24小时热门版块排行榜    

北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
查看: 1671  |  回复: 11

贺仪

铁杆木虫 (著名写手)

[求助] 替换晶体中的基团

我想把晶体中的一个基团用另一个基团替换,或者说把其中的分子用另一个分子替换有什么方法?
    我想随机的加入分子,思路是这样的,先利用KMC algorithm在沉积一层膜,这个层沉积只能是原子,用的得到的膜,复制出来放入晶胞,(把原子的膜的文件,的基失加大,得到距离很大),然后用一个分子去替换这类原子,这样就可以的到分子的膜。
    现在的问题是怎么在MS中用一个分子去替换这类原子?有没有人做过?
回复此楼
嘟啦啦嘟啦啦嘟
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

uuv2010

荣誉版主 (职业作家)

优秀版主

★ ★
franch(金币+2): 谢谢回帖交流 2011-08-15 23:45:42
删除不需要的分子,新建需要的分子,复制粘贴,可行?呵呵
2楼2011-08-15 19:52:17
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

贺仪

铁杆木虫 (著名写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by uuv2010 at 2011-08-15 19:52:17:
删除不需要的分子,新建需要的分子,复制粘贴,可行?呵呵

不行呀,复制黏贴,贴过去的坐标和原来模型中分子的坐标一样,多个的话要一个个调,数量大了就太麻烦了
嘟啦啦嘟啦啦嘟
3楼2011-08-15 20:29:54
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

uuv2010

荣誉版主 (职业作家)

优秀版主

★ ★
franch(金币+2): 谢谢回帖交流 2011-08-15 23:45:52
引用回帖:
3楼: Originally posted by 贺仪 at 2011-08-15 20:29:54:
不行呀,复制黏贴,贴过去的坐标和原来模型中分子的坐标一样,多个的话要一个个调,数量大了就太麻烦了

是的,少量个原子的时候替换可以复制粘贴,很多原子的时候调起来很麻烦。
4楼2011-08-15 22:53:38
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

贺仪

铁杆木虫 (著名写手)

不要沉下去!
嘟啦啦嘟啦啦嘟
5楼2011-08-20 13:43:19
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

cenwanglai

荣誉版主 (知名作家)

老和山猥琐派九段

优秀版主

似乎在分子模拟板有个帖子将MS建模型的。MS有自动搜索某类位置的功能。
我找找看。
6楼2011-08-20 14:52:50
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

cenwanglai

荣誉版主 (知名作家)

老和山猥琐派九段

优秀版主

【答案】应助回帖

贺仪(金币+10): 呵呵 谢谢区长提示! 2011-08-20 21:13:45
zyj8119
似乎是这个专家顾问的帖子。但是现在找不到了。记得是一个分子筛的建模。
7楼2011-08-20 15:02:47
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wzbhit

至尊木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

贺仪(金币+5): 多谢你的热心帮助 2011-08-20 21:20:37
引用回帖:
6楼: Originally posted by cenwanglai at 2011-08-20 14:52:50:
似乎在分子模拟板有个帖子将MS建模型的。MS有自动搜索某类位置的功能。
我找找看。

Edit->Find Patterns 可以自动搜索某类位置
从明天开始坚持吃早饭呀!
8楼2011-08-20 15:03:06
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

贺仪

铁杆木虫 (著名写手)

引用回帖:
8楼: Originally posted by wzbhit at 2011-08-20 15:03:06:
Edit->Find Patterns 可以自动搜索某类位置

这个怎么用?
Pattern document :选择要的分子?
match property :ElementType?
这个有点不对劲呀 找不到,没任何变化呀……
大侠 麻烦说的详细点
嘟啦啦嘟啦啦嘟
9楼2011-08-20 21:23:45
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wzbhit

至尊木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
youzhizhe(金币+3): 谢谢交流。 2011-08-24 10:40:59
引用回帖:
9楼: Originally posted by 贺仪 at 2011-08-20 21:23:45:
这个怎么用?
Pattern document :选择要的分子?
match property :ElementType?
这个有点不对劲呀 找不到,没任何变化呀……
大侠 麻烦说的详细点

首先在一个新的xsd文件里画出你要替换的分子结构(被替换的那个分子结构),然后
Pattern document :选择刚才新建的那个文件
match property :ElementType
这样就会标示出要替换单元。自动替换貌似没有这样的功能(这样的功能我是不知道)
从明天开始坚持吃早饭呀!
10楼2011-08-21 09:24:39
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 贺仪 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 材料与化工专硕306分找合适调剂 +6 沧海轻舟e 2026-04-06 6/300 2026-04-06 10:02 by lqwchd
[考研] 277求调剂 数一104分 +6 瓶子PZ 2026-04-05 6/300 2026-04-05 20:38 by 啵啵啵0119
[考研] 080200学硕,机械工程专业277分,求带走! +7 瓶子PZ 2026-03-31 7/350 2026-04-05 17:49 by liucky
[考研] 085600调剂 +9 东照照照 2026-04-04 9/450 2026-04-05 13:44 by ujn_zhuj
[有机交流] 甲醇/二氯 1:15过柱子 5+3 a哎y呦w喂 2026-03-31 3/150 2026-04-05 10:42 by 88817753
[考研] 男生,一志愿沪9生物学071000,初试308求调剂 +3 刘墨墨 2026-04-04 3/150 2026-04-05 08:26 by barlinike
[考研] 专硕310求调剂 +5 捞捞我…. 2026-04-04 6/300 2026-04-04 23:33 by barlinike
[考研] 调剂 +11 JLLLLLLLLLL 2026-04-03 11/550 2026-04-04 22:21 by hemengdong
[考研] 316求调剂 +9 墨辰_Orion926 2026-04-04 9/450 2026-04-04 21:35 by lbsjt
[考研] 277工科求调剂 +7 1915668 2026-04-04 7/350 2026-04-04 17:21 by 啊俊!
[考研] 怎么删帖子啊 +3 缝曦1000 2026-04-04 3/150 2026-04-04 14:20 by 土木硕士招生
[考研] 372分材料与化工(085600)一志愿湖南大学求调剂 +3 蓝笺片 2026-04-03 4/200 2026-04-03 17:58 by Jimmyandyou
[考研] 考研调剂 +3 Draa 2026-04-03 3/150 2026-04-03 17:37 by hgwz7468
[考研] 数一英一285求调剂 +7 AZMK 2026-04-03 9/450 2026-04-03 13:03 by ms629
[考研] 26考研调剂 +4 Wnz.20030617 2026-04-01 5/250 2026-04-02 16:11 by 1939136013狗壮
[考研] 学硕化学工程与技术,一志愿中国海洋大学320+求调剂 +8 披星河 2026-04-02 8/400 2026-04-02 14:12 by oooqiao
[考研] 085602化学工程268分蹲调剂 +8 月照花林。 2026-04-01 8/400 2026-04-01 22:08 by 无际的草原
[考研] 301求调剂 +8 axibli 2026-04-01 8/400 2026-04-01 09:51 by 我的船我的海
[考研] 求调剂,一志愿北林食品与营养095500,301分,已过六级,有科研经历 +4 快乐储蓄罐 2026-03-31 4/200 2026-04-01 09:26 by JourneyLucky
[考研] 293求调剂 +3 末未mm 2026-03-30 5/250 2026-03-30 17:23 by 王保杰33
信息提示
请填处理意见