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baiyuefei

版主 (文学泰斗)

[交流] 【求助】怎么算出两个环之间的质心（面心）间的距离？

我有个有机单晶，在分子结构图中，喹啉环合苯环差不多是平行的，虽然有些偏转。

看见文献中经常写 两个环质心间的距离是....
我也想写，但不知道怎么计算出确切的距离，如用Shelx软件该怎么算出来呢？
高手帮帮我吧，写文章用，比较急，先多谢各位了。
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1楼 2011-03-04 17:15:54
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西门吹雪513

木虫 (小有名气)
baiyuefei(金币+5): 2011-03-04 21:15:28
在xp中 在两个环中设两个假原子 link 。。。bang。。
不过 由于经常不完全平行 我们写文章的时候经常算一个面心到另一个平面的距离来代替心心间距
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2楼2011-03-04 20:34:15
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qianbh

至尊木虫 (著名写手)
用Mercury比较容易，但不带误差。用Diamond计算有误差。
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3楼2011-03-04 20:42:29
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baiyuefei

版主 (文学泰斗)
引用回帖:
Originally posted by qianbh at 2011-03-04 20:42:29:
用Mercury比较容易，但不带误差。用Diamond计算有误差。

不会用啊。Mercury怎么用能否说下呢朋友？
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4楼2011-03-04 20:45:19
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qianbh

至尊木虫 (著名写手)
baiyuefei(金币+10): 2011-03-04 21:15:42
安装Mercury程序（免费），打开cif文件，显示结构图，选中环上的各个原子后，点Calculate>Centroids,计算出中心1，再选环2上的原子重复操作得到中心2，再点选中心1和2，进入菜单Display>More informatios>Distances>Centroids,查看
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5楼2011-03-04 20:58:29
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qianbh

至尊木虫 (著名写手)

更正一下

baiyuefei(金币+1): 非常感谢你，请问在shlex里能计算这个吗？ 2011-03-04 21:16:49
baiyuefei(金币+15): 你好，按照您的操作我已经找到，环的中心了，但怎么选择该中心呢？我点击没反应啊？ 2011-03-07 15:27:29
打开cif文件，显示结构图，选中环上的各个原子后，点Calculate>Centroids,计算出中心1，再选环2上的原子重复操作得到中心2，再点选中心1和2，右键单击选Measure>Distances即可，见下图。
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6楼2011-03-04 21:13:03
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baiyuefei

版主 (文学泰斗)
引用回帖:
Originally posted by qianbh at 2011-03-04 21:13:03:
打开cif文件，显示结构图，选中环上的各个原子后，点Calculate>Centroids,计算出中心1，再选环2上的原子重复操作得到中心2，再点选中心1和2，右键单击选Measure>Distances即可，见下图。
[eimg]5f/4f/2455 ...

你好，按照您的操作我已经找到，环的中心了，但怎么选择该中心呢？我点击没反应啊？
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7楼2011-03-07 14:54:08
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baiyuefei

版主 (文学泰斗)
引用回帖:
Originally posted by qianbh at 2011-03-04 21:13:03:
打开cif文件，显示结构图，选中环上的各个原子后，点Calculate>Centroids,计算出中心1，再选环2上的原子重复操作得到中心2，再点选中心1和2，右键单击选Measure>Distances即可，见下图。
[eimg]5f/4f/2455 ...

再点选中心1和2？？我怎么选择不了呢？请高手教教我啊？
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8楼2011-03-07 14:58:35
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qianbh

至尊木虫 (著名写手)
baiyuefei(金币+4): 2011-03-08 07:42:26
先右击，在弹出的菜单中选Measure distance，再选二个中心即可。
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9楼2011-03-07 21:08:07
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baiyuefei

版主 (文学泰斗)
OK已经解决该问题，关贴谢谢
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10楼2011-03-08 07:43:09
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