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贺仪

铁杆木虫 (著名写手)

[求助] 替换晶体中的基团

我想把晶体中的一个基团用另一个基团替换,或者说把其中的分子用另一个分子替换有什么方法?
    我想随机的加入分子,思路是这样的,先利用KMC algorithm在沉积一层膜,这个层沉积只能是原子,用的得到的膜,复制出来放入晶胞,(把原子的膜的文件,的基失加大,得到距离很大),然后用一个分子去替换这类原子,这样就可以的到分子的膜。
    现在的问题是怎么在MS中用一个分子去替换这类原子?有没有人做过?
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嘟啦啦嘟啦啦嘟
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wzbhit

至尊木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

贺仪(金币+5): 多谢你的热心帮助 2011-08-20 21:20:37
引用回帖:
6楼: Originally posted by cenwanglai at 2011-08-20 14:52:50:
似乎在分子模拟板有个帖子将MS建模型的。MS有自动搜索某类位置的功能。
我找找看。

Edit->Find Patterns 可以自动搜索某类位置
从明天开始坚持吃早饭呀!
8楼2011-08-20 15:03:06
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wzbhit

至尊木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
youzhizhe(金币+3): 谢谢交流。 2011-08-24 10:40:59
引用回帖:
9楼: Originally posted by 贺仪 at 2011-08-20 21:23:45:
这个怎么用?
Pattern document :选择要的分子?
match property :ElementType?
这个有点不对劲呀 找不到,没任何变化呀……
大侠 麻烦说的详细点

首先在一个新的xsd文件里画出你要替换的分子结构(被替换的那个分子结构),然后
Pattern document :选择刚才新建的那个文件
match property :ElementType
这样就会标示出要替换单元。自动替换貌似没有这样的功能(这样的功能我是不知道)
从明天开始坚持吃早饭呀!
10楼2011-08-21 09:24:39
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