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无言执隐

木虫 (小有名气)

[求助] Autodock对接问题 已有1人参与

向大家请教2个问题:
我用的是HSA的PDB文件,在Autodock中:
1.如何将其去除配体。
2.如何在ADT中使用最陡下降法进行运算处理。(ps:能有图解就最好了)
谢谢!
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有志者,事竟成,破釜沉舟,百二秦关终属楚;苦心人,天不负,卧薪尝胆,三千越甲可吞吴。
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pymol

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【答案】应助回帖

★ ★ ★
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无言执隐: 金币+3, 有帮助 2015-06-10 16:25:31
1:在界面的左下角,选中相关配体,然后EDIT-DELETE ATOM
2:这个是动力学优化结构
2楼2015-06-10 14:39:17
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无言执隐

木虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by pymol at 2015-06-10 14:39:17
1:在界面的左下角,选中相关配体,然后EDIT-DELETE ATOM
2:这个是动力学优化结构

嗯,好的,谢谢,找到册配体的地方了。
有志者,事竟成,破釜沉舟,百二秦关终属楚;苦心人,天不负,卧薪尝胆,三千越甲可吞吴。
3楼2015-06-10 16:25:40
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蓝洋飘雪

木虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by 无言执隐 at 2015-06-10 16:25:40
嗯,好的,谢谢,找到册配体的地方了。...

您好,请问您能教教我如何选定特定对接区域吗?
人生如茶,不会苦一辈子,但会苦一阵子!
4楼2015-07-24 17:42:29
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无言执隐

木虫 (小有名气)

引用回帖:
4楼: Originally posted by 蓝洋飘雪 at 2015-07-24 17:42:29
您好,请问您能教教我如何选定特定对接区域吗?...

你说的是Grid吗,这个是选定一个特定的格子进行对接,具体的你可以看看教程。http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=3324861&fpage=2这个你可以看看,应该会有点用。
有志者,事竟成,破釜沉舟,百二秦关终属楚;苦心人,天不负,卧薪尝胆,三千越甲可吞吴。
5楼2015-07-25 09:40:36
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蓝洋飘雪

木虫 (小有名气)

引用回帖:
5楼: Originally posted by 无言执隐 at 2015-07-25 09:40:36
你说的是Grid吗,这个是选定一个特定的格子进行对接,具体的你可以看看教程。http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=3324861&fpage=2这个你可以看看,应该会有点用。...

好的谢谢啦
人生如茶,不会苦一辈子,但会苦一阵子!
6楼2015-09-02 20:48:08
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