24小时热门版块排行榜    

查看: 1998  |  回复: 7

liuyusuc

禁虫 (正式写手)

本帖内容被屏蔽

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

abdoman

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
御剑江湖(金币+4): 谢谢 2011-10-18 20:18:07
gaussview 可以自动加氢。
但是氨基酸残基加氢感觉是按照溶液状态的加的。
比如,ARG自动加氢会带一个正电,而GLU 会有2个羰基负离子。
Youcompleteme.
2楼2011-10-18 16:17:59
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

abdoman

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
御剑江湖(金币+2): 谢谢 2011-10-20 09:38:18
纠正一下:GLU 会带有2个羧酸根。
Youcompleteme.
3楼2011-10-18 16:18:32
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

liuyusuc

禁虫 (正式写手)

本帖内容被屏蔽

4楼2011-10-18 16:27:23
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

liuyusuc

禁虫 (正式写手)

本帖内容被屏蔽

5楼2011-10-18 16:29:48
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

liuyusuc

禁虫 (正式写手)

本帖内容被屏蔽

6楼2011-10-18 16:31:26
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wangyan10

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
御剑江湖(金币+3): 谢谢 2011-10-20 09:38:32
个人感觉,pdb文件中缺少的氢原子可以用很多途径来加上。图形化可视界面的DS以及AMBER都可以实现的。
努力的生活着
7楼2011-10-18 21:58:08
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

abdoman

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
liuyusuc(金币+2): 感谢您的帮助! 2011-10-19 21:15:13
御剑江湖(金币+4): 谢谢 2011-10-20 09:38:42
引用回帖:
5楼: Originally posted by liuyusuc at 2011-10-18 16:29:48:
怎么出现乱码了呢。我是想要问一下这种加氢的操作可以使用Gromacs实现吗?

你既然有这种“特殊要求”。可以直接google啊
我不懂gromacs。
但是
http://manual.gromacs.org/online/pdb2gmx.html
这个貌似可以!
Youcompleteme.
8楼2011-10-19 17:07:43
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 liuyusuc 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 085600材料与化工306 +4 z1z2z3879 2026-03-21 4/200 2026-03-21 23:44 by ms629
[考研] 考研化学学硕调剂,一志愿985 +5 张vvvv 2026-03-15 7/350 2026-03-21 19:23 by ColorlessPI
[考研] 0703化学调剂 +11 妮妮ninicgb 2026-03-15 15/750 2026-03-21 19:15 by ColorlessPI
[考研] 一志愿深大,0703化学,总分302,求调剂 +4 七月-七七 2026-03-21 4/200 2026-03-21 18:20 by 学员8dgXkO
[考研] 298求调剂 +4 上岸6666@ 2026-03-20 4/200 2026-03-21 17:14 by 学员8dgXkO
[考研] 生物学一志愿985,分数349求调剂 +3 zxts12 2026-03-21 3/150 2026-03-21 16:34 by 33来了真来了
[考研] 279求调剂 +5 红衣隐官 2026-03-21 5/250 2026-03-21 14:59 by lature00
[考研] 279分求调剂 一志愿211 +14 chaojifeixia 2026-03-19 15/750 2026-03-21 13:24 by zhukairuo
[考研] 301求调剂 +10 yy要上岸呀 2026-03-17 10/500 2026-03-21 03:14 by JourneyLucky
[考研] 一志愿华南师大 070300(化学)304分求调剂 +3 0703武芊慧雪304 2026-03-18 3/150 2026-03-21 00:48 by JourneyLucky
[考研] 330求调剂 +4 小材化本科 2026-03-18 4/200 2026-03-20 23:13 by JourneyLucky
[考研] 中南大学化学学硕337求调剂 +3 niko- 2026-03-19 6/300 2026-03-20 21:58 by luoyongfeng
[考研] 295复试调剂 +8 简木ChuFront 2026-03-19 8/400 2026-03-20 20:44 by zhukairuo
[考研] 一志愿华中农业071010,总分320求调剂 +3 困困困困坤坤 2026-03-20 3/150 2026-03-20 20:38 by 学员8dgXkO
[考研] 一志愿中国海洋大学,生物学,301分,求调剂 +5 1孙悟空 2026-03-17 6/300 2026-03-19 23:46 by zcl123
[考研] 本科郑州大学物理学院,一志愿华科070200学硕,346求调剂 +4 我不是一根葱 2026-03-18 4/200 2026-03-19 09:11 by 浮云166
[考研] 085601专硕,总分342求调剂,地区不限 +5 share_joy 2026-03-16 5/250 2026-03-18 14:48 by haxia
[考研] 326求调剂 +5 上岸的小葡 2026-03-15 6/300 2026-03-17 17:26 by ruiyingmiao
[考研] 材料工程专硕274一志愿211求调剂 +6 薛云鹏 2026-03-15 6/300 2026-03-17 11:05 by 学员h26Tkc
[考研] 11408 一志愿西电,277分求调剂 +3 zhouzhen654 2026-03-16 3/150 2026-03-17 07:03 by laoshidan
信息提示
请填处理意见