24小时热门版块排行榜    

北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
查看: 2284  |  回复: 4

sunzhiguo

金虫 (正式写手)

[交流] 【求助】pdb文件转换成gjf文件问题 已有3人参与

请教大家:1、从MS中截取分子筛模型,export存为pdb文件,然后用gview打 开  键很乱,还有虚键,请问做高斯计算前需不需要将其处理成单键?
     2、用氢原子饱和悬断键,固定Si-H键长,请问除逐个修改,有没有其他办法?
多谢回答。好人一生平安。
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

erylingjet

铁杆木虫 (著名写手)

★ ★
zhou2009(金币+2): 2010-10-10 16:42:43
1。不需要
2。自动加氢
2楼2010-10-09 16:49:03
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

sunzhiguo

金虫 (正式写手)

引用回帖:
Originally posted by erylingjet at 2010-10-09 16:49:03:
1。不需要
2。自动加氢

多谢。是在MS中自动加氢吗?自动加氢后怎么确定Si-H键的键长为0.146nm?
3楼2010-10-10 11:14:20
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

quantumor

金虫 (著名写手)

快乐兔子


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
MS本身就有Dmol,可以做很多事情的,干嘛要拐个弯再做Gaussian呢?
愿好运与快乐伴随你!
4楼2010-10-10 14:48:28
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

sunzhiguo

金虫 (正式写手)

引用回帖:
Originally posted by quantumor at 2010-10-10 14:48:28:
MS本身就有Dmol,可以做很多事情的,干嘛要拐个弯再做Gaussian呢?

因为要做ONIOM,而且只有高斯的版权。多谢参与。
5楼2010-10-10 14:55:05
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 sunzhiguo 的主题更新
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 0703调剂,一志愿天津大学319分 +16 haaaabcd 2026-04-05 17/850 2026-04-06 19:25 by 尚水阁主
[考研] 080500求调剂 +8 黄宇博 2026-04-06 8/400 2026-04-06 18:41 by lijunpoly
[考研] 385分 生物学(071000)求调剂 +12 qf626 2026-04-01 12/600 2026-04-06 17:36 by 52305043001
[考研] 22408 331分求调剂 +4 y__1 2026-04-06 4/200 2026-04-06 17:26 by 土木硕士招生
[考研] 一志愿211生物学280分 求调剂 +5 李rien 2026-04-05 5/250 2026-04-06 10:30 by zhyzzh
[考研] 372分,材料与化工,一志愿湖南大学,求调剂 +3 蓝笺片 2026-04-01 3/150 2026-04-06 09:04 by 无际的草原
[考研] 070300化学学硕311分求调剂 +11 梁富贵险中求 2026-04-04 13/650 2026-04-06 07:24 by houyaoxu
[考研] 化学调剂 +17 艾志恒 2026-04-03 18/900 2026-04-06 07:10 by jj987
[考研] 调剂 +3 李广火 2026-04-05 3/150 2026-04-05 18:57 by 蓝云思雨
[考研] 282求调剂 +7 aaa车辆 2026-04-02 11/550 2026-04-05 17:24 by yulian1987
[考研] 284求调剂 +7 徐同学_001 2026-04-04 13/650 2026-04-05 17:19 by yulian1987
[考研] 288求调剂,一志愿华南理工大学071005 +6 ioodiiij 2026-04-04 6/300 2026-04-05 10:09 by guoweigw
[考研] 324求调剂 +9 想上学求调 2026-04-03 9/450 2026-04-04 23:57 by 果冻大王
[考研] 专硕310求调剂 +5 捞捞我…. 2026-04-04 6/300 2026-04-04 23:33 by barlinike
[考研] 282电子信息0854专硕调剂 +4 202451007219 2026-04-02 6/300 2026-04-04 21:55 by laoshidan
[考研] 材料调剂 +12 一样YWY 2026-04-02 13/650 2026-04-04 20:49 by 蓝云思雨
[考研] 数二英二348求调剂 +4 hxdzj1 2026-04-03 5/250 2026-04-03 21:25 by zhq0425
[考研] 材料科学与工程339求调剂 +12 hyz0119 2026-03-31 13/650 2026-04-03 18:33 by ls刘帅
[考研] 生物学327,求调剂 +5 书上的梅子 2026-04-01 6/300 2026-04-02 06:47 by ilovexiaobin
[考研] 262求调剂 +9 励志一定发文章 2026-03-31 10/500 2026-04-01 12:22 by sunshine0013
信息提示
请填处理意见