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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » DS/Sybyl/Autodock » 请教3c5t或3c59如何做对接前处理
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xufund

至尊木虫 (知名作家)

[求助] 请教3c5t或3c59如何做对接前处理 已有1人参与

麻烦高手赐教。另外那个内源性配体exendin-4(9-39)怎么看啊？
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1楼 2015-05-01 23:16:52
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pymol

捐助贵宾 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
用哪个对接软件啊？autodock就是加氢，计算电荷，合并非极性氢原子就可以保存成pdbqt
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2楼2015-05-04 15:09:00
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xufund

至尊木虫 (知名作家)
引用回帖:
2楼: Originally posted by pymol at 2015-05-04 15:09:00
用哪个对接软件啊？autodock就是加氢，计算电荷，合并非极性氢原子就可以保存成pdbqt

想用ledock做对接。试了一下ledock自带的处理模块，对接的结果不是很理想
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3楼2015-05-04 15:42:44
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pymol

捐助贵宾 (正式写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by xufund at 2015-05-04 15:42:44
想用ledock做对接。试了一下ledock自带的处理模块，对接的结果不是很理想...

嗯，这个软件没有用过
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4楼2015-05-05 11:15:30
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