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Autodock对接问题
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无言执隐
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2015-09-02 17:48:08
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蓝洋飘雪
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DS/Syby
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[已完结]
autogrid运行时,出现问题。
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pengxin8086
2013-04-05
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awenqiang
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DS/Syby
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[已完结]
急!!SYBYL(2.0)怎么查看对接后的配体与原始配体之间的RMSD值?
(评阅+1)
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mei_er
2014-05-17
2015-08-26 21:23:09
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prometheus7
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DS/Syby
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使用sybyl-X总是提示选中分子,请问如何才能选中?
(1/830)
HC山高人为峰
2015-03-12
2015-08-26 21:17:57
by
prometheus7
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DS/Syby
]
【求助】用DS做3D-QSAR药效团
(评阅+1)
(7/1726)
mazhayazi
2010-09-21
2015-08-20 12:20:49
by
cwj420315
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DS/Syby
]
【求助】DS里药效团验证分析
(6/2109)
木子米米
2010-07-04
2015-08-20 12:02:02
by
cwj420315
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DS/Syby
]
[已完结]
DS中如何提高药效团的null cost
(4/981)
童心
2011-04-25
2015-08-20 11:53:50
by
cwj420315
[
DS/Syby
]
[已完结]
做分子对接,有多个同源建模的受体蛋白,该怎么选择?
(评阅+1)
(3/1234)
五月之青青
2015-07-26
2015-08-19 10:19:47
by
东湖渡者
[
DS/Syby
]
[已完结]
[关贴]
DS2.5安装后没有3D window
(6/526)
yylcx
2015-08-18
2015-08-18 21:31:03
by
yylcx
[
DS/Syby
]
[已完结]
请问sybyl模拟的受体除了从PDB获取外,还有哪些网站?
(0/293)
wurenkebi
2015-08-14
2015-08-14 15:38:28
by
wurenkebi
[
DS/Syby
]
本人新接触这领域,想请问一下有关残基的问题
(评阅+1)
(2/352)
cuenk
2015-08-10
2015-08-13 19:30:26
by
pymol
[
DS/Syby
]
[已完结]
关于MM-PBSA的基本操作
(3/639)
路人甲-ZQY
2015-07-23
2015-08-09 19:01:32
by
micro6790
[
DS/Syby
]
[已完结]
autodock最后一步完成不下去
(1/407)
zhangqian511
2015-07-26
2015-08-08 16:11:57
by
longdlut
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DS/Syby
]
[已完结]
DS计算出错。
(1/498)
化学化工系
2013-03-31
2015-08-06 14:40:46
by
micro6790
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DS/Syby
]
[已完结]
sybyl怎么构建骨架+R基团虚拟库
(评阅+1)
(4/672)
happychen621
2015-08-04
2015-08-05 11:05:21
by
wbingxin2012
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DS/Syby
]
[已完结]
Gold对接结果分析
(3/1790)
吴丰旭
2014-11-01
2015-08-04 17:18:47
by
栀子花开hbh
[
DS/Syby
]
[已完结]
用autodock做分子对接,请问对接后如何标记出氨基酸?如图所示。
(2/1704)
五月之青青
2015-07-28
2015-07-31 08:16:33
by
五月之青青
[
DS/Syby
]
【求助】求博士论——文分子对接在药物设计中的应用
(评阅+1)
(10/1712)
sibsqq
2010-12-01
2015-07-30 21:34:04
by
ghlsx
[
DS/Syby
]
[已完结]
使用AutoDock做分子对接,该如何确定蛋白质活性部位?
