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parasol_

新虫 (小有名气)

[求助] Sybyl里别人做的COMFA,怎么看它的分子叠合的共同骨架? 已有3人参与

RT,以前的师兄做了COMFA和COMSIA,有training和test的文件,我想照着做一遍,但是不知道他选择哪些原子来作为日叠合时的骨架,怎么查看?
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后觉

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
我也是正在学,骨架一般选择的是活性最好的化合物作为模板分子叠合,看看训练集里面活性最好的一般就是模板分子吧。
2楼2015-03-25 17:17:05
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wbingxin2012

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
一般选择活性最好分子的当作模版分子这个是没有问题的,但是公共骨架的选择没有固定的说法,要选择所有分子都包含的部分当作骨架,但也不是这一部分所有分子都含有就一定是公共骨架,要有取舍。你可以调出QSAR结果那张图,看一下叠合情况基本就能确定骨架了
3楼2015-03-26 11:26:56
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parasol_

新虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 后觉 at 2015-03-25 17:17:05
我也是正在学,骨架一般选择的是活性最好的化合物作为模板分子叠合,看看训练集里面活性最好的一般就是模板分子吧。

额,我是想看叠合图,不知道怎么调出来
4楼2015-03-27 03:35:32
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parasol_

新虫 (小有名气)

内容已删除
5楼2015-03-27 03:36:37
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dxl20132009

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
parasol_: 金币+2, ★★★很有帮助 2015-03-28 12:33:42
我记得是先把叠合后的database打开,右上角有个工具,从里面可以找到查看qsar结果

[ 发自小木虫客户端 ]
6楼2015-03-27 07:31:01
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