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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » DS/Sybyl/Autodock » 小分子的pdb文件怎么获得？
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835598372

新虫 (小有名气)

[求助] 小分子的pdb文件怎么获得？

我想用ADT把D-leucine和NAD+dock蛋白质结构中，却找不到这两个分子的pdb文件，请论坛里的大神指教,这两个结构怎么获得？
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1楼 2013-10-08 10:55:19
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autodockytu

捐助贵宾 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
自己用chemidraw画一下结构，然后保存成mo2格式，然后在adt转为pdb格式
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2楼2013-10-10 07:14:53
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fengxinzi78

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
在NCBI数据库中下载
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Acontentedmindisaperpetualfeast!
3楼2013-10-10 14:50:50
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SunnyRain0.0

金虫 (正式写手)
内容已删除
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Ihaveonedream~
4楼2013-10-16 20:52:08
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fengxinzi78

金虫 (正式写手)
引用回帖:
4楼: Originally posted by SunnyRain0.0 at 2013-10-16 20:52:08
NCBI可以下载pdb格式吗？...

不可以，下到的是.sdf格式文件，还需要用openbabel软件转换为pdb格式就好了。
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Acontentedmindisaperpetualfeast!
5楼2013-10-16 21:03:21
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feisjob

新虫 (正式写手)
内容已删除
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无。
6楼2015-03-17 11:53:29
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feisjob

新虫 (正式写手)
内容已删除
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无。
7楼2015-03-17 11:54:29
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