(2/890)
五月之青青
2015-07-26
2015-07-27 10:07:11
by
五月之青青
[
DS/Syby
]
[已完结]
有那个大神可以做分子和靶点的对接呀,或者那个地方可以做,谢谢了
(
1
2
)
(11/1167)
hou_bl
2015-07-16
2015-07-25 20:35:19
by
白鸿明
[
DS/Syby
]
[已完结]
大神求教
(评阅+1)
(9/1002)
1004511751
2015-07-16
2015-07-24 17:30:26
by
蓝洋飘雪
[
DS/Syby
]
[已完结]
autodock格点数据输出出错(grid中保存gpf文件时)
(1/905)
chavid
2015-07-20
2015-07-21 14:27:23
by
longdlut
[
DS/Syby
]
[已完结]
求助
(5/466)
junzhang1989
2015-07-19
2015-07-21 14:26:34
by
longdlut
[
DS/Syby
]
[已完结]
pymol APBS的使用问题
(2/1308)
huangyannicole
2013-09-13
2015-07-21 10:34:33
by
huangyannicole
[
DS/Syby
]
[已完结]
[关贴]
sybyl对接后ligplus作图
(0/1396)
qjgmedchem
2015-07-20
2015-07-20 19:03:45
by
qjgmedchem
[
DS/Syby
]
[已完结]
新手问题:想问关于小分子与蛋白质分子的对接的问题
(评阅+1)
(2/1191)
shenl891
2015-05-19
2015-07-18 18:12:47
by
therotyonth
[
DS/Syby
]
[已完结]
求解autodock遗传算法的参数含义
(0/399)
rocksliu
2015-07-17
2015-07-17 13:13:07
by
rocksliu
[
DS/Syby
]
【求助】氨基酸序列三维结构的获得
(5/2326)
lifei_dut
2010-08-13
2015-07-16 06:58:54
by
pymol
[
DS/Syby
]
[已完结]
同源模建
(1/466)
lmzxcom1
2011-11-22
2015-07-13 12:43:18
by
蓝洋飘雪
[
DS/Syby
]
请教CoMFA问题
(评阅+1)
(19/1174)
gxh200719
2015-03-14
2015-07-11 08:33:53
by
297364226
[
DS/Syby
]
sybyl x 2.1.1(mac),谁能帮忙下载
(4/1578)
xufund
2015-07-06
2015-07-09 19:13:53
by
xufund
[
DS/Syby
]
[已完结]
哪位朋友有SYBYL-X 教学视频 源资科技官网的视频在线看不了
(3/1103)
majunjie3612
2014-12-04
2015-07-04 17:36:00
by
xufund
[
DS/Syby
]
sybyl 对接问题
(15/2030)
lc68102017
2013-03-21
2015-07-02 06:37:44
by
珍维永久
[
DS/Syby
]
[已完结]
sybyl 分子对接 怎么根据与原配体比较 来判断sdf文件中哪个化合物对接的较好
(0/862)
happychen621
2015-06-30
2015-06-30 21:50:21
by
happychen621
[
DS/Syby
]
[已完结]
想做分子对接,有关配体能量最小化的问题。请前辈指点,谢谢!
(评阅+1)
(5/2542)
螺旋藻
2015-04-11
2015-06-30 18:37:06
by
xx7353
[
DS/Syby
]
[已完结]
[关贴]
软件DS 查看对接结果出的问题
(3/1076)
小馨月
2015-05-12
2015-06-25 18:51:10
by
小馨月
[
DS/Syby
]
[已完结]
蛋白模拟
(0/918)
zix1
2015-06-23
2015-06-23 21:43:51
by
zix1
[
DS/Syby
]
如何从ZDOCK server上下载所有500个dock pose?
(0/1110)
Lalabao
2015-06-18
2015-06-18 23:41:25
by
Lalabao
[
DS/Syby
]
[已完结]
sybyl软件下,两个同源小分子配体构象比较?
(评阅+1)
(2/627)
13581286695
2015-05-14
2015-06-12 10:10:52
by
爱吃粉丝的猫
[
DS/Syby
]
[已完结]
COMFA的R平方,q平方说明了什么
(评阅+1)
(1/1524)
256872
2015-05-27
2015-06-12 10:09:10
by
爱吃粉丝的猫
[
DS/Syby
]
[已完结]
蛋白质相互作用
(评阅+1)
(3/1645)
落木778
2015-05-22
2015-06-11 16:15:31
by
wbingxin2012
[
DS/Syby
]
[已完结]
DS4.0 安装问题
(评阅+1)
(4/1658)
萤火之光
2015-04-30
2015-06-10 16:08:04
by
萤火之光
[
DS/Syby
]
[已完结]
蛋白结构预测
(4/539)
王豆豆123
2015-06-06
2015-06-08 15:28:04
by
pymol
[
DS/Syby
]
【求助】autodock对接后小分子被打断的情况
(6/1721)
czx12czx
2010-05-10
2015-06-06 11:04:24
by
pymol
[
DS/Syby
]
【求助】DS分子对接为什么出现0pose
(
1
2
)
(评阅+1)
(14/3519)
xiaobao7365
2010-10-16
2015-06-01 15:42:57
by
谁的小虫儿
[
DS/Syby
]
[已完结]
关于shchrodinger的配体准备和glide对接问题
(0/265)
majunjie3612
2015-05-28
2015-05-28 19:40:02
by
majunjie3612
[
DS/Syby
]
[已完结]
DS中的软件开启时change serviceD点击OK时总是显示错误是什么原因?
