24小时热门版块排行榜    

查看: 1870  |  回复: 5

parasol_

新虫 (小有名气)

[求助] Sybyl里别人做的COMFA,怎么看它的分子叠合的共同骨架? 已有3人参与

RT,以前的师兄做了COMFA和COMSIA,有training和test的文件,我想照着做一遍,但是不知道他选择哪些原子来作为日叠合时的骨架,怎么查看?
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

后觉

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
我也是正在学,骨架一般选择的是活性最好的化合物作为模板分子叠合,看看训练集里面活性最好的一般就是模板分子吧。
2楼2015-03-25 17:17:05
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wbingxin2012

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
一般选择活性最好分子的当作模版分子这个是没有问题的,但是公共骨架的选择没有固定的说法,要选择所有分子都包含的部分当作骨架,但也不是这一部分所有分子都含有就一定是公共骨架,要有取舍。你可以调出QSAR结果那张图,看一下叠合情况基本就能确定骨架了
3楼2015-03-26 11:26:56
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

parasol_

新虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 后觉 at 2015-03-25 17:17:05
我也是正在学,骨架一般选择的是活性最好的化合物作为模板分子叠合,看看训练集里面活性最好的一般就是模板分子吧。

额,我是想看叠合图,不知道怎么调出来
4楼2015-03-27 03:35:32
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

parasol_

新虫 (小有名气)

内容已删除
5楼2015-03-27 03:36:37
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

dxl20132009

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
parasol_: 金币+2, ★★★很有帮助 2015-03-28 12:33:42
我记得是先把叠合后的database打开,右上角有个工具,从里面可以找到查看qsar结果

[ 发自小木虫客户端 ]
6楼2015-03-27 07:31:01
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 parasol_ 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 323求调剂 +6 洼小桶 2026-03-18 6/300 2026-03-23 00:29 by king123!
[考研] 一志愿上海交大生物与医药专硕324分,求调剂 +3 jiajunX 2026-03-22 3/150 2026-03-22 19:32 by brblmd
[考研] 306求调剂 +5 来好运来来来 2026-03-22 5/250 2026-03-22 16:17 by BruceLiu320
[考研] 298求调剂一志愿211 +3 上岸6666@ 2026-03-20 3/150 2026-03-22 15:50 by ColorlessPI
[考研] 生物学调剂 +5 Surekei 2026-03-21 5/250 2026-03-22 14:39 by tcx007
[考研] 354求调剂 +7 Tyoumou 2026-03-18 10/500 2026-03-22 11:11 by 人来盛
[考研] 280求调剂 +11 咕噜晓晓 2026-03-18 12/600 2026-03-21 22:40 by ACS Nano——
[考研] 材料求调剂 +5 @taotao 2026-03-21 5/250 2026-03-21 20:55 by lbsjt
[考研] 求调剂 +3 13341 2026-03-20 3/150 2026-03-21 18:28 by 学员8dgXkO
[考研] 307求调剂 +3 余意卿 2026-03-18 3/150 2026-03-21 17:31 by ColorlessPI
[考研] 材料学学硕080502 337求调剂-一志愿华中科技大学 +4 顺顺顺mr 2026-03-18 5/250 2026-03-21 10:22 by luoyongfeng
[考研] 299求调剂 +6 △小透明* 2026-03-17 6/300 2026-03-21 02:42 by JourneyLucky
[考研] 083200学硕321分一志愿暨南大学求调剂 +3 innocenceF 2026-03-17 3/150 2026-03-21 02:35 by JourneyLucky
[考研] 265求调剂 +9 梁梁校校 2026-03-17 9/450 2026-03-21 02:17 by JourneyLucky
[考研] 材料 336 求调剂 +3 An@. 2026-03-18 4/200 2026-03-21 01:39 by JourneyLucky
[考研] 330求调剂 +4 小材化本科 2026-03-18 4/200 2026-03-20 23:13 by JourneyLucky
[考研] 一志愿南京理工大学085701资源与环境302分求调剂 +4 葵梓卫队 2026-03-18 6/300 2026-03-20 23:02 by JourneyLucky
[考研] 一志愿 西北大学 ,070300化学学硕,总分287,双非一本,求调剂。 +4 晨昏线与星海 2026-03-19 4/200 2026-03-20 22:15 by JourneyLucky
[考研] 0817 化学工程 299分求调剂 有科研经历 有二区文章 +22 rare12345 2026-03-18 22/1100 2026-03-20 20:39 by zhukairuo
[考研] 材料与化工专硕调剂 +7 heming3743 2026-03-16 7/350 2026-03-20 19:31 by zhukairuo
信息提示
请填处理意见