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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » MS » 替换晶体中的基团
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贺仪

铁杆木虫 (著名写手)

[求助] 替换晶体中的基团

我想把晶体中的一个基团用另一个基团替换，或者说把其中的分子用另一个分子替换有什么方法？
    我想随机的加入分子，思路是这样的，先利用KMC algorithm在沉积一层膜，这个层沉积只能是原子，用的得到的膜，复制出来放入晶胞，（把原子的膜的文件，的基失加大，得到距离很大），然后用一个分子去替换这类原子，这样就可以的到分子的膜。
    现在的问题是怎么在MS中用一个分子去替换这类原子？有没有人做过？
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嘟啦啦嘟啦啦嘟
1楼2011-08-15 10:50:19
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uuv2010

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franch(金币+2): 谢谢回帖交流 2011-08-15 23:45:42
删除不需要的分子，新建需要的分子，复制粘贴，可行？呵呵
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2楼2011-08-15 19:52:17
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uuv2010

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★ ★
franch(金币+2): 谢谢回帖交流 2011-08-15 23:45:52
引用回帖:
3楼: Originally posted by 贺仪 at 2011-08-15 20:29:54:
不行呀，复制黏贴，贴过去的坐标和原来模型中分子的坐标一样，多个的话要一个个调，数量大了就太麻烦了

是的，少量个原子的时候替换可以复制粘贴，很多原子的时候调起来很麻烦。
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4楼2011-08-15 22:53:38
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