(0/300)
川大成功
2015-05-26
2015-05-26 00:15:26
by
川大成功
[
DS/Syby
]
[已完结]
如何进行碳正离子的分子对接
(0/396)
s1g2k3
2015-05-25
2015-05-25 16:08:43
by
s1g2k3
[
DS/Syby
]
请教各位大神autodock知识
(评阅+1)
(4/767)
刘晓龙李宁
2015-05-19
2015-05-20 09:34:38
by
pymol
[
DS/Syby
]
[已完结]
想学习做一下分子对接,求入门参考资料,请各位大侠推荐
(1/1089)
小毛孩24
2015-05-18
2015-05-18 15:46:21
by
longdlut
[
DS/Syby
]
[已完结]
新手问题:如何找到已命名的氨基酸分子的结构,譬如His22,ser32之类的,
(评阅+1)
(2/630)
shenl891
2015-05-15
2015-05-16 15:08:30
by
xwnail2003
[
DS/Syby
]
SYBYL培训班近期要在广州举办,中大,5.22-24日,有兴趣的同学跟上
(
1
2
)
(55/1494)
爱吃粉丝的猫
2015-04-30
2015-05-14 09:39:03
by
后觉
[
DS/Syby
]
[已完结]
sybyl问题
(评阅+1)
(9/994)
无言执隐
2015-05-11
2015-05-14 08:50:02
by
梦晨VSHEROIN
[
DS/Syby
]
蛋白质与小分子进行刚性对接时,蛋白质需要能量最小化吗?
(评阅+1)
(5/2410)
zixun2013
2015-05-08
2015-05-13 09:50:07
by
pymol
[
DS/Syby
]
[已完结]
CoMFA 和QSAR的问题
(3/1184)
zlp-lw
2013-05-13
2015-05-12 18:07:41
by
张庆达
[
DS/Syby
]
分子对接研究
(48/3334)
b247996407
2012-05-08
2015-05-11 07:55:36
by
无言执隐
[
DS/Syby
]
[已完结]
Discovery studio 2.5里对接 怎么把ligand构象固定住?
(评阅+1)
(6/1277)
maggie凤
2015-04-23
2015-05-05 15:10:06
by
莲心
[
DS/Syby
]
[已完结]
请教3c5t或3c59如何做对接前处理
(3/569)
xufund
2015-05-01
2015-05-05 11:15:30
by
pymol
[
DS/Syby
]
[已完结]
求助HCH的几类异构体对接到LinA酶的对接构型
(评阅+1)
(2/231)
舞枫流香
2015-04-29
2015-05-05 09:43:26
by
舞枫流香
[
DS/Syby
]
[已完结]
[关贴]
SPECS 数据库
(0/3361)
都欧系
2015-05-04
2015-05-04 10:35:21
by
都欧系
[
DS/Syby
]
[已完结]
一定要看。脂质膜DPPC模拟
(评阅+1)
(6/1106)
Vivian2020
2015-04-30
2015-05-03 14:46:48
by
Vivian2020
[
DS/Syby
]
[已完结]
[关贴]
六碳环上有any是啥意思?
