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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » MS » 【求助】MS建模替换原子
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liangping3881

金虫 (小有名气)

[交流] 【求助】MS建模替换原子 已有4人参与

MS软件建模时如何替换原子。
    例如把模型中一个C原子换成S原子
           谢谢！！！11
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1楼 2010-03-15 21:37:27
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回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

souledge

专家顾问 (著名写手)
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cenwanglai(金币+2):谢谢分享.做supercell后,如果你替换顶点的一个原子,也会替换掉等价位置的原子的. 2010-06-12 09:09:20
引用回帖:
Originally posted by icyspace at 2010-03-23 11:53:12:
3*3*3和可能可以的啊~你试试呗，铝的2*2*2的替换最中心的那个原子可以的~

测试了，的确可以只替换一个，不过步骤不是Make P1，而是做一个超晶。由于机器性能比较次，只实验了一下2*2*2的Au（因为金色的比较赏心悦目）的结构。
首先导入Au的结构图：

然后显示2*2*2的点阵，呃~机器卡了一把，可怜~

然后制作一个2*2*2的超晶：

这时可以看到，整个2*2*2的点阵成了一个大晶胞：

选择其中一个，更换为铁（蓝紫色那个），其他的没有变化：

再说一下如果是使用Make P1的结果，这个会把顶点位置和面心位置的Au区别对待（不Make P1时所有的Au一起被替换）：
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思想重于技巧，内涵重于表象
21楼2010-03-23 12:55:07
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zhenjiemo

新虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
先选那个原子，再在图片所示位置改，最方便。
【求助】MS建模替换原子
1.jpg
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24楼2014-03-17 22:00:40
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普通回帖

uuv2010

荣誉版主 (职业作家)

优秀版主
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ice_rain(金币+1):谢谢指点 2010-03-15 22:57
选择欲替换的原子
然后
modify->modify element
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2楼2010-03-15 22:04:55
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enola

捐助贵宾 (正式写手)
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引用回帖:
Originally posted by liangping3881 at 2010-03-15 21:37:27:
MS软件建模时如何替换原子。
    例如把模型中一个C原子换成S原子
           谢谢！！！11

有可能把周期中相关的都替换啦，还要mp1下吧
还是去掉周期啊？
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timeflies..
3楼2010-03-15 22:38:14
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icyspace

金虫 (小有名气)
★
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make p1 也不可以，这样因为原有的空间群的关系，删掉一个还是会删掉同位置的其他原子，关注！
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4楼2010-03-16 09:07:51
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aylayl08

荣誉版主 (文坛精英)

至尊天蝎

优秀版主
★
wuli8(金币+1):3ks 2010-03-16 22:33
先make P1再掺
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珍惜拥有，快乐人生!欢迎光临计算模拟区(*^__^*)。。。。。。。。。。。。。。
5楼2010-03-16 09:32:39
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锐利的碎片

木虫 (正式写手)

star watcher
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wuli8(金币+1):3ks 2010-03-16 22:34
选择要替换的原子。注意不要用菜单里的修改（那样就连包含对称性的都改了），在左边属性窗口里找到元素名点击修改就行了。也可以去掉体系对称性再改。
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6楼2010-03-16 10:48:02
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icyspace

金虫 (小有名气)
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引用回帖:
Originally posted by icyspace at 2010-03-16 09:07:51:
make p1 也不可以，这样因为原有的空间群的关系，删掉一个还是会删掉同位置的其他原子，关注！

比如说面心立方的Al，我想把坐标为（0，0，0）的Al原子换成Ti，只是打个比方，先make P1，再进行替换，可是还是将其位置的Al都替换了。（我用的MS自带的Al的模型）~
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7楼2010-03-22 01:41:31
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cocolv

木虫 (正式写手)
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cenwanglai(金币+2):对的 2010-06-12 09:06:41
引用回帖:
Originally posted by icyspace at 2010-03-22 01:41:31:


比如说面心立方的Al，我想把坐标为（0，0，0）的Al原子换成Ti，只是打个比方，先make P1，再进行替换，可是还是将其位置的Al都替换了。（我用的MS自带的Al的模型）~

make P1 之后，结构没有对称性了，但是四个顶点上的Al还是处于等同位置的，这是构建晶胞所必须的，所以替换其中的一个其他顶点上的原子也就跟着改变了，但是面心上的原子不会跟着变，此时它与顶点原子不再具有等同对称性了。
呵呵，个人见解，望高手指点。
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8楼2010-03-22 10:26:16
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cocolv

木虫 (正式写手)
对了，如果是想做掺杂，可以建超胞，再替换。
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9楼2010-03-22 10:28:26
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carlaty

金虫 (正式写手)
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cenwanglai:不一样 2010-06-12 09:07:01
引用回帖:
Originally posted by aylayl08 at 2010-03-16 09:32:39:
先make P1再掺

先掺再make p1和先make p1再掺是一样的吧？
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10楼2010-03-22 10:31:54
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