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珍维永久

金虫 (小有名气)

[求助] 求助:计算两个原子之间的距离 已有2人参与

各位大侠:
       请问有谁知道Discovery Studio软件能否计算两个化合物特定构象中两个原子之间的距离呢?(其中两个化合物的空间位置是一定的),如果能计算,该怎么计算呢,能否告诉具体步骤呢?不胜感激!
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飓风gt

金虫 (著名写手)


月只蓝: 金币+1, 鼓励交流 2015-02-28 15:25:42
能不能建坐标系

[ 发自小木虫客户端 ]
感谢木虫子当我红娘
2楼2015-02-27 15:36:19
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xuxm03

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
这个不需要DS,放在纸上自己拿笔应该可以算的,或者计算器算得准一点。再不成贴到excel里。搞不懂为啥计算个距离还要用DS
3楼2015-02-27 20:05:53
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珍维永久

金虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 飓风gt at 2015-02-27 15:36:19
能不能建坐标系

DS可以建坐标系吗?

[ 发自小木虫客户端 ]
4楼2015-02-27 20:37:24
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珍维永久

金虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by xuxm03 at 2015-02-27 20:05:53
这个不需要DS,放在纸上自己拿笔应该可以算的,或者计算器算得准一点。再不成贴到excel里。搞不懂为啥计算个距离还要用DS

其中一个化合物是对接到蛋白中的,另一个化合物是蛋白上的一个自身配体,想计算这两个化合物中两个原子的距离,请问这怎么计算呢?

[ 发自小木虫客户端 ]
5楼2015-02-27 20:41:22
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ChemiAndy

木虫 (正式写手)


6楼2015-02-28 03:46:25
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飓风gt

金虫 (著名写手)

引用回帖:
6楼: Originally posted by ChemiAndy at 2015-02-28 03:46:25
{r=\sqrt{(X_1-X_2)^2+(Y_1-Y-2)^2+(Z_1-Z_2)^2}}

还是要建系

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感谢木虫子当我红娘
7楼2015-02-28 07:13:27
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珍维永久

金虫 (小有名气)

引用回帖:
6楼: Originally posted by ChemiAndy at 2015-02-28 03:46:25
{r=\sqrt{(X_1-X_2)^2+(Y_1-Y-2)^2+(Z_1-Z_2)^2}}

请问DS中怎么建系呢?
8楼2015-02-28 13:33:13
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飓风gt

金虫 (著名写手)

引用回帖:
8楼: Originally posted by 珍维永久 at 2015-02-28 13:33:13
请问DS中怎么建系呢?...

试试material studio

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感谢木虫子当我红娘
9楼2015-02-28 19:27:10
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pymol

捐助贵宾 (正式写手)


【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
用pymol软件计算吧,在同一个界面中打开两个配体,直接测定就好了!
10楼2015-03-02 11:02:08
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