(0/331)
yqx1985
2015-05-02
2015-05-02 10:02:49
by
yqx1985
[
DS/Syby
]
[已完结]
求可以转化或生成mol2格式的软件,谢谢
(
1
2
)
(10/5233)
wuxunxun1990
2015-03-14
2015-04-30 14:43:12
by
wuxunxun1990
[
DS/Syby
]
[已完结]
用autodock做病毒衣壳蛋白与配体的对接
(评阅+1)
(7/1644)
zixun2013
2015-04-27
2015-04-28 21:54:10
by
白鸿明
[
DS/Syby
]
[已完结]
Autodock 模拟蛋白与多糖 是否可以设置力场?或者系统默认了某种力场?
(评阅+1)
(0/426)
xuxingfeng
2015-04-22
2015-04-22 21:21:02
by
xuxingfeng
[
DS/Syby
]
[已完结]
DS分子动力学时间设置问题
(评阅+1)
(3/1484)
LinuxHawk
2015-03-16
2015-04-22 15:30:02
by
monsoncupid
[
DS/Syby
]
[已完结]
SYBYL-X求助 画小分子结构有关
(评阅+1)
(3/1616)
苗一鸣
2015-02-05
2015-04-22 06:56:40
by
lymkitty
[
DS/Syby
]
[已完结]
bash中使用autodock4却出错,cannot executed binary file:Exec format error
(评阅+1)
(1/629)
youkiwang
2015-04-20
2015-04-21 16:56:50
by
youkiwang
[
DS/Syby
]
[已完结]
【求助】autodock结果用pymol打开氨基酸结构错乱影响作图
(评阅+1)
(4/1116)
xiaofeng514
2014-04-19
2015-04-21 06:52:39
by
xiaofeng514
[
DS/Syby
]
[已完结]
[关贴]
autodock vina里box参数一定。结果为什么会有几个在box外面了。给配体加电荷怎么是0.0
(评阅+1)
(2/1335)
fan728516414
2015-04-14
2015-04-17 16:34:22
by
fan728516414
[
DS/Syby
]
[已完结]
Autodock对接dlg格式文件中出现问题
(6/2295)
panfangli
2013-06-25
2015-04-13 13:14:13
by
panfangli
[
DS/Syby
]
[已完结]
没有晶体机构的靶点 怎么做计算?该怎么回答审稿人
(3/546)
realkaka
2015-04-10
2015-04-10 16:29:22
by
后觉
[
DS/Syby
]
[已完结]
[关贴]
求助AUTODOCK 加氢问题
(4/2361)
joy11
2015-04-09
2015-04-09 15:23:44
by
joy11
[
DS/Syby
]
[已完结]
DS建药效团,null cost−total cost和RMS值偏大,是什么原因,应该如何解决?
(1/973)
erin19911203
2015-03-09
2015-04-09 09:22:25
by
小柒_92
[
DS/Syby
]
[已完结]
关于受体酶活性位点的叠加
(评阅+1)
(1/359)
雷时海200
2015-03-29
2015-04-08 16:49:36
by
weishuang
[
DS/Syby
]
[已完结]
如何给benchmark里面的蛋白质加极性氢
(评阅+1)
(0/315)
咿呀静候轮回
2015-04-07
2015-04-07 11:45:04
by
咿呀静候轮回
[
DS/Syby
]
[已完结]
输入多肽一级序列,输出三级结构pdb文件的软件?
(6/2351)
windtalker168
2011-04-20
2015-04-07 06:26:34
by
pymol
[
DS/Syby
]
[已完结]
请帮我用pymol做一个很简单的分子叠合吧,菜鸟我做了很久都叠不上
(
1
2
)
(13/3149)
totoro1992
2013-05-26
2015-04-03 00:23:55
by
smutao
[
DS/Syby
]
[已完结]
[关贴]
window下运行pyrx,里面的box参数怎么手动精确设置。跪求神门。
(评阅+1)
(2/685)
fan728516414
2015-03-31
2015-04-01 10:19:46
by
fan728516414
[
DS/Syby
]
[已完结]
运行autogrid时无法读取受体分子pdbqt文件
(评阅+1)
(7/1716)
yaanamm
2015-03-30
2015-03-31 21:13:18
by
yaanamm
[
DS/Syby
]
[已完结]
pyrx在运行 Run Autogrid 时出现了错误,怎么处理这个问题。
(评阅+1)
(4/1949)
fan728516414
2015-03-27
2015-03-30 22:11:22
by
fan728516414
[
DS/Syby
]
[已完结]
Sybyl X2 如何同时优化多个分子
(评阅+1)
(1/1125)
后觉
2015-03-27
2015-03-30 16:47:28
by
wbingxin2012
[
DS/Syby
]
求助sybyl关于添加形式电荷的问题
(模拟EPI+1)
(8/4114)
tongliping
2012-04-14
2015-03-30 09:48:37
by
Echo1022
[
DS/Syby
]
[已完结]
pyrx批量对接时vina里的BOX里的坐标数字怎么改啊。
(评阅+1)
(1/919)
fan728516414
2015-03-28
2015-03-29 11:20:32
by
pymol
[
DS/Syby
]
[已完结]
Sybyl里别人做的COMFA,怎么看它的分子叠合的共同骨架?
