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菜菜的夏子

铜虫 (小有名气)

[求助] 为什么连接这么难呢?

做了很久的连接了,几乎总是失败。无论是用普通的T4酶连接,还是将片段PCR后用专门的PCR产物连接试剂盒连接;无论是用哪个公司的酶连接,总是连接不上,为什么呢?现在严重怀疑是自己的技术问题……
    连接后转化大肠杆菌,阳性对照每次都可以长出来,就是自己的连接样品不长,无论是新配制的抗性平板,还是配制了大约一个月的抗性平板,都不长……所以我怀疑是自己的连接出了问题,不知道猜想对不对?求各位大侠赐教。
    难道是连接后需要纯化吗?但是请教了别的实验室的人,都说一般不需要纯化,都是直接转化的呀~涂板时也注意将涂布器凉了再涂的呀,应该不会将细菌高温杀死了啊?也没敢涂的时间太久啊,大概每块板就两三分钟吧,也应该不会导致细菌死亡啊?……哪里的问题呢?
    连接时的操作都需要注意些什么呢?跪求各位指点啊!跪求……
       我这只大菜鸟……
--------------------------------------------------------------------------------------------------
首先PCR后跑电泳检测,全部上样,割胶回收。然后连接。
连接我做了两组(均为TaKaRa产品):
1、 10xT4连接Buffer       1ul
      pMD 18 T 载体      1ul
      T4 DNA 连接酶      1ul
      割胶回收PCR产物    7ul

2、 pMD 18 T 载体       1ul
      割胶回收PCR产物     4ul
      Solution 1                 5ul

两者均为16摄氏度连接过夜,我还怕温度不准,放在了PCR仪里,取出来时看了时间,14个小时多,按理说肯定该连接好了。但是转化大肠杆菌后不长。

PCR我也是重新做的,就是想着用新鲜的PCR产物,载体是问别人借的,因为实验室正好用完了,但是别人每次都可以连接成功的……所以我就搞不懂是哪里的问题了,难道是我的酶有问题?

[ Last edited by 西瓜 on 2011-6-8 at 16:05 ]
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wuzuobin125

铜虫 (小有名气)

经过这么多童鞋的努力和总结,LZ的问题应该是解决了。生物实验不像做木工,任何时候和环节都能看得到摸得着,如果实验失败了,那就要从实验的开始理清思路,回放实验过程,然后是针对每个环节进行排除,只有这样才能让自己有信心将实验进行下去,而且一旦将问题找到,这将极大增强自己的实验信心。
42楼2011-06-12 11:32:03
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普通回帖

西瓜

荣誉版主 (知名作家)

★ ★ ★
dhd997(金币+3): 2011-06-08 10:16:38
阳性对照ok的话,那连接出问题的可能比较大啦。建议你把连接步骤详细说下。
我们实验室的话,如果连接屡次不成,会直接重新做连接底物,PCR重做,载体也重新切。PCR产物用试剂盒纯化,载体酶切之后胶回收纯化,不过也有人上述两者都只是乙醇沉淀纯化,做得也很好。连接产物我们从来不纯化呢。
2楼2011-06-07 23:20:46
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healerly

禁虫 (小有名气)

★ ★ ★ ★ ★
dhd997(金币+5): good 2011-06-08 10:16:54
本帖内容被屏蔽

3楼2011-06-08 08:26:47
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zj408694018

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
dhd997(金币+3): good 2011-06-08 10:17:06
用Takara的试剂盒做连接,然后放到PCR仪里面,时间久点
还有就是要是你连续连接超过三次都不行的话最好考虑换酶,PCR和酶切的酶
我的也是连接了好久一直连接不上,但是最近换了PCR的酶之后很顺利,连着连接上两个,呵呵
4楼2011-06-08 08:41:23
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beautybanana

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
dhd997(金币+5, EPI+1): good 2011-06-08 10:17:25
引用回帖:
Originally posted by 菜菜的夏子 at 2011-06-07 22:48:42:
做了很久的连接了,几乎总是失败。无论是用普通的T4酶连接,还是将片段PCR后用专门的PCR产物连接试剂盒连接;无论是用哪个公司的酶连接,总是连接不上,为什么呢?现在严重怀疑是自己的技术问题……
    连接后转 ...

pMD18-T vector ligation system
pMD18-T                        1uL
DNA template        4uL
Solution I                        5uL
Total                        10uL
将纯化的PCR产物与T载体连接重组,16℃保温3~4h后,全量(10uL)转化至150uL的E.coli DH5α的感受态细胞。
(1) 将10μL连接液移入含200μL感受态细胞的1.5mL dorf管中,冰浴30-60min。
(2) 42℃水浴热激90sec后,立即再冰浴5min。
(3) 加入300μL LB液体培养基,37℃ 220 rpm培养1-2h。
(4) 吸100μL菌液涂布含Amp/ X-Gal/ IPTG平板培养基的LB固体培养基平板, 37℃ 培养16-24h。
保证PCR产物或感受态细胞的质量即可。

这个我怀疑是感受态细胞的质量或是转化步骤存在很大问题~
5楼2011-06-08 08:44:46
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poog502

木虫 (正式写手)

★ ★
dhd997(金币+2): 鼓励 2011-06-08 10:17:38
顺便提一下
pMD18-T vector载体的链接效率很低,如果总是做不出来,可以用promega的T easy载体。
6楼2011-06-08 08:49:55
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飘在海上的雪

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
dhd997(金币+2): 鼓励 2011-06-08 10:17:50
我一直用takara的PMD19-T,一般没出现过什么问题,在4度连接过夜,如果片段稍长,就多连接一天...
不在沉默中爆发,就在沉默着死亡!
7楼2011-06-08 08:58:26
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sfb1020

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
dhd997(金币+2): 鼓励 2011-06-08 10:17:58
dhd997(金币+2): 鼓励 2011-06-08 10:18:09
是不是你回收的目的基因不纯,有杂质会影响连接反应。
8楼2011-06-08 10:05:21
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击中月亮

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖


西瓜(金币+1): 加油哈~ 2011-06-08 18:54:25
我也遇到楼主同样的问题。现在做的有没信心了!呵呵  我看看了各位的回帖 对自己受益匪浅啊 再接再厉 接着做  哈哈 !
9楼2011-06-08 10:35:57
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shine372

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
西瓜(金币+3): 鼓励交流 2011-06-08 18:54:57
pMD19-T vector ligation system
pMD19-T                        1uL
DNA                               7uL
T4DNA连接酶                  0.5uL
缓冲液                            1uL
DD水                              1uL
将纯化的PCR产物与T载体连接重组,16℃过夜,全量(10uL)转化至80uL的E.coli DH5α的感受态细胞。
(1) 将10μL连接液移入含80μL感受态细胞的1.5mL Ep管中,冰浴30-60min。
(2) 42℃水浴热激90sec后,立即再冰浴5min。
(3) 加入300μL LB液体培养基,37℃ 220 rpm培养1h。
(4) 吸100μL菌液涂布含Amp平板培养基的LB固体培养基平板, 37℃ 培养8-10h
10楼2011-06-08 10:41:57
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