24小时热门版块排行榜    

查看: 957  |  回复: 5

无言执隐

木虫 (小有名气)

[求助] Autodock对接问题 已有1人参与

向大家请教2个问题:
我用的是HSA的PDB文件,在Autodock中:
1.如何将其去除配体。
2.如何在ADT中使用最陡下降法进行运算处理。(ps:能有图解就最好了)
谢谢!
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

有志者,事竟成,破釜沉舟,百二秦关终属楚;苦心人,天不负,卧薪尝胆,三千越甲可吞吴。
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

pymol

捐助贵宾 (正式写手)


【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
无言执隐: 金币+3, 有帮助 2015-06-10 16:25:31
1:在界面的左下角,选中相关配体,然后EDIT-DELETE ATOM
2:这个是动力学优化结构
2楼2015-06-10 14:39:17
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

无言执隐

木虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by pymol at 2015-06-10 14:39:17
1:在界面的左下角,选中相关配体,然后EDIT-DELETE ATOM
2:这个是动力学优化结构

嗯,好的,谢谢,找到册配体的地方了。
有志者,事竟成,破釜沉舟,百二秦关终属楚;苦心人,天不负,卧薪尝胆,三千越甲可吞吴。
3楼2015-06-10 16:25:40
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

蓝洋飘雪

木虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by 无言执隐 at 2015-06-10 16:25:40
嗯,好的,谢谢,找到册配体的地方了。...

您好,请问您能教教我如何选定特定对接区域吗?
人生如茶,不会苦一辈子,但会苦一阵子!
4楼2015-07-24 17:42:29
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

无言执隐

木虫 (小有名气)

引用回帖:
4楼: Originally posted by 蓝洋飘雪 at 2015-07-24 17:42:29
您好,请问您能教教我如何选定特定对接区域吗?...

你说的是Grid吗,这个是选定一个特定的格子进行对接,具体的你可以看看教程。http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=3324861&fpage=2这个你可以看看,应该会有点用。
有志者,事竟成,破釜沉舟,百二秦关终属楚;苦心人,天不负,卧薪尝胆,三千越甲可吞吴。
5楼2015-07-25 09:40:36
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

蓝洋飘雪

木虫 (小有名气)

引用回帖:
5楼: Originally posted by 无言执隐 at 2015-07-25 09:40:36
你说的是Grid吗,这个是选定一个特定的格子进行对接,具体的你可以看看教程。http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=3324861&fpage=2这个你可以看看,应该会有点用。...

好的谢谢啦
人生如茶,不会苦一辈子,但会苦一阵子!
6楼2015-09-02 20:48:08
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 无言执隐 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 一志愿郑州大学,080500学硕,总分317分求调剂 +3 举个栗子oi 2026-03-24 4/200 2026-03-26 20:49 by sanrepian
[考研] 求调剂 +5 芦lty 2026-03-25 6/300 2026-03-26 20:49 by 不吃魚的貓
[考研] 303求调剂 +7 元夕元 2026-03-20 8/400 2026-03-26 20:38 by 不吃魚的貓
[考研] 【双一流院校新能源、环境材料,材料加工与模拟招收大量调剂】 +4 Higraduate 2026-03-22 8/400 2026-03-26 20:34 by Higraduate
[考研] 一志愿 西北大学 ,070300化学学硕,总分287,双非一本,求调剂。 +6 晨昏线与星海 2026-03-20 6/300 2026-03-26 19:20 by macy2011
[考研] 材料考研求调剂 +3 Dendel 2026-03-23 6/300 2026-03-26 17:51 by fmesaito
[考研] 085602 289分求调剂 +8 WWW西西弗斯 2026-03-24 8/400 2026-03-26 16:33 by 不吃魚的貓
[考研] 材料科学与工程 317求调剂 +4 JKSOIID 2026-03-26 4/200 2026-03-26 15:58 by 不吃魚的貓
[考研] 296求调剂 +5 www_q 2026-03-20 5/250 2026-03-26 12:56 by 3Strings
[考研] 考研调剂 +6 来好运来来来 2026-03-21 7/350 2026-03-25 22:43 by 418490947
[考研] 一志愿中南大学化学学硕0703总分337求调剂 +7 niko- 2026-03-22 7/350 2026-03-25 20:14 by qingfeng258
[考研] 311求调剂 +4 勇敢的小吴 2026-03-20 4/200 2026-03-25 18:12 by xcjcqu
[考研] 网络空间安全0839招调剂 +4 w320357296 2026-03-25 6/300 2026-03-25 17:59 by 255671
[考研] 化工专硕求调剂 +3 question挽风 2026-03-24 3/150 2026-03-24 18:48 by jhhcooi
[考研] 277分求调剂,跨调材料 +3 考研调剂lxh 2026-03-24 3/150 2026-03-24 13:52 by JourneyLucky
[考研] 279分求调剂 一志愿211 +18 chaojifeixia 2026-03-19 20/1000 2026-03-24 10:34 by dolphin_ycj
[考研] 280分求调剂 一志愿085802 +4 PUMPT 2026-03-22 7/350 2026-03-22 22:13 by 星空星月
[考研] 319求调剂 +4 小力气珂珂 2026-03-20 4/200 2026-03-22 15:53 by ColorlessPI
[考研] 求调剂 +3 13341 2026-03-20 3/150 2026-03-21 18:28 by 学员8dgXkO
[考研] A区线材料学调剂 +5 周周无极 2026-03-20 5/250 2026-03-20 21:33 by laoshidan
信息提示
请填处理意见