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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » 高斯计算中的原子分层问题
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sujialing

木虫 (小有名气)

[求助] 高斯计算中的原子分层问题已有2人参与

有人用过高斯里面的原子分层吗？
我最近在做，遇到一些问题，我参照高斯里面给的那个例子做的，我想着也把负电荷集中到配体上，但是总是出错，我没想明白哪里错误。改了几次还是不行。一下是我的输入文件，
%chk=5_C2v.chk
%mem=8GB
%nprocshared=4
#p pbe1pbe/cc-pvtz guess=(only,fragment=6) geom=connectivity 5d

Title Card Required

-3 5 2 1 -1 1 -1 1 -1 1 -1 1 -1 1
O(Fragment=1)  
Fe(Fragment=1)     1            B1
F(Fragment=2)      2            B2    1            A1
F(Fragment=3)      2            B3    1            A2    3            D1    0
F(Fragment=6)      2            B4    1            A3    3            D2    0
F(Fragment=5)      2            B5    1            A4    3            D3    0
F(Fragment=4)      2            B6    3            A5    1            D4    0
。。。。。
报错提示：
End of file reading connectivity.
Error termination via Lnk1e in /home/liuk/Soft/g09/l101.exe
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越努力，越幸运！
1楼2014-01-14 16:00:51
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枪下游魂

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
sujialing: 金币+3 2014-01-15 14:05:29
不加geom=connectivity是报什么错误？
另外把F的层号按递增排序有没有试过？
赞一下 回复此楼
4楼2014-01-15 08:16:01
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
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jyzhao1981

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
sujialing: 金币+2 2014-01-15 14:03:13
End of file reading connectivity.，你把关键词那一行中的geom=connectivity删掉看看
赞一下 回复此楼
人生需要多少等待？
2楼2014-01-14 17:19:21
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sujialing

木虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by jyzhao1981 at 2014-01-14 17:19:21
End of file reading connectivity.，你把关键词那一行中的geom=connectivity删掉看看

我试过了，不加那个也不行。
赞一下 回复此楼
越努力，越幸运！
3楼2014-01-14 18:15:55
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枪下游魂

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

还有一个办法是把你的gjf放到GV里看看出来的分子是怎么样的
赞一下 回复此楼
5楼2014-01-15 08:19:01
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