应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » MS » 【求助】MS里建的模型只有原子，没有键啊
101/1返回列表
查看: 4473  |  回复: 9
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

cuimingshan

金虫 (小有名气)

[交流] 【求助】MS里建的模型只有原子，没有键啊 已有8人参与

貌似看到过相似的问题 找不到了  请教大虾！
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
不逼自己一把不知道自己多么优秀！
1楼 2010-10-20 17:43:07
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

shelay

木虫 (正式写手)
★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
aylayl08(金币+1):谢谢回复 2010-10-22 15:08:00
你看看基础教程啊，这些是最基本的呢！
赞一下(2人) 回复此楼
2楼2010-10-20 17:47:17
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jphuang_63

至尊木虫 (正式写手)

MS里建的模型只有原子，没有键啊

★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
mazuju028(金币+1):呵呵，谢谢交流。 2010-10-20 19:34:21
的确是只有原子，没有键。能不能成键是由两种元素的化学电负性决定的，不是所有的两种元素在一起就能形成化学键。MS就是要算能不能成键。
赞一下(2人) 回复此楼
互助学习,共同进步!
3楼2010-10-20 17:49:08
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

麒麟半仙

木虫 (小有名气)
★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
mazuju028(金币+2):谢谢交流 2010-10-20 19:34:37
aylayl08(金币+1):谢谢解释 2010-10-20 19:37:05
点build里的build bonds，然后点calculate。
如果仍然没有成键，说明按照你指定的数据库，你建的模型之中原子的距离是被认为是不成共价键的。
赞一下(3人) 回复此楼
神啊，让我成仙吧。
4楼2010-10-20 18:20:36
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

匿名

用户注销 (职业作家)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
本帖仅楼主可见
赞一下
5楼2010-10-21 08:20:27
已阅   申请1ST强帖   回复此楼   编辑   查看我的主页

cash_ms

木虫 (正式写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
引用回帖:
Originally posted by 麒麟半仙 at 2010-10-20 18:20:36:
点build里的build bonds，然后点calculate。
如果仍然没有成键，说明按照你指定的数据库，你建的模型之中原子的距离是被认为是不成共价键的。

问老师们，calculate这个键的时候，那个键长的范围怎么选择？？
虽然成不成键，并不是看上去连接在一起否
怎么判断成键？？电子密度差分图？？布局分析？？dos？？
赞一下(2人) 回复此楼
6楼2010-10-21 08:34:02
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

薛金祥

金虫 (小有名气)
★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
zxzj05(金币+1):参与奖励！ 2010-10-21 12:31:16
原子之间有一个距离，这个距离要是太大的话肯定不会是化学键了，可能只是物理吸附
赞一下(2人) 回复此楼
7楼2010-10-21 08:50:34
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

chimegreen

木虫 (正式写手)

Dr.
★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
zzy870720z(金币+1):谢谢补充 2010-10-21 10:30:32
引用回帖:
Originally posted by 麒麟半仙 at 2010-10-20 18:20:36:
点build里的build bonds，然后点calculate。
如果仍然没有成键，说明按照你指定的数据库，你建的模型之中原子的距离是被认为是不成共价键的。

就是这位朋友所说的来calculate键。

当然我想补充一下，dmol里面两个原子之间有没有键也不代表什么，还要从电子结构来分析，不像高斯，计算出来的结果已经按照某种规则，判别好了是双键还是单键之类的。
赞一下(2人) 回复此楼
快乐科研，快乐生活。
8楼2010-10-21 08:52:23
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

麒麟半仙

木虫 (小有名气)
★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
zxzj05(金币+1):参与奖励！ 2010-10-21 12:31:26
引用回帖:
Originally posted by chimegreen at 2010-10-21 08:52:23:


