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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » MS » 【求助】MS里建的模型只有原子，没有键啊
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cuimingshan

金虫 (小有名气)

[交流] 【求助】MS里建的模型只有原子，没有键啊 已有8人参与

貌似看到过相似的问题 找不到了  请教大虾！
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不逼自己一把不知道自己多么优秀！
1楼 2010-10-20 17:43:07
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shelay

木虫 (正式写手)
★ ★
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aylayl08(金币+1):谢谢回复 2010-10-22 15:08:00
你看看基础教程啊，这些是最基本的呢！
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2楼2010-10-20 17:47:17
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jphuang_63

至尊木虫 (正式写手)

MS里建的模型只有原子，没有键啊

★ ★
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mazuju028(金币+1):呵呵，谢谢交流。 2010-10-20 19:34:21
的确是只有原子，没有键。能不能成键是由两种元素的化学电负性决定的，不是所有的两种元素在一起就能形成化学键。MS就是要算能不能成键。
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互助学习,共同进步!
3楼2010-10-20 17:49:08
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麒麟半仙

木虫 (小有名气)
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mazuju028(金币+2):谢谢交流 2010-10-20 19:34:37
aylayl08(金币+1):谢谢解释 2010-10-20 19:37:05
点build里的build bonds，然后点calculate。
如果仍然没有成键，说明按照你指定的数据库，你建的模型之中原子的距离是被认为是不成共价键的。
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神啊，让我成仙吧。
4楼2010-10-20 18:20:36
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匿名

用户注销 (职业作家)
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5楼2010-10-21 08:20:27
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cash_ms

木虫 (正式写手)
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引用回帖:
Originally posted by 麒麟半仙 at 2010-10-20 18:20:36:
点build里的build bonds，然后点calculate。
如果仍然没有成键，说明按照你指定的数据库，你建的模型之中原子的距离是被认为是不成共价键的。

问老师们，calculate这个键的时候，那个键长的范围怎么选择？？
虽然成不成键，并不是看上去连接在一起否
怎么判断成键？？电子密度差分图？？布局分析？？dos？？
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6楼2010-10-21 08:34:02
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薛金祥

金虫 (小有名气)
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zxzj05(金币+1):参与奖励！ 2010-10-21 12:31:16
原子之间有一个距离，这个距离要是太大的话肯定不会是化学键了，可能只是物理吸附
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7楼2010-10-21 08:50:34
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chimegreen

木虫 (正式写手)

Dr.
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zzy870720z(金币+1):谢谢补充 2010-10-21 10:30:32
引用回帖:
Originally posted by 麒麟半仙 at 2010-10-20 18:20:36:
点build里的build bonds，然后点calculate。
如果仍然没有成键，说明按照你指定的数据库，你建的模型之中原子的距离是被认为是不成共价键的。

就是这位朋友所说的来calculate键。

当然我想补充一下，dmol里面两个原子之间有没有键也不代表什么，还要从电子结构来分析，不像高斯，计算出来的结果已经按照某种规则，判别好了是双键还是单键之类的。
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快乐科研，快乐生活。
8楼2010-10-21 08:52:23
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麒麟半仙

木虫 (小有名气)
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zxzj05(金币+1):参与奖励！ 2010-10-21 12:31:26
引用回帖:
Originally posted by chimegreen at 2010-10-21 08:52:23:


就是这位朋友所说的来calculate键。

当然我想补充一下，dmol里面两个原子之间有没有键也不代表什么，还要从电子结构来分析，不像高斯，计算出来的结果已经按照某种规则，判别好了是双键还是单键之类的。

同意楼上，判断原子间相互作用的标准不只是看它们成不成键。关键是之间的电子结构。
在MS里的calculate 键，应该是依据数据库，根据原子间距离判断两个原子是成单键，双键或不成键的。在MS里画图的时候，画不画键都是没关系的，只要距离一样都是等价的。只是显示效果的不同而已。
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神啊，让我成仙吧。
9楼2010-10-21 12:18:13
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fzx2008

荣誉版主 (著名写手)

优秀版主优秀版主
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zxzj05(金币+1):参与奖励！ 2010-10-21 12:31:38
"MS里建的模型只有原子，没有键"

没有关系的。只是显示的问题。
计算只跟单胞内原子坐标有关。
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10楼2010-10-21 12:21:27
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