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DS中如何提高药效团的null cost
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| 我用DS中的3D qSAR 药效团,就是hypogen对16个具有同样骨架结构的化合物构建药效团,基本活性分4个档次(最高/最低=400),每个档次大约3-5个。选择的HBA,HBD,Hydrophobic aromatic, hydrophobic aliphatic,构建药效团,尝试过Excluded volume 设置2或5,但是结果里面每个药效团的total cost都在70左右,而null cost也差不多,根本达不到config difference 》60 bits,不过correlation和config都还好,基本0,9和小于17了。我不知道该如何能提高null cost,而且我看别人文献报道药效团的total cost也接近100,感觉我的还是比较低的。我的活性不够4个数量级引起的吗?求指教! |
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2楼2011-05-16 21:31:57
chemozhang
木虫 (正式写手)
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3楼2011-09-05 19:19:57
BME_LIU
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4楼2014-02-20 21:45:19
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