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DS中如何提高药效团的null cost
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| 我用DS中的3D qSAR 药效团，就是hypogen对16个具有同样骨架结构的化合物构建药效团，基本活性分4个档次（最高/最低=400）,每个档次大约3-5个。选择的HBA，HBD，Hydrophobic aromatic, hydrophobic aliphatic，构建药效团，尝试过Excluded volume 设置2或5，但是结果里面每个药效团的total cost都在70左右，而null cost也差不多，根本达不到config difference 》60 bits，不过correlation和config都还好，基本0,9和小于17了。我不知道该如何能提高null cost，而且我看别人文献报道药效团的total cost也接近100，感觉我的还是比较低的。我的活性不够4个数量级引起的吗？求指教！ |
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2楼2011-05-16 21:31:57
chemozhang
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BME_LIU
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