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无言执隐

木虫 (小有名气)

[求助] Autodock对接问题 已有1人参与

向大家请教2个问题：
我用的是HSA的PDB文件，在Autodock中：
1.如何将其去除配体。
2.如何在ADT中使用最陡下降法进行运算处理。（ps：能有图解就最好了）
谢谢！
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有志者，事竟成，破釜沉舟，百二秦关终属楚；苦心人，天不负，卧薪尝胆，三千越甲可吞吴。
1楼 2015-06-09 15:57:33
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pymol

捐助贵宾 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
无言执隐: 金币+3, ★有帮助 2015-06-10 16:25:31
1：在界面的左下角，选中相关配体，然后EDIT-DELETE ATOM
2：这个是动力学优化结构
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2楼2015-06-10 14:39:17
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无言执隐

木虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by pymol at 2015-06-10 14:39:17
1：在界面的左下角，选中相关配体，然后EDIT-DELETE ATOM
2：这个是动力学优化结构

嗯，好的，谢谢，找到册配体的地方了。
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有志者，事竟成，破釜沉舟，百二秦关终属楚；苦心人，天不负，卧薪尝胆，三千越甲可吞吴。
3楼2015-06-10 16:25:40
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蓝洋飘雪

木虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by 无言执隐 at 2015-06-10 16:25:40
嗯，好的，谢谢，找到册配体的地方了。...

您好，请问您能教教我如何选定特定对接区域吗？
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人生如茶，不会苦一辈子，但会苦一阵子！
4楼2015-07-24 17:42:29
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无言执隐

木虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by 蓝洋飘雪 at 2015-07-24 17:42:29
您好，请问您能教教我如何选定特定对接区域吗？...

你说的是Grid吗，这个是选定一个特定的格子进行对接，具体的你可以看看教程。http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=3324861&fpage=2这个你可以看看，应该会有点用。
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有志者，事竟成，破釜沉舟，百二秦关终属楚；苦心人，天不负，卧薪尝胆，三千越甲可吞吴。
5楼2015-07-25 09:40:36
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蓝洋飘雪

木虫 (小有名气)
引用回帖:
5楼: Originally posted by 无言执隐 at 2015-07-25 09:40:36
你说的是Grid吗，这个是选定一个特定的格子进行对接，具体的你可以看看教程。http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=3324861&fpage=2这个你可以看看，应该会有点用。...

好的谢谢啦
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人生如茶，不会苦一辈子，但会苦一阵子！
6楼2015-09-02 20:48:08
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