24小时热门版块排行榜    

查看: 1976  |  回复: 7

liuyusuc

禁虫 (正式写手)

本帖内容被屏蔽

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

abdoman

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
御剑江湖(金币+4): 谢谢 2011-10-18 20:18:07
gaussview 可以自动加氢。
但是氨基酸残基加氢感觉是按照溶液状态的加的。
比如,ARG自动加氢会带一个正电,而GLU 会有2个羰基负离子。
Youcompleteme.
2楼2011-10-18 16:17:59
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

abdoman

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
御剑江湖(金币+2): 谢谢 2011-10-20 09:38:18
纠正一下:GLU 会带有2个羧酸根。
Youcompleteme.
3楼2011-10-18 16:18:32
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

liuyusuc

禁虫 (正式写手)

本帖内容被屏蔽

4楼2011-10-18 16:27:23
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

liuyusuc

禁虫 (正式写手)

本帖内容被屏蔽

5楼2011-10-18 16:29:48
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

liuyusuc

禁虫 (正式写手)

本帖内容被屏蔽

6楼2011-10-18 16:31:26
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wangyan10

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
御剑江湖(金币+3): 谢谢 2011-10-20 09:38:32
个人感觉,pdb文件中缺少的氢原子可以用很多途径来加上。图形化可视界面的DS以及AMBER都可以实现的。
努力的生活着
7楼2011-10-18 21:58:08
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

abdoman

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
liuyusuc(金币+2): 感谢您的帮助! 2011-10-19 21:15:13
御剑江湖(金币+4): 谢谢 2011-10-20 09:38:42
引用回帖:
5楼: Originally posted by liuyusuc at 2011-10-18 16:29:48:
怎么出现乱码了呢。我是想要问一下这种加氢的操作可以使用Gromacs实现吗?

你既然有这种“特殊要求”。可以直接google啊
我不懂gromacs。
但是
http://manual.gromacs.org/online/pdb2gmx.html
这个貌似可以!
Youcompleteme.
8楼2011-10-19 17:07:43
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 liuyusuc 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 材料专硕326求调剂 +4 墨煜姒莘 2026-03-15 4/200 2026-03-15 11:02 by dyw
[考研] 308 085701 四六级已过求调剂 +7 温乔乔乔乔 2026-03-12 14/700 2026-03-14 10:49 by JourneyLucky
[考研] 330求调剂 +3 ?酱给调剂跪了 2026-03-13 3/150 2026-03-14 10:13 by JourneyLucky
[考研] 085600材料与化工 326 求调剂 +5 热爱生活ing 2026-03-09 5/250 2026-03-14 02:39 by JourneyLucky
[考研] 293求调剂 +5 上班不着吉 2026-03-09 5/250 2026-03-14 02:37 by JourneyLucky
[考研] 一志愿浙江大学0856材料与化工求调剂 +4 yansheng@211 2026-03-09 5/250 2026-03-14 02:10 by JourneyLucky
[考研] 0703求调剂 +7 jtyq001 2026-03-10 7/350 2026-03-14 01:06 by JourneyLucky
[考研] 312求调剂 +6 陌宸希 2026-03-10 6/300 2026-03-14 00:40 by JourneyLucky
[考研] 321求调剂 +3 CUcat 2026-03-10 3/150 2026-03-14 00:25 by JourneyLucky
[考研] 327求调剂 +4 Ffff03 2026-03-10 4/200 2026-03-14 00:17 by JourneyLucky
[考研] 材料与化工求调剂一志愿 985 总分 295 +8 dream…… 2026-03-12 8/400 2026-03-13 22:17 by 星空星月
[考研] 求调剂(材料与化工327) +4 爱吃香菜啦 2026-03-11 4/200 2026-03-13 22:11 by JourneyLucky
[考研] 材料工程调剂 +9 咪咪空空 2026-03-12 9/450 2026-03-13 22:05 by 星空星月
[考研] 301求调剂 +6 Liyouyumairs 2026-03-11 6/300 2026-03-13 20:11 by JourneyLucky
[考研] 求调剂 +5 一定有学上- 2026-03-12 5/250 2026-03-13 18:31 by ms629
[硕博家园] 深圳大学硕士招生(2026秋,传感器方向,仅录取第一志愿) +4 xujiaoszu 2026-03-11 7/350 2026-03-13 17:28 by xujiaoszu
[考研] 0856化学工程280分求调剂 +4 shenzxsn 2026-03-11 4/200 2026-03-13 11:55 by ymwdoctor
[考研] 工科0856专硕化学工程269能调剂吗 +10 我想读研11 2026-03-10 10/500 2026-03-13 10:14 by Yuyi.
[考研] 纺织、生物、化学、材料相关专业招生了 +4 耶耶业 2026-03-09 7/350 2026-03-12 19:05 by Equinoxhua
[考研] 279求调剂 +3 莫xiao 2026-03-10 4/200 2026-03-11 08:06 by 斩魂滴兔子!
信息提示
请填处理意见