (初入文坛)


引用回帖:
11楼: Originally posted by lsp1018 at 2011-09-27 13:42:41:
TA克隆的效率非常高,如果说TA克隆连不上,通过酶切连接成功的可能性更低。
顺便请教一下7.8kb的片断是通过哪种DNA聚合酶克隆的?

宝生物 la taq 聚合酶
13楼2011-09-28 10:50:34
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lsp1018

木虫 (正式写手)


引用回帖:
13楼: Originally posted by 蓝绿精灵 at 2011-09-28 10:50:34:
宝生物 la taq 聚合酶

奥,谢谢
14楼2011-09-28 18:28:50
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

sarah-miao

银虫 (正式写手)



小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
1899248楼: Originally posted by 蓝绿精灵 at 2011-09-27 09:15:37
谢谢  我要连接的两个PCR片段一个是2.7kb,一个是7.8kb。之前我将7.8kb pcr片段连T载体,可一直都连不上,考虑到该片段是不是太大了,所以就放弃做ta克隆了...

其实7.8的连T载体貌似应该好连一些。。。
15楼2012-11-28 15:17:57
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

sarah-miao

银虫 (正式写手)


引用回帖:
1899988楼: Originally posted by 蓝绿精灵 at 2011-09-27 09:27:48
我要连接的一个pcr片段有7.8kb,是不是做电转化效率要高一些...

其实我觉得可以换换感受态试试,有的时候并不是你连接产物的问题
16楼2012-11-28 15:18:39
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

迷糊虫

新虫 (初入文坛)



小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
同遇到这种问题,双酶切都能切开,但是做连接就连不上,连个假阳性的都没有,困扰好久了,求问LZ这个问题最后是怎么解决得啊?
17楼2016-01-26 13:57:24
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lichee313

金虫 (初入文坛)



小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
17楼: Originally posted by 迷糊虫 at 2016-01-26 13:57:24
同遇到这种问题,双酶切都能切开,但是做连接就连不上,连个假阳性的都没有,困扰好久了,求问LZ这个问题最后是怎么解决得啊?

感受态细胞效价不高的问题,换个好点的感受态
18楼2018-10-12 14:42:48
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 蓝绿精灵 的主题更新
普通表情 高级回复(可上传附件)
信息提示
请填处理意见