(5/1808)
parasol_
2015-03-25
2015-03-27 07:31:01
by
dxl20132009
[
DS/Syby
]
[已完结]
用DS进行蛋白同源建模时出现错误
(0/995)
jmcookie
2015-03-19
2015-03-19 11:10:38
by
jmcookie
[
DS/Syby
]
【求助】在使用sybylx1.1 的ORCHESTRAR出现新问题
(评阅+4)
(7/866)
nufang19a
2011-01-24
2015-03-17 12:12:31
by
fy_14720982
[
DS/Syby
]
[已完结]
小分子的pdb文件怎么获得?
(6/2615)
835598372
2013-10-08
2015-03-17 08:54:29
by
feisjob
[
DS/Syby
]
[已完结]
SYBYL-X 2.0 输出结果报错 找不到文件
(1/1038)
苗一鸣
2015-03-15
2015-03-16 16:18:15
by
wbingxin2012
[
DS/Syby
]
[已完结]
DS2.5 中做蛋白BLAST Search (DS Server) 中的Input Database (PDB_nr95)数据库
(0/1439)
jmcookie
2015-03-16
2015-03-16 10:00:53
by
jmcookie
[
DS/Syby
]
[已完结]
请问Autodock vina里虚原子怎么设置
(1/838)
maggie凤
2015-03-10
2015-03-15 20:48:19
by
pymol
[
DS/Syby
]
[已完结]
对下载的PDB处理问题
(0/402)
六点早茶
2015-03-12
2015-03-12 12:11:39
by
六点早茶
[
DS/Syby
]
[已完结]
[关贴]
求pyrx 的具体操作vina。虚拟筛选的配体怎么来,怎么做啊。
(0/1325)
fan728516414
2015-03-10
2015-03-10 22:05:16
by
fan728516414
[
DS/Syby
]
[已完结]
小白求指导筛选某蛋白的抑制剂
(0/526)
心不留影
2015-03-10
2015-03-10 16:33:59
by
心不留影
[
DS/Syby
]
[已完结]
[关贴]
vina 脚本参数设计是以什么为依据的。看了不同的人,都不一样。
(1/821)
fan728516414
2015-03-09
2015-03-09 15:30:07
by
fan728516414
[
DS/Syby
]
[已完结]
Linux 系统用ADT进行autogrid时出现can not find hsg1rigi.pdbqt的情况
(评阅+1)
(4/748)
Tony1994
2015-02-14
2015-03-09 10:00:34
by
马香玲a
[
DS/Syby
]
[已完结]
DS2.5的下载链接不能用了
(0/627)
最后的武士
2015-03-06
2015-03-06 20:32:12
by
最后的武士
[
DS/Syby
]
[已完结]
[关贴]
求一篇DS计算类偏科普基础类文章
(1/275)
yandingan
2015-03-05
2015-03-05 15:19:39
by
zhad33
[
DS/Syby
]
[已完结]
求助:计算两个原子之间的距离
(评阅+1)
(9/4602)
珍维永久
2015-02-27
2015-03-02 11:02:08
by
pymol
[
DS/Syby
]
[已完结]
求Discovery studio V2.5.ISO的资源
(评阅+1)
(7/1801)
最后的武士
2015-01-29
2015-03-01 15:27:29
by
最后的武士
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