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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » 其他 » 【求助】用于ligplot的pdb文件究竟应如何准备?
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winterose_

铜虫 (小有名气)

[交流] 【求助】用于ligplot的pdb文件究竟应如何准备? 已有2人参与

如题,想用ligplot将对接完成后的配体与蛋白的相互作用方式表达出来,但是pdb文件总是有问题,总是出现ligplot找不到配体或配体残基的情况,所以请教大家,pdb文件究竟应如何准备?一个好的pdb文件究竟应符合哪些标准?
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1楼 2010-05-12 10:34:32
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winterose_

铜虫 (小有名气)
呃...我自己搞定了...
所以,能否劳烦版主大人把金币还给我呢....
多多感谢!
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2楼2010-06-04 10:39:35
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dragontj

木虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by winterose_ at 2010-06-04 10:39:35:
呃...我自己搞定了...
所以,能否劳烦版主大人把金币还给我呢....
多多感谢!

请问你是怎么搞定的，我总是出错，nothing to plot.
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3楼2010-06-04 11:49:07
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winterose_

铜虫 (小有名气)
是周边残基找不到吗?
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4楼2010-06-04 11:53:58
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