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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » DS/Sybyl/Autodock » 【求助】用DS做3D-QSAR药效团
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mazhayazi

银虫 (小有名气)

[交流] 【求助】用DS做3D-QSAR药效团 已有4人参与

各位大哥大姐们，请问用DS做3D-QSAR药效团，训练集要提前做哪些处理啊？不胜感激。。。
具体用到那些模块操作啊？
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1楼 2010-09-21 16:00:49
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CADD

银虫 (正式写手)
★ ★ ★ ★
mazhayazi(金币+1):谢谢参与
zh1987hs(金币+3):谢谢 2010-09-21 17:37:33
help中有具体操作，看着做就行，就能把QSAR做完。
首先对训练集进行叠合，DS里也有叠合模块，具体是哪一个记不清了。

做QSAR时，有三种叠合方式，分别是基于药效团，分子对接，以活性最高的分子为模板，其他分子与之叠合。看看那一种适合你吧。
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2楼2010-09-21 17:03:22
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xppcomeon

捐助贵宾 (正式写手)
★
mazhayazi(金币+1):谢谢参与
引用回帖:
Originally posted by CADD at 2010-09-21 17:03:22:
help中有具体操作，看着做就行，就能把QSAR做完。
首先对训练集进行叠合，DS里也有叠合模块，具体是哪一个记不清了。

做QSAR时，有三种叠合方式，分别是基于药效团，分子对接，以活性最高的分子为模板，其他分 ...

那个叠合方式是指什么？
赞一下(1人) 回复此楼
3楼2010-11-10 15:49:18
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CADD

银虫 (正式写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
你不是要做QSAR吗？做这个必须先做叠合呀？
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4楼2010-11-11 21:24:08
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blue_cat

木虫 (正式写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
她是做药效团，不是纯粹的QSAR
赞一下(1人) 回复此楼
DS
5楼2010-11-12 12:12:08
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blue_cat

木虫 (正式写手)
★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
ghcacj(金币+2):谢谢 2010-11-12 13:01:25
用到的模块是3DQSAR pharmacophore generation模块，具体的操作方法你可以找找论坛里的教程
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DS
6楼2010-11-12 12:15:12
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mazhayazi

银虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by blue_cat at 2010-11-12 12:15:12:
用到的模块是3DQSAR pharmacophore generation模块，具体的操作方法你可以找找论坛里的教程

谢谢回复，操作大体知道了，结果也可以做出来了，只是结果不够好，做不出文献的那种结果
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7楼2010-11-13 15:51:37
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cwj420315
8楼2015-08-20 15:20:49
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