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835598372

新虫 (小有名气)

[求助] 小分子的pdb文件怎么获得?

我想用ADT把D-leucine和NAD+dock蛋白质结构中,却找不到这两个分子的pdb文件,请论坛里的大神指教,这两个结构怎么获得?
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autodockytu

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【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
自己用chemidraw画一下结构,然后保存成mo2格式,然后在adt转为pdb格式
2楼2013-10-10 07:14:53
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fengxinzi78

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
在NCBI数据库中下载
Acontentedmindisaperpetualfeast!
3楼2013-10-10 14:50:50
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SunnyRain0.0

金虫 (正式写手)

内容已删除
Ihaveonedream~
4楼2013-10-16 20:52:08
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fengxinzi78

金虫 (正式写手)

引用回帖:
4楼: Originally posted by SunnyRain0.0 at 2013-10-16 20:52:08
NCBI可以下载pdb格式吗?...

不可以,下到的是.sdf格式文件,还需要用openbabel软件转换为pdb格式就好了。
Acontentedmindisaperpetualfeast!
5楼2013-10-16 21:03:21
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feisjob

新虫 (正式写手)

内容已删除
无。
6楼2015-03-17 11:53:29
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feisjob

新虫 (正式写手)

内容已删除
无。
7楼2015-03-17 11:54:29
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