版块导航
正在加载中...
客户端APP下载
论文辅导
申博辅导
登录
注册
帖子
帖子
用户
本版
应《网络安全法》要求,自2017年10月1日起,未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用,请尽快对帐号进行手机号验证,感谢您的理解与支持!
24小时热门版块排行榜
>
论坛更新日志
(2958)
>
虫友互识
(278)
>
文献求助
(172)
>
导师招生
(113)
>
硕博家园
(87)
>
论文道贺祈福
(72)
>
考博
(62)
>
博后之家
(47)
>
考研
(39)
>
招聘信息布告栏
(36)
>
教师之家
(33)
>
基金申请
(31)
>
休闲灌水
(28)
>
绿色求助(高悬赏)
(27)
>
公派出国
(23)
>
找工作
(22)
小木虫论坛-学术科研互动平台
»
计算模拟区
»
分子模拟
»
DS/Sybyl/Autodock
»
autodock vina里box参数一定。结果为什么会有几个在box外面了。给配体加电荷怎么是0.0
3
1/1
返回列表
查看: 1346 | 回复: 2
只看楼主
@他人
存档
新回复提醒
(忽略)
收藏
在APP中查看
fan728516414
银虫
(小有名气)
应助: 4
(幼儿园)
金币: 466.3
散金: 20
红花: 20
帖子: 221
在线: 53.3小时
虫号: 3101326
注册: 2014-03-30
性别: GG
专业: 合成药物化学
[
求助
]
autodock vina里box参数一定。结果为什么会有几个在box外面了。给配体加电荷怎么是0.0
为什么这样,不是都应该在box里面完成吗。还有给配体加完氢后计算电荷为什么是0.0.是计算电荷还是加电荷。加电荷我应该就明白了。我的配体是用chemoffice 3D做的,然后计算了他的最优结构和电荷,保存pbd格式。
ps:有会用pyrx批量对接和虚拟筛选的吗?里面的box参数怎么手动改掉。window下操作。
回复此楼
» 猜你喜欢
依托企业入选了国家启明计划青年人才。有无高校可以引进的。
已经有5人回复
博士延得我,科研能力直往上蹿
已经有9人回复
遇见不省心的家人很难过
已经有23人回复
天津大学招2026.09的博士生,欢迎大家推荐交流(博导是本人)
已经有6人回复
AI 太可怕了,写基金时,提出想法,直接生成的文字比自己想得深远,还有科学性
已经有6人回复
有院领导为了换新车,用横向课题经费买了俩车
已经有9人回复
酰胺脱乙酰基
已经有13人回复
同年申请2项不同项目,第1个项目里不写第2个项目的信息,可以吗
已经有4人回复
有时候真觉得大城市人没有县城人甚至个体户幸福
已经有10人回复
» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:
pyrx在运行 Run Autogrid 时出现了错误,怎么处理这个问题。
已经有4人回复
autodock vina conf.txt 编写求助
已经有5人回复
autodock柔性对接缺少MAP文件相关问题
已经有8人回复
autodock对接前配体分子结构的优化方法
已经有4人回复
关于autodock vina对接的conf.txt写法
已经有4人回复
autodock对接的氢键
已经有7人回复
最近在研究autodock.....怎能弄都搞不出来,求大神看看什么原因
已经有21人回复
AutoDock、Vina使用中的一些问题
已经有4人回复
AutoDock怎么分析大分子与小分子之间的结合能
已经有7人回复
用autodock对接,用什么软件定点突变蛋白质
已经有14人回复
Autodock中受体的准备
已经有14人回复
autodock vina操作视频,以及视频中更新问题
已经有95人回复
Autodock时 gridbox的参数怎么设置??
已经有18人回复
【求助】autodock vina 输入命令报无法读取
已经有8人回复
【其他】autodock 保存文件
已经有14人回复
【求助】能够计算结合自由能的分子对接软件除了autodock还有哪些?
已经有7人回复
【分享】非常好的 Autodock/Vina plugin for PyMOL
已经有8人回复
【资源】PyRx-基于autodock的虚拟筛选软件
已经有31人回复
tooyoungtoosimple
1楼
2015-04-14 15:03:04
已阅
关注TA
给TA发消息
送TA红花
TA的回帖
蓝洋飘雪
木虫
(小有名气)
应助: 0
(幼儿园)
金币: 2455.2
散金: 14
红花: 3
帖子: 230
在线: 41.3小时
虫号: 3581025
注册: 2014-12-07
性别:
MM
专业: 兽医药理学与毒理学
请问chemoffice 3D是分子画图软件吗?我正在找分子画图软件,请问您能提供给我一份吗?非常感谢了
赞
一下
回复此楼
人生如茶,不会苦一辈子,但会苦一阵子!
2楼
2015-04-17 13:20:36
已阅
关注TA
给TA发消息
送TA红花
TA的回帖
fan728516414
银虫
(小有名气)
应助: 4
(幼儿园)
金币: 466.3
散金: 20
红花: 20
帖子: 221
在线: 53.3小时
虫号: 3101326
注册: 2014-03-30
性别: GG
专业: 合成药物化学
引用回帖:
2楼
:
Originally posted by
蓝洋飘雪
at 2015-04-17 13:20:36
请问chemoffice 3D是分子画图软件吗?我正在找分子画图软件,请问您能提供给我一份吗?非常感谢了
http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=8302235
赞
一下
回复此楼
tooyoungtoosimple
3楼
2015-04-17 16:34:22
已阅
关注TA
给TA发消息
送TA红花
TA的回帖
相关版块跳转
第一性原理
量子化学
计算模拟
分子模拟
仿真模拟
程序语言
我要订阅楼主
fan728516414
的主题更新
3
1/1
返回列表
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭
确定