就是这位朋友所说的来calculate键。

当然我想补充一下，dmol里面两个原子之间有没有键也不代表什么，还要从电子结构来分析，不像高斯，计算出来的结果已经按照某种规则，判别好了是双键还是单键之类的。

同意楼上，判断原子间相互作用的标准不只是看它们成不成键。关键是之间的电子结构。
在MS里的calculate 键，应该是依据数据库，根据原子间距离判断两个原子是成单键，双键或不成键的。在MS里画图的时候，画不画键都是没关系的，只要距离一样都是等价的。只是显示效果的不同而已。
赞一下(2人) 回复此楼
神啊，让我成仙吧。
9楼2010-10-21 12:18:13
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

fzx2008

荣誉版主 (著名写手)

优秀版主优秀版主
★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
zxzj05(金币+1):参与奖励！ 2010-10-21 12:31:38
"MS里建的模型只有原子，没有键"

没有关系的。只是显示的问题。
计算只跟单胞内原子坐标有关。
赞一下(2人) 回复此楼
10楼2010-10-21 12:21:27
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 cuimingshan 的主题更新
101/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 明天应该可查了！？ +5 chengyan1220 2026-08-23 5/250 2026-08-24 23:28 by 我4大白菜
[基金申请] 没有任何消息-是不是就凉了 +7 图啦图啦 2026-08-24 8/400 2026-08-24 22:00 by maomao_da
[论文投稿] 售SCI-T0P文章，我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 0XLacIJUOj8D 2026-08-24 3/150 2026-08-24 21:59 by BZKMTicpDhFj
[基金申请] 人气不行了 +10 fansofjerry 2026-08-21 10/500 2026-08-24 21:03 by zhanghaozhu
[基金申请] 能否退出参与的面上项目解除限项 +21 koalala 2026-08-24 24/1200 2026-08-24 19:25 by 家与远方
[基金申请] 2026国自然函评费到账 +17 羊腰板 2026-08-21 19/950 2026-08-24 16:52 by iaeyuan
[基金申请] 建议基金发布提前给出明确的时间点 +13 kulium 2026-08-21 16/800 2026-08-24 16:27 by superceng
[基金申请] 今日不放榜？网传国自然预计 8 月 27 日可查结果 +17 医学老男孩 2026-08-20 21/1050 2026-08-24 14:21 by refreshing11
[基金申请] 朋友圈看到的 +7 wangzilk 2026-08-18 9/450 2026-08-24 10:50 by cmrandy
[基金申请] 让我中一个面上吧！ +13 大萍1987 2026-08-20 16/800 2026-08-24 10:23 by 太傻了
[基金申请] 放榜前的不淡定 20+4 snowwithsea 2026-08-19 17/850 2026-08-24 10:20 by echo8914667
[教师之家] 跳槽后在研项目怎么办？ +5 简单化xn 2026-08-22 10/500 2026-08-23 12:38 by 简单化xn
[基金申请] 今天放榜吗？ +15 布布和一二 2026-08-19 16/800 2026-08-23 09:55 by 张春生
[基金申请] 只有每年这种时候来逛逛小木虫 +24 yaoyewhu2008 2026-08-20 26/1300 2026-08-22 17:43 by kammury
[基金申请] 今天基金会出结果吗？20260819 +16 kkkl_v 2026-08-19 17/850 2026-08-22 16:12 by 阿布Abu
[基金申请] 看来今天不会放榜了？ +8 chengyan1220 2026-08-21 11/550 2026-08-21 17:52 by dcqxinyang
[基金申请] 时间戳又变了 +13 wuchongjun 2026-08-20 19/950 2026-08-21 17:21 by 紫杉醇
[基金申请] 应该是下周三26日公布了吧？ +4 哈哈蛤？ 2026-08-21 4/200 2026-08-21 10:58 by Vivilian
[基金申请] 今天放榜没戏了吧 +9 yuleib84 2026-08-19 11/550 2026-08-21 10:06 by gltch
[基金申请] 基金啊基金 +4 longfie172 2026-08-20 4/200 2026-08-21 08:58 by mark mao
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