应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » 高斯计算中的原子分层问题
141/2返回列表12下一页
查看: 2558  |  回复: 13
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

sujialing

木虫 (小有名气)

[求助] 高斯计算中的原子分层问题 已有2人参与

有人用过高斯里面的原子分层吗？
我最近在做，遇到一些问题，我参照高斯里面给的那个例子做的，我想着也把负电荷集中到配体上，但是总是出错，我没想明白哪里错误。改了几次还是不行。一下是我的输入文件，
%chk=5_C2v.chk
%mem=8GB
%nprocshared=4
#p pbe1pbe/cc-pvtz guess=(only,fragment=6) geom=connectivity 5d

Title Card Required

-3 5 2 1 -1 1 -1 1 -1 1 -1 1 -1 1
O(Fragment=1)  
Fe(Fragment=1)     1            B1
F(Fragment=2)      2            B2    1            A1
F(Fragment=3)      2            B3    1            A2    3            D1    0
F(Fragment=6)      2            B4    1            A3    3            D2    0
F(Fragment=5)      2            B5    1            A4    3            D3    0
F(Fragment=4)      2            B6    3            A5    1            D4    0
。。。。。
报错提示：
End of file reading connectivity.
Error termination via Lnk1e in /home/liuk/Soft/g09/l101.exe
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
越努力，越幸运！
1楼 2014-01-14 16:00:51
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jyzhao1981

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
sujialing: 金币+2 2014-01-15 14:03:13
End of file reading connectivity.，你把关键词那一行中的geom=connectivity删掉看看
赞一下 回复此楼
人生需要多少等待？
2楼2014-01-14 17:19:21
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

sujialing

木虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by jyzhao1981 at 2014-01-14 17:19:21
End of file reading connectivity.，你把关键词那一行中的geom=connectivity删掉看看

我试过了，不加那个也不行。
赞一下 回复此楼
越努力，越幸运！
3楼2014-01-14 18:15:55
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

枪下游魂

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
sujialing: 金币+3 2014-01-15 14:05:29
不加geom=connectivity是报什么错误？
另外把F的层号按递增排序有没有试过？
赞一下 回复此楼
4楼2014-01-15 08:16:01
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

枪下游魂

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

还有一个办法是把你的gjf放到GV里看看出来的分子是怎么样的
赞一下 回复此楼
5楼2014-01-15 08:19:01
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

sujialing

木虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by 枪下游魂 at 2014-01-15 08:16:01
不加geom=connectivity是报什么错误？
另外把F的层号按递增排序有没有试过？

报错信息是一样的，我实在是整不明白了。我试着把每个F都分成一层，来将负电荷控制在F上，也不行，就出现FileIO错误了。我已经晕了....
赞一下 回复此楼
越努力，越幸运！
6楼2014-01-15 14:05:16
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

枪下游魂

木虫 (著名写手)
引用回帖:
6楼: Originally posted by sujialing at 2014-01-15 14:05:16
报错信息是一样的，我实在是整不明白了。我试着把每个F都分成一层，来将负电荷控制在F上，也不行，就出现FileIO错误了。我已经晕了.......

把你的完整的输入文件贴出来看看
赞一下 回复此楼
7楼2014-01-15 17:01:22
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

sujialing

木虫 (小有名气)
引用回帖:
7楼: Originally posted by 枪下游魂 at 2014-01-15 17:01:22
把你的完整的输入文件贴出来看看...

好的， 这个是单重态的，一直是FileIO错误。
%chk=1_F_C4v.chk
%mem=8GB
%nprocshared=4
#p PBE1PBE/cc-pvtz  guess=(fragment=2,only)  pop=none  scf=nosymm 5d

Title Card Required

-3 1 2 1 -5 1
O(Fragment=1)  
Fe(Fragment=1)     1            B1
F(Fragment=2)      2            B2    1            A1
F(Fragment=2)      2            B3    1            A2    3            D1    0
F(Fragment=2)      2            B4    3            A3    1            D2    0
F(Fragment=2)      2            B5    1            A4    3            D3    0
F(Fragment=2)      2            B6    1            A5    3            D4    0

   B1             1.61847975
   B2             2.20393072
   B3             2.20393072
   B4             2.16220552
   B5             2.20393072
   B6             2.20393072
   A1            88.87070187
   A2            88.87070187
   A3            91.12929813
   A4            88.87070187
   A5            88.87070187
   D1           -90.00000000
   D2          -180.00000000
   D3          -180.00000000
   D4            90.00000000
赞一下 回复此楼
越努力，越幸运！
8楼2014-01-16 09:14:26
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lily_13

金虫 (初入文坛)
我也想学习gaussian
赞一下 回复此楼
9楼2014-01-16 10:22:18
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

枪下游魂

木虫 (著名写手)
★
gmy1990: 金币+1 2014-01-17 00:42:42
引用回帖:
8楼: Originally posted by sujialing at 2014-01-16 09:14:26
好的， 这个是单重态的，一直是FileIO错误。
%chk=1_F_C4v.chk
%mem=8GB
%nprocshared=4
#p PBE1PBE/cc-pvtz  guess=(fragment=2,only)  pop=none  scf=nosymm 5d

Title Card Required

-3 1 2 1 -5 1
  ...

