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【求助】pdb文件转换成gjf文件问题
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sunzhiguo
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[交流]
【求助】pdb文件转换成gjf文件问题
已有3人参与
请教大家:1、从MS中截取分子筛模型,export存为pdb文件,然后用gview打 开 键很乱,还有虚键,请问做高斯计算前需不需要将其处理成单键?
2、用氢原子饱和悬断键,固定Si-H键长,请问除逐个修改,有没有其他办法?
多谢回答。好人一生平安。
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2010-10-09 10:14:13
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quantumor
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小木虫(金币
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):给个红包,谢谢回帖交流
MS本身就有Dmol,可以做很多事情的,干嘛要拐个弯再做Gaussian呢?
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愿好运与快乐伴随你!
4楼
2010-10-10 14:48:28
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erylingjet
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zhou2009(金币+2): 2010-10-10 16:42:43
1。不需要
2。自动加氢
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2010-10-09 16:49:03
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sunzhiguo
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Originally posted by
erylingjet
at 2010-10-09 16:49:03:
1。不需要
2。自动加氢
多谢。是在MS中自动加氢吗?自动加氢后怎么确定Si-H键的键长为0.146nm?
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3楼
2010-10-10 11:14:20
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Originally posted by
quantumor
at 2010-10-10 14:48:28:
MS本身就有Dmol,可以做很多事情的,干嘛要拐个弯再做Gaussian呢?
因为要做ONIOM,而且只有高斯的版权。多谢参与。
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5楼
2010-10-10 14:55:05
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