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liangping3881

金虫 (小有名气)

[交流] 【求助】MS建模替换原子 已有4人参与

MS软件建模时如何替换原子。
    例如把模型中一个C原子换成S原子
           谢谢!!!11
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souledge

专家顾问 (著名写手)

★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
cenwanglai(金币+2):谢谢分享.做supercell后,如果你替换顶点的一个原子,也会替换掉等价位置的原子的. 2010-06-12 09:09:20
引用回帖:
Originally posted by icyspace at 2010-03-23 11:53:12:
3*3*3和可能可以的啊~你试试呗,铝的2*2*2的替换最中心的那个原子可以的~

测试了,的确可以只替换一个,不过步骤不是Make P1,而是做一个超晶。由于机器性能比较次,只实验了一下2*2*2的Au(因为金色的比较赏心悦目)的结构。
首先导入Au的结构图:

然后显示2*2*2的点阵,呃~机器卡了一把,可怜~

然后制作一个2*2*2的超晶:

这时可以看到,整个2*2*2的点阵成了一个大晶胞:

选择其中一个,更换为铁(蓝紫色那个),其他的没有变化:

再说一下如果是使用Make P1的结果,这个会把顶点位置和面心位置的Au区别对待(不Make P1时所有的Au一起被替换):
思想重于技巧,内涵重于表象
21楼2010-03-23 12:55:07
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zhenjiemo

新虫 (小有名气)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
先选那个原子,再在图片所示位置改,最方便。
【求助】MS建模替换原子
1.jpg

24楼2014-03-17 22:00:40
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普通回帖

uuv2010

荣誉版主 (职业作家)

优秀版主

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小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
ice_rain(金币+1):谢谢指点 2010-03-15 22:57
选择欲替换的原子
然后
modify->modify element
2楼2010-03-15 22:04:55
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enola

捐助贵宾 (正式写手)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
引用回帖:
Originally posted by liangping3881 at 2010-03-15 21:37:27:
MS软件建模时如何替换原子。
    例如把模型中一个C原子换成S原子
           谢谢!!!11

有可能把周期中相关的都替换啦,还要mp1下吧
还是去掉周期啊?
timeflies..
3楼2010-03-15 22:38:14
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icyspace

金虫 (小有名气)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
make p1 也不可以,这样因为原有的空间群的关系,删掉一个还是会删掉同位置的其他原子,关注!
4楼2010-03-16 09:07:51
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aylayl08

荣誉版主 (文坛精英)

至尊天蝎

优秀版主


wuli8(金币+1):3ks 2010-03-16 22:33
先make P1再掺
珍惜拥有,快乐人生!欢迎光临计算模拟区(*^__^*)。。。。。。。。。。。。。。
5楼2010-03-16 09:32:39
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锐利的碎片

木虫 (正式写手)

star watcher

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wuli8(金币+1):3ks 2010-03-16 22:34
选择要替换的原子。注意不要用菜单里的修改(那样就连包含对称性的都改了),在左边属性窗口里找到元素名点击修改就行了。也可以去掉体系对称性再改。
6楼2010-03-16 10:48:02
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icyspace

金虫 (小有名气)


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引用回帖:
Originally posted by icyspace at 2010-03-16 09:07:51:
make p1 也不可以,这样因为原有的空间群的关系,删掉一个还是会删掉同位置的其他原子,关注!

比如说面心立方的Al,我想把坐标为(0,0,0)的Al原子换成Ti,只是打个比方,先make P1,再进行替换,可是还是将其位置的Al都替换了。(我用的MS自带的Al的模型)~
7楼2010-03-22 01:41:31
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cocolv

木虫 (正式写手)

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cenwanglai(金币+2):对的 2010-06-12 09:06:41
引用回帖:
Originally posted by icyspace at 2010-03-22 01:41:31:


比如说面心立方的Al,我想把坐标为(0,0,0)的Al原子换成Ti,只是打个比方,先make P1,再进行替换,可是还是将其位置的Al都替换了。(我用的MS自带的Al的模型)~

make P1 之后,结构没有对称性了,但是四个顶点上的Al还是处于等同位置的,这是构建晶胞所必须的,所以替换其中的一个其他顶点上的原子也就跟着改变了,但是面心上的原子不会跟着变,此时它与顶点原子不再具有等同对称性了。
呵呵,个人见解,望高手指点。
8楼2010-03-22 10:26:16
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cocolv

木虫 (正式写手)

对了,如果是想做掺杂,可以建超胞,再替换。
9楼2010-03-22 10:28:26
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carlaty

金虫 (正式写手)


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cenwanglai:不一样 2010-06-12 09:07:01
引用回帖:
Originally posted by aylayl08 at 2010-03-16 09:32:39:
先make P1再掺

先掺再make p1和先make p1再掺是一样的吧?
10楼2010-03-22 10:31:54
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