#p PBE1PBE/cc-pvtz guess=(fragment=2,only) pop=none scf=nosymm 5d

Title Card Required

-4 2 1 2 -5 1
O(Fragment=1)  
Fe(Fragment=1)     1            B1
F(Fragment=2)      2            B2    1            A1
F(Fragment=2)      2            B3    1            A2    3            D1    0
F(Fragment=2)      2            B4    3            A3    1            D2    0
F(Fragment=2)      2            B5    1            A4    3            D3    0
F(Fragment=2)      2            B6    1            A5    3            D4    0

B1             1.61847975
B2             2.20393072
B3             2.20393072
B4             2.16220552
B5             2.20393072
B6             2.20393072
A1            88.87070187
A2            88.87070187
A3            91.12929813
A4            88.87070187
A5            88.87070187
D1           -90.00000000
D2           -180.00000000
D3           -180.00000000
D4            90.00000000

我改成这样不会报结构和输入的错误，只是最后会说你所用的方法算不了
赞一下 回复此楼
10楼2014-01-16 11:28:05
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 sujialing 的主题更新
141/2返回列表12下一页
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] NSFC申报书里申请人简历中代表性论著还需要在申报书最后的附件里面再上传一遍吗 20+5 NSFC2026我来了 2026-03-10 14/700 2026-03-15 23:53 by 不负韶华的虎
[考研] 机械专硕调剂 +3 笨笨兔子 2026-03-12 3/150 2026-03-15 20:02 by 栗子粥?
[考研] 化学工程321分求调剂 +5 大米饭！ 2026-03-15 5/250 2026-03-15 18:49 by a不易
[考研] 材料工程327求调剂 +3 xiaohe12w 2026-03-11 3/150 2026-03-14 20:20 by ms629
[考研] 复试调剂 +4 z1z2z3879 2026-03-14 5/250 2026-03-14 16:30 by JourneyLucky
[考研] 求调剂 +5 鹤遨予卿 2026-03-09 5/250 2026-03-14 02:44 by JourneyLucky
[考研] 求调剂，药学 +3 归零lbm 2026-03-09 5/250 2026-03-14 02:21 by JourneyLucky
[考研] 一志愿北京化工大学材料与化工296分求调剂 +16 稻妻小编 2026-03-09 18/900 2026-03-14 02:00 by JourneyLucky
[考研] 307求调剂 +7 超级伊昂大王 2026-03-10 7/350 2026-03-14 00:49 by JourneyLucky
[考研] 0805，333求调剂 +3 112253525 2026-03-10 3/150 2026-03-13 23:42 by JourneyLucky
[考研] 材料371求调剂 +9 鳄鱼? 2026-03-11 11/550 2026-03-13 22:53 by JourneyLucky
[考研] 一志愿中科院，化学方向，295求调剂 +4 一氧二氮 2026-03-11 4/200 2026-03-13 22:35 by JourneyLucky
[考研] 314求调剂 +7 无懈可击的巨人 2026-03-12 7/350 2026-03-13 15:40 by JourneyLucky
[考研] 304求调剂（085602一志愿985） +12 化工人999 2026-03-09 12/600 2026-03-13 12:02 by JourneyLucky
[考研] 0856化学工程280分求调剂 +4 shenzxsn 2026-03-11 4/200 2026-03-13 11:55 by ymwdoctor
[考研] 070303一志愿西北大学学硕310找调剂 +3 d如愿上岸 2026-03-13 3/150 2026-03-13 10:43 by houyaoxu
[考博] 读博申请 +5 感dd 2026-03-10 7/350 2026-03-11 17:02 by QGZDSYS
[考研] 调剂 +5 呵唔哦豁 2026-03-10 5/250 2026-03-10 22:00 by 28375m
[考研] 收调剂 +7 调剂的考研学生 2026-03-10 7/350 2026-03-10 17:57 by 麦茶汤圆
[考研] 0703化学调剂 +3 三dd. 2026-03-10 3/150 2026-03-10 15:45 by